Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EMH2

Protein Details
Accession R1EMH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-104EEKPAKKQKKDGQKGKAAAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-101KPAKKQKKDGQKGKA
425-442KRKKPAAAPAAGGAGKAK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.333, cyto 11.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG npa:UCRNP2_4481  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSTEAIPEEPSTGRLEELLAAANLQYSLKNYNGAADIYSEAAQVQEQLNGEMAPENADLLFRYGRCLYKVAIAKSDVLGGRVAAEEKPAKKQKKDGQKGKAAAEALPSKEEKLAEEVVEAAVEERDGVKPDAKEPTVESKPFFQIVGDENWDTESEEEGDEEEEGADDPEDDLATAYEILDVARVLLSRQLEALQNSVRDTSESGKGKAPAKELDPEERKVLEKLADTQDLQAEIGLENENFVDAVSDFRAALGLKEKYLPKESSLIAEAHYKLSLALEFQSMTKVREAQAQAEASGGKVNPDEAKVDEAMREEAAKEMEKAIESCRLRVSKEESDLSTLPADKVEDAKAQITDVKEMIEDMEARLTDLRGPAISLSAPTNPAGADPSNPLSGILGELLGQAPAEEREEQKKKIEAASDISGLVKRKKPAAAPAAGGAGKAKSDNNGLKASSTSAGSKRKSEAPEDEFVEKKAKVEDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.11
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.13
15 0.14
16 0.17
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.16
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.11
47 0.14
48 0.12
49 0.16
50 0.19
51 0.22
52 0.23
53 0.25
54 0.23
55 0.28
56 0.35
57 0.33
58 0.34
59 0.33
60 0.32
61 0.31
62 0.34
63 0.27
64 0.21
65 0.19
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.09
71 0.13
72 0.18
73 0.2
74 0.3
75 0.39
76 0.45
77 0.49
78 0.59
79 0.63
80 0.68
81 0.77
82 0.78
83 0.78
84 0.8
85 0.8
86 0.73
87 0.68
88 0.58
89 0.48
90 0.43
91 0.38
92 0.3
93 0.27
94 0.25
95 0.22
96 0.23
97 0.23
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.07
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.09
114 0.1
115 0.14
116 0.14
117 0.18
118 0.24
119 0.23
120 0.23
121 0.24
122 0.32
123 0.33
124 0.34
125 0.33
126 0.3
127 0.32
128 0.32
129 0.29
130 0.2
131 0.17
132 0.18
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.14
140 0.12
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.11
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.18
190 0.19
191 0.21
192 0.23
193 0.27
194 0.3
195 0.32
196 0.32
197 0.26
198 0.26
199 0.3
200 0.29
201 0.34
202 0.33
203 0.32
204 0.31
205 0.3
206 0.29
207 0.24
208 0.23
209 0.17
210 0.14
211 0.17
212 0.18
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.17
217 0.15
218 0.14
219 0.1
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.14
244 0.16
245 0.18
246 0.22
247 0.23
248 0.19
249 0.22
250 0.22
251 0.2
252 0.21
253 0.18
254 0.15
255 0.17
256 0.16
257 0.14
258 0.13
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.19
275 0.2
276 0.19
277 0.22
278 0.21
279 0.2
280 0.19
281 0.18
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.1
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.18
311 0.18
312 0.19
313 0.24
314 0.25
315 0.25
316 0.29
317 0.34
318 0.32
319 0.36
320 0.37
321 0.32
322 0.36
323 0.35
324 0.32
325 0.26
326 0.22
327 0.17
328 0.15
329 0.15
330 0.11
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.14
342 0.13
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.14
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.14
379 0.13
380 0.12
381 0.09
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.09
392 0.11
393 0.14
394 0.24
395 0.3
396 0.33
397 0.38
398 0.42
399 0.42
400 0.44
401 0.45
402 0.38
403 0.38
404 0.39
405 0.35
406 0.3
407 0.29
408 0.27
409 0.27
410 0.31
411 0.31
412 0.31
413 0.35
414 0.4
415 0.43
416 0.49
417 0.54
418 0.51
419 0.48
420 0.46
421 0.45
422 0.4
423 0.36
424 0.28
425 0.2
426 0.16
427 0.16
428 0.15
429 0.13
430 0.21
431 0.27
432 0.3
433 0.33
434 0.33
435 0.32
436 0.32
437 0.32
438 0.26
439 0.23
440 0.24
441 0.28
442 0.36
443 0.38
444 0.41
445 0.43
446 0.48
447 0.51
448 0.53
449 0.55
450 0.52
451 0.55
452 0.56
453 0.56
454 0.5
455 0.47
456 0.46
457 0.37
458 0.33