Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GVJ3

Protein Details
Accession R1GVJ3    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-72QTAASNTQSKTKKRKRGQNTTAATVDHydrophilic
147-176QEAEEKAAKRKSKKRKKEQAQEPAQKKNKVBasic
528-554LDALPTPSKRDKKELKRRGVEARRAGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-60KR
152-167KAAKRKSKKRKKEQAQ
535-594SKRDKKELKRRGVEARRAGVERQEGRGRWRTTISTKSGYERKVEHNRKAAVEASRRRGEK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG npa:UCRNP2_823  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDFLKLLSRGTNVAKGATRNAPAAKTPSSGANLNPQLFGRDTPQIEQTAASNTQSKTKKRKRGQNTTAATVDLPPELDFFGDAKREDKDAESQGAAADTEQGKSRDTEKETEGEIVGGEQPVTEEDCKRILRSHKVKITLLEDYRAQEAEEKAAKRKSKKRKKEQAQEPAQKKNKVQLFPQPLTSFGQLRSRFNISRKLAENINAQGYTMPTEVQLSSLPLLVEASGPESNGIDLLTVAPTGSGKTLAFLIPVIESLLRRPVKYLVLDEADVLLDPLFRQQTLDIWNACTSPLLRVSLWSATMGSNIEELAKNTITSRWNSIEVPDATRPNLVRLIVGLKDSAVPNIDHQLTYAATEQGKLLAVRQLLHPTTSKRDNTTPTLRPPFLIFTQTIPRAQALYSELQYDIPPEAGGSSRIAVLHSSLSSSLRDNVMARFRRGEVWVLITTDLLARGVDFRGINGVVNYDVPTSGAAYVHRAGRTGRAGREGGVAVTLYTEEDVPYIRNIANVIRASEALRGEERTVKQWLLDALPTPSKRDKKELKRRGVEARRAGVERQEGRGRWRTTISTKSGYERKVEHNRKAAVEASRRRGEKVGGGDKGGESEGEFGGFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.36
4 0.37
5 0.36
6 0.35
7 0.38
8 0.36
9 0.37
10 0.39
11 0.37
12 0.33
13 0.32
14 0.31
15 0.32
16 0.32
17 0.29
18 0.34
19 0.38
20 0.37
21 0.37
22 0.33
23 0.32
24 0.31
25 0.31
26 0.26
27 0.26
28 0.27
29 0.28
30 0.32
31 0.3
32 0.29
33 0.28
34 0.25
35 0.23
36 0.23
37 0.22
38 0.24
39 0.23
40 0.32
41 0.39
42 0.47
43 0.52
44 0.61
45 0.7
46 0.74
47 0.85
48 0.87
49 0.91
50 0.91
51 0.91
52 0.86
53 0.82
54 0.73
55 0.63
56 0.52
57 0.42
58 0.33
59 0.23
60 0.18
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.2
75 0.24
76 0.25
77 0.27
78 0.26
79 0.24
80 0.23
81 0.22
82 0.19
83 0.13
84 0.14
85 0.11
86 0.12
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.19
91 0.23
92 0.25
93 0.28
94 0.32
95 0.3
96 0.32
97 0.33
98 0.33
99 0.29
100 0.22
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.1
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.18
114 0.2
115 0.21
116 0.27
117 0.31
118 0.4
119 0.48
120 0.56
121 0.57
122 0.62
123 0.62
124 0.61
125 0.58
126 0.54
127 0.47
128 0.4
129 0.35
130 0.31
131 0.31
132 0.26
133 0.22
134 0.19
135 0.18
136 0.21
137 0.24
138 0.25
139 0.29
140 0.36
141 0.41
142 0.47
143 0.56
144 0.62
145 0.68
146 0.77
147 0.83
148 0.87
149 0.92
150 0.94
151 0.95
152 0.94
153 0.94
154 0.93
155 0.88
156 0.87
157 0.83
158 0.77
159 0.67
160 0.64
161 0.6
162 0.54
163 0.51
164 0.51
165 0.53
166 0.49
167 0.54
168 0.46
169 0.41
170 0.41
171 0.39
172 0.31
173 0.24
174 0.31
175 0.28
176 0.3
177 0.32
178 0.35
179 0.36
180 0.38
181 0.45
182 0.4
183 0.44
184 0.44
185 0.43
186 0.39
187 0.39
188 0.39
189 0.32
190 0.32
191 0.25
192 0.22
193 0.2
194 0.18
195 0.16
196 0.12
197 0.1
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.16
248 0.18
249 0.2
250 0.22
251 0.23
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.17
256 0.14
257 0.11
258 0.1
259 0.08
260 0.05
261 0.04
262 0.03
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.09
269 0.12
270 0.15
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.13
277 0.1
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.16
305 0.16
306 0.18
307 0.18
308 0.18
309 0.21
310 0.2
311 0.22
312 0.21
313 0.2
314 0.19
315 0.21
316 0.2
317 0.16
318 0.17
319 0.14
320 0.11
321 0.11
322 0.13
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.12
334 0.12
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.1
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.12
353 0.16
354 0.15
355 0.17
356 0.19
357 0.18
358 0.24
359 0.29
360 0.3
361 0.29
362 0.34
363 0.37
364 0.41
365 0.46
366 0.45
367 0.47
368 0.51
369 0.48
370 0.44
371 0.41
372 0.38
373 0.32
374 0.29
375 0.22
376 0.18
377 0.24
378 0.25
379 0.24
380 0.21
381 0.2
382 0.18
383 0.17
384 0.16
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.11
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.17
419 0.25
420 0.27
421 0.28
422 0.28
423 0.29
424 0.3
425 0.3
426 0.3
427 0.22
428 0.23
429 0.23
430 0.21
431 0.2
432 0.17
433 0.15
434 0.13
435 0.11
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.09
450 0.1
451 0.11
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.11
461 0.13
462 0.17
463 0.17
464 0.17
465 0.17
466 0.22
467 0.29
468 0.31
469 0.31
470 0.32
471 0.32
472 0.32
473 0.34
474 0.29
475 0.22
476 0.17
477 0.15
478 0.1
479 0.09
480 0.08
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.11
493 0.13
494 0.18
495 0.18
496 0.19
497 0.18
498 0.19
499 0.19
500 0.21
501 0.21
502 0.17
503 0.18
504 0.18
505 0.2
506 0.26
507 0.26
508 0.27
509 0.3
510 0.27
511 0.26
512 0.27
513 0.27
514 0.22
515 0.22
516 0.2
517 0.21
518 0.28
519 0.29
520 0.32
521 0.39
522 0.44
523 0.46
524 0.55
525 0.61
526 0.65
527 0.76
528 0.81
529 0.82
530 0.83
531 0.86
532 0.87
533 0.86
534 0.84
535 0.81
536 0.77
537 0.72
538 0.66
539 0.6
540 0.55
541 0.54
542 0.47
543 0.46
544 0.47
545 0.43
546 0.48
547 0.56
548 0.53
549 0.48
550 0.49
551 0.49
552 0.49
553 0.55
554 0.54
555 0.52
556 0.52
557 0.56
558 0.59
559 0.55
560 0.53
561 0.5
562 0.53
563 0.58
564 0.65
565 0.66
566 0.67
567 0.69
568 0.66
569 0.65
570 0.6
571 0.58
572 0.59
573 0.59
574 0.59
575 0.62
576 0.61
577 0.6
578 0.58
579 0.52
580 0.49
581 0.5
582 0.5
583 0.44
584 0.44
585 0.43
586 0.4
587 0.38
588 0.31
589 0.22
590 0.13
591 0.13
592 0.12
593 0.11