Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EK87

Protein Details
Accession R1EK87    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-125LYSARQPPPRERRDERKPVKTGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
517-530KKPEGEGKPNGAKH
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, mito 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG npa:UCRNP2_5014  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTSLPRDRPAHQPSAPGFGQTPDPWASLSSQGARGDDDDALNFDDTYDGLGDQLDETDDAFNDDTFGGEPVQNVGKDFDFSGQTAKIAGTISEEQMLYSARQPPPRERRDERKPVKTGYENYAQPGYIGNLEASADIWGIPKKSTPSQENQRQQVSMQQMQQMQQMQQQQQSHHQASASRKMMSLEEVEAAMLAQSKQRAPQHPGQPPATQPTPQPAMPGFPQQPPPNWGQQPFGAPPQILQRPQQFNQQFLQQRPPSIPQQQMPHELPAQSIQQPQILQRQRQEQQGPRGTPPQQPRHILQNPNRLSGQGQPISQPFNRMPPTGPAHARGPSYQGQVITHPEQLLRLTDAERAAFLEEDAKRAKRIHKIHMLSKDNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVTATGSVDDQGPEAALAEDFYYQVFSQIRGAPRQNPHQPANQFAQTYLFQTGGRYGGRRNNRGGDNHAQRMEQQVQRAVEAAKAKPKNKQLVIEGSLGKISFSNAKTPKPLLNIKKPEGEGKPNGAKHHPRAHHDVADRKATLRNIESVYNVLMRMEDHERNMPPPLNDGSSPAQIQEHMEWQHRAQELNQNLWQGLKVMEPIMPGSNVPHPFIAILSHPKGKKAIPRIFRHLDEQQRVTILTMIVVHLDTLDVVQNGIPADPLTPLPRAAKDEIELFAHAVMPPLFAYVNEAPLNIVIGLLGLVLDRTNIPVLVRTKIGLSILTIFVSRAELVKESTPSSAATTQDLQQIEQLYNRLFDAVEPVLPYIFPGTVKDDEDIYVWQFLASMGASASAEQQQRLVIGVKDRVMDTVNMCKALPKELSATRLGHVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.5
4 0.47
5 0.54
6 0.52
7 0.56
8 0.52
9 0.44
10 0.38
11 0.31
12 0.34
13 0.26
14 0.28
15 0.23
16 0.24
17 0.22
18 0.22
19 0.23
20 0.21
21 0.25
22 0.24
23 0.26
24 0.27
25 0.28
26 0.28
27 0.27
28 0.25
29 0.23
30 0.2
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.16
35 0.15
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.16
73 0.16
74 0.19
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.15
85 0.17
86 0.17
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.13
91 0.16
92 0.23
93 0.25
94 0.32
95 0.37
96 0.47
97 0.56
98 0.63
99 0.69
100 0.7
101 0.75
102 0.8
103 0.87
104 0.86
105 0.85
106 0.82
107 0.78
108 0.78
109 0.75
110 0.69
111 0.64
112 0.62
113 0.53
114 0.51
115 0.47
116 0.38
117 0.31
118 0.27
119 0.22
120 0.15
121 0.14
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.08
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.18
136 0.24
137 0.32
138 0.35
139 0.43
140 0.53
141 0.63
142 0.69
143 0.71
144 0.68
145 0.62
146 0.56
147 0.53
148 0.5
149 0.45
150 0.39
151 0.38
152 0.37
153 0.37
154 0.41
155 0.37
156 0.31
157 0.31
158 0.34
159 0.33
160 0.36
161 0.38
162 0.36
163 0.42
164 0.49
165 0.46
166 0.4
167 0.38
168 0.38
169 0.41
170 0.47
171 0.42
172 0.34
173 0.33
174 0.33
175 0.33
176 0.3
177 0.25
178 0.17
179 0.14
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.09
189 0.11
190 0.17
191 0.24
192 0.29
193 0.35
194 0.44
195 0.51
196 0.56
197 0.62
198 0.59
199 0.55
200 0.52
201 0.52
202 0.46
203 0.37
204 0.31
205 0.32
206 0.32
207 0.29
208 0.29
209 0.23
210 0.24
211 0.25
212 0.31
213 0.27
214 0.27
215 0.34
216 0.34
217 0.37
218 0.37
219 0.38
220 0.39
221 0.4
222 0.39
223 0.35
224 0.34
225 0.35
226 0.34
227 0.33
228 0.26
229 0.22
230 0.22
231 0.27
232 0.3
233 0.27
234 0.3
235 0.36
236 0.41
237 0.43
238 0.51
239 0.45
240 0.43
241 0.43
242 0.47
243 0.43
244 0.39
245 0.47
246 0.39
247 0.39
248 0.39
249 0.41
250 0.4
251 0.4
252 0.42
253 0.37
254 0.42
255 0.44
256 0.48
257 0.45
258 0.42
259 0.37
260 0.33
261 0.29
262 0.25
263 0.24
264 0.2
265 0.2
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.21
270 0.28
271 0.31
272 0.32
273 0.34
274 0.42
275 0.43
276 0.5
277 0.55
278 0.52
279 0.56
280 0.6
281 0.58
282 0.53
283 0.55
284 0.51
285 0.51
286 0.53
287 0.53
288 0.51
289 0.52
290 0.51
291 0.55
292 0.59
293 0.6
294 0.59
295 0.6
296 0.57
297 0.56
298 0.54
299 0.44
300 0.38
301 0.34
302 0.34
303 0.26
304 0.24
305 0.23
306 0.25
307 0.29
308 0.28
309 0.27
310 0.2
311 0.25
312 0.26
313 0.26
314 0.25
315 0.27
316 0.31
317 0.32
318 0.33
319 0.29
320 0.29
321 0.31
322 0.3
323 0.25
324 0.25
325 0.23
326 0.24
327 0.22
328 0.2
329 0.19
330 0.19
331 0.23
332 0.21
333 0.19
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.14
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.16
354 0.16
355 0.17
356 0.21
357 0.26
358 0.29
359 0.35
360 0.4
361 0.47
362 0.51
363 0.55
364 0.62
365 0.61
366 0.53
367 0.49
368 0.44
369 0.34
370 0.3
371 0.24
372 0.16
373 0.12
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.17
379 0.18
380 0.18
381 0.19
382 0.2
383 0.22
384 0.22
385 0.25
386 0.24
387 0.24
388 0.23
389 0.21
390 0.15
391 0.13
392 0.1
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.04
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.1
416 0.13
417 0.15
418 0.18
419 0.2
420 0.24
421 0.27
422 0.35
423 0.39
424 0.41
425 0.42
426 0.45
427 0.44
428 0.42
429 0.41
430 0.36
431 0.3
432 0.24
433 0.25
434 0.18
435 0.19
436 0.16
437 0.13
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.12
445 0.18
446 0.25
447 0.29
448 0.31
449 0.34
450 0.37
451 0.38
452 0.42
453 0.44
454 0.43
455 0.43
456 0.42
457 0.36
458 0.33
459 0.36
460 0.36
461 0.29
462 0.25
463 0.25
464 0.24
465 0.24
466 0.25
467 0.2
468 0.17
469 0.18
470 0.18
471 0.22
472 0.27
473 0.29
474 0.34
475 0.41
476 0.46
477 0.45
478 0.48
479 0.44
480 0.45
481 0.46
482 0.43
483 0.37
484 0.29
485 0.27
486 0.22
487 0.19
488 0.12
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.2
493 0.22
494 0.24
495 0.27
496 0.29
497 0.31
498 0.32
499 0.39
500 0.39
501 0.47
502 0.52
503 0.52
504 0.55
505 0.53
506 0.53
507 0.49
508 0.47
509 0.39
510 0.38
511 0.42
512 0.4
513 0.41
514 0.42
515 0.44
516 0.44
517 0.51
518 0.49
519 0.48
520 0.53
521 0.55
522 0.54
523 0.53
524 0.54
525 0.48
526 0.48
527 0.43
528 0.37
529 0.36
530 0.31
531 0.3
532 0.24
533 0.24
534 0.21
535 0.22
536 0.21
537 0.18
538 0.18
539 0.16
540 0.14
541 0.1
542 0.08
543 0.08
544 0.1
545 0.14
546 0.15
547 0.16
548 0.21
549 0.21
550 0.23
551 0.26
552 0.25
553 0.2
554 0.23
555 0.23
556 0.2
557 0.2
558 0.22
559 0.22
560 0.21
561 0.21
562 0.18
563 0.16
564 0.15
565 0.16
566 0.14
567 0.16
568 0.17
569 0.2
570 0.21
571 0.21
572 0.26
573 0.25
574 0.25
575 0.22
576 0.28
577 0.27
578 0.31
579 0.33
580 0.27
581 0.26
582 0.26
583 0.24
584 0.16
585 0.14
586 0.1
587 0.09
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.09
595 0.11
596 0.16
597 0.17
598 0.18
599 0.17
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.15
604 0.11
605 0.16
606 0.18
607 0.25
608 0.25
609 0.26
610 0.29
611 0.31
612 0.36
613 0.4
614 0.46
615 0.49
616 0.55
617 0.62
618 0.66
619 0.64
620 0.63
621 0.6
622 0.61
623 0.58
624 0.53
625 0.45
626 0.4
627 0.38
628 0.33
629 0.27
630 0.17
631 0.12
632 0.1
633 0.09
634 0.09
635 0.08
636 0.07
637 0.05
638 0.05
639 0.04
640 0.05
641 0.06
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.07
646 0.08
647 0.08
648 0.07
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.09
653 0.1
654 0.11
655 0.13
656 0.16
657 0.18
658 0.22
659 0.23
660 0.24
661 0.23
662 0.25
663 0.24
664 0.23
665 0.21
666 0.16
667 0.14
668 0.13
669 0.12
670 0.11
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.08
677 0.14
678 0.13
679 0.17
680 0.17
681 0.17
682 0.16
683 0.16
684 0.17
685 0.1
686 0.09
687 0.05
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.03
693 0.03
694 0.03
695 0.04
696 0.04
697 0.06
698 0.07
699 0.07
700 0.08
701 0.14
702 0.16
703 0.18
704 0.19
705 0.18
706 0.18
707 0.19
708 0.2
709 0.14
710 0.13
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.13
715 0.12
716 0.11
717 0.12
718 0.11
719 0.09
720 0.1
721 0.11
722 0.13
723 0.16
724 0.18
725 0.18
726 0.19
727 0.19
728 0.18
729 0.21
730 0.21
731 0.19
732 0.21
733 0.22
734 0.23
735 0.27
736 0.27
737 0.23
738 0.23
739 0.24
740 0.22
741 0.22
742 0.23
743 0.18
744 0.19
745 0.18
746 0.16
747 0.14
748 0.13
749 0.16
750 0.14
751 0.14
752 0.14
753 0.15
754 0.14
755 0.14
756 0.14
757 0.11
758 0.1
759 0.1
760 0.11
761 0.16
762 0.18
763 0.2
764 0.21
765 0.2
766 0.2
767 0.21
768 0.2
769 0.17
770 0.15
771 0.14
772 0.12
773 0.12
774 0.11
775 0.11
776 0.09
777 0.07
778 0.06
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.1
783 0.14
784 0.16
785 0.16
786 0.17
787 0.17
788 0.17
789 0.19
790 0.19
791 0.16
792 0.2
793 0.24
794 0.26
795 0.27
796 0.27
797 0.27
798 0.26
799 0.26
800 0.23
801 0.28
802 0.29
803 0.28
804 0.27
805 0.3
806 0.29
807 0.33
808 0.31
809 0.25
810 0.29
811 0.31
812 0.36
813 0.36
814 0.37
815 0.32
816 0.35
817 0.34
818 0.29
819 0.29
820 0.27
821 0.25
822 0.24
823 0.22
824 0.17
825 0.16
826 0.15
827 0.12
828 0.09