Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R1GJ49

Protein Details
Accession R1GJ49    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-408ALKNRFKHMPEIKRISRHRHVPKTIKKAGEIBasic
410-444GEEIKSIKRKEENERRHTRKGEMRRRSEREKMIMABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-438KNRFKHMPEIKRISRHRHVPKTIKKAGEIKGEEIKSIKRKEENERRHTRKGEMRRRSER
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 10.333, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG npa:UCRNP2_7298  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKIKALSRSASDYQAPGTNVARTPRNLDPALHPFERAREYTRALNATKMERMFAQPFLAQLGKGHIDGVYSIAKDPESLQHFASGSGDGVVKVWDLTSQDEMFQASAHENLVRGLTWSRDRKILSCGADKTVKMFDPYQTTSGSPPVATWLGQGAFTSITHHRSDPAIAVSSNSQISIYDTTRPASNPSQTLAWPTAIDTINAVSFNQTETSILASAASDRSIVMYDLRTSSPLHKVVLTLAANAIAWNPTEAFNFACGSEDHNIYIFDMRNMKRSLNVLKDHVAAVMDVDWSPTGEELVSASYDRSIRLWNRGQGHSRDIYHTKRMQRVFSCAWSPDNNYILSGSDDGNVRLWRAKASARQGVKSARERQKLEYDEALKNRFKHMPEIKRISRHRHVPKTIKKAGEIKGEEIKSIKRKEENERRHTRKGEMRRRSEREKMIMATEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.29
4 0.27
5 0.27
6 0.28
7 0.32
8 0.34
9 0.32
10 0.37
11 0.39
12 0.44
13 0.42
14 0.41
15 0.44
16 0.46
17 0.51
18 0.46
19 0.43
20 0.37
21 0.4
22 0.43
23 0.38
24 0.35
25 0.33
26 0.37
27 0.41
28 0.45
29 0.46
30 0.42
31 0.44
32 0.43
33 0.42
34 0.43
35 0.38
36 0.33
37 0.29
38 0.34
39 0.32
40 0.29
41 0.27
42 0.22
43 0.22
44 0.24
45 0.23
46 0.17
47 0.15
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.13
57 0.11
58 0.12
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.18
64 0.2
65 0.21
66 0.21
67 0.24
68 0.24
69 0.24
70 0.24
71 0.17
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.1
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.13
103 0.2
104 0.26
105 0.27
106 0.32
107 0.33
108 0.33
109 0.38
110 0.4
111 0.36
112 0.37
113 0.37
114 0.36
115 0.38
116 0.36
117 0.33
118 0.3
119 0.27
120 0.24
121 0.23
122 0.22
123 0.25
124 0.27
125 0.27
126 0.24
127 0.24
128 0.23
129 0.24
130 0.21
131 0.14
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.11
145 0.11
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.18
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.13
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.17
171 0.19
172 0.19
173 0.21
174 0.19
175 0.2
176 0.2
177 0.19
178 0.22
179 0.19
180 0.16
181 0.13
182 0.12
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.12
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.15
223 0.16
224 0.15
225 0.19
226 0.17
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.14
254 0.11
255 0.11
256 0.17
257 0.18
258 0.23
259 0.24
260 0.24
261 0.24
262 0.27
263 0.31
264 0.31
265 0.33
266 0.3
267 0.31
268 0.32
269 0.29
270 0.26
271 0.2
272 0.13
273 0.11
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.15
295 0.17
296 0.24
297 0.29
298 0.33
299 0.39
300 0.44
301 0.49
302 0.46
303 0.48
304 0.45
305 0.41
306 0.41
307 0.41
308 0.4
309 0.43
310 0.46
311 0.48
312 0.51
313 0.53
314 0.55
315 0.52
316 0.55
317 0.5
318 0.48
319 0.45
320 0.39
321 0.39
322 0.35
323 0.36
324 0.33
325 0.31
326 0.27
327 0.24
328 0.23
329 0.2
330 0.18
331 0.16
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.19
343 0.24
344 0.27
345 0.35
346 0.42
347 0.42
348 0.44
349 0.47
350 0.51
351 0.53
352 0.55
353 0.58
354 0.59
355 0.63
356 0.64
357 0.65
358 0.68
359 0.65
360 0.61
361 0.58
362 0.54
363 0.52
364 0.55
365 0.55
366 0.5
367 0.48
368 0.49
369 0.46
370 0.43
371 0.46
372 0.51
373 0.55
374 0.6
375 0.69
376 0.7
377 0.75
378 0.8
379 0.79
380 0.78
381 0.79
382 0.8
383 0.8
384 0.84
385 0.85
386 0.87
387 0.88
388 0.87
389 0.8
390 0.76
391 0.74
392 0.7
393 0.69
394 0.62
395 0.56
396 0.57
397 0.54
398 0.49
399 0.44
400 0.45
401 0.44
402 0.46
403 0.48
404 0.47
405 0.54
406 0.63
407 0.72
408 0.75
409 0.77
410 0.83
411 0.84
412 0.86
413 0.83
414 0.81
415 0.8
416 0.81
417 0.81
418 0.8
419 0.83
420 0.84
421 0.88
422 0.87
423 0.87
424 0.84
425 0.81
426 0.77
427 0.69