FuNGI

R1GEX8

Protein Details

Accession

R1GEX8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
718-737	MLPADRRKAREQEQRAKQFR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
800-821	RSPPGLPSKKGRLSAAKGRPGK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
KEGG	npa:UCRNP2_6455 -
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54
CDD	cd22249 UDM1_RNF168_RNF169-like

Amino Acid Sequences

MDGYLNKPVPEIPAHNSHLQEELMQSLDMSSLLGQAVDAAQNQITKILKVRGDQSIRLPLQRFLRYFLINRLFADEYSQIKQFVTTMGQMENQKLRQTMDADKWEAKDFGDHENEVLTRILEAMNSDPAVWVKSKMIWEDLATTPTNDANGTNGEANGAGKTRNAVIDEEKYVLVNCAMYALDGIDRFENLIAVIPSITSEVAVTLLDYLRTFQSRTCQLILGAGAKESAGLKSITTKHLALASQALNFIIALIPYIREFIRRHSSNTSLAELDKMRRLYQDQQTNIHEKLIEIMTQRLHIHVNAMKKIDFDAVAQQQTSAHMETLTKETNTFHRTLSRHLPEPSVKSIIMPVFTSYREQWGKAFREALVRTGAGKARLLRDAELFESKLNKIDGFGDIGTYVTDIVKEKVVEAGATTGSTSSPSAITEHARQSFTSFPSTRALRILSMDARKGFLPVTPACSVRPTLSQSNANVTQDIVASAPNPKGHRRTLSKVDSIRDGLRRYVLSAPCEPTAQNDWSVDRHPGAPFSSEAPFTLYRATPSSPASSASSHASSRSRDELRADIQRIIPPASVPAASYRITNAPFWPKTSTLSKPGGGHSRNSSRSSTSTHGSSAISVVPELTPSKSDGAFDTVSTRKSFAPAGEDERLYGPLVDENCFDFDEEIQVPEVTWSTTTKDDPFLLNNVLDKANQVWSGDASLVDDKAFIRGNGFTQPMLPADRRKAREQEQRAKQFRLQREKQEEELRWQELKRQAVEYQIHRDAVKAEMKAAQEAHPKISTPPGLPSMRRTISSNKEIRSPPGLPSKKGRLSAAKGRPGKSSIGQQLIPQDNIIEEKINTETQRESNASVKLTPIIDAQFPFESKDNDAIATPFADIDQVTDLTPIIDSLFPCEAKTDNDNEVNSSIHLPPVNDNTNEVISPLWLSGNAYSDYNSESDSDDEVDGCAIESYSTVCPTTRRRRYS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.43
3	0.43
4	0.4
5	0.38
6	0.34
7	0.3
8	0.23
9	0.2
10	0.17
11	0.15
12	0.13
13	0.11
14	0.11
15	0.09
16	0.08
17	0.07
18	0.06
19	0.07
20	0.06
21	0.06
22	0.06
23	0.07
24	0.08
25	0.09
26	0.09
27	0.11
28	0.12
29	0.12
30	0.16
31	0.17
32	0.17
33	0.22
34	0.27
35	0.29
36	0.31
37	0.36
38	0.41
39	0.45
40	0.47
41	0.47
42	0.51
43	0.5
44	0.53
45	0.5
46	0.46
47	0.49
48	0.53
49	0.49
50	0.44
51	0.47
52	0.45
53	0.46
54	0.5
55	0.49
56	0.43
57	0.43
58	0.43
59	0.38
60	0.34
61	0.35
62	0.3
63	0.26
64	0.28
65	0.29
66	0.24
67	0.23
68	0.23
69	0.19
70	0.18
71	0.17
72	0.16
73	0.17
74	0.18
75	0.22
76	0.24
77	0.29
78	0.33
79	0.32
80	0.34
81	0.33
82	0.33
83	0.33
84	0.35
85	0.37
86	0.38
87	0.42
88	0.43
89	0.45
90	0.45
91	0.44
92	0.4
93	0.33
94	0.3
95	0.26
96	0.28
97	0.29
98	0.27
99	0.24
100	0.26
101	0.26
102	0.22
103	0.21
104	0.14
105	0.1
106	0.1
107	0.1
108	0.08
109	0.09
110	0.1
111	0.12
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.13
116	0.14
117	0.14
118	0.14
119	0.13
120	0.17
121	0.2
122	0.21
123	0.23
124	0.22
125	0.22
126	0.25
127	0.25
128	0.25
129	0.22
130	0.21
131	0.19
132	0.18
133	0.18
134	0.13
135	0.12
136	0.11
137	0.12
138	0.13
139	0.13
140	0.12
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.11
145	0.11
146	0.09
147	0.08
148	0.1
149	0.11
150	0.13
151	0.14
152	0.15
153	0.19
154	0.22
155	0.24
156	0.24
157	0.23
158	0.21
159	0.2
160	0.18
161	0.14
162	0.1
163	0.08
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.08
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.08
177	0.07
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.07
183	0.07
184	0.08
185	0.08
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.08
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.12
201	0.2
202	0.24
203	0.28
204	0.28
205	0.27
206	0.26
207	0.27
208	0.27
209	0.23
210	0.18
211	0.14
212	0.12
213	0.11
214	0.12
215	0.1
216	0.09
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.14
221	0.17
222	0.19
223	0.21
224	0.21
225	0.21
226	0.24
227	0.24
228	0.19
229	0.21
230	0.19
231	0.17
232	0.17
233	0.15
234	0.12
235	0.12
236	0.11
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.07
244	0.07
245	0.12
246	0.13
247	0.19
248	0.29
249	0.31
250	0.35
251	0.39
252	0.42
253	0.43
254	0.45
255	0.4
256	0.31
257	0.3
258	0.29
259	0.26
260	0.24
261	0.23
262	0.22
263	0.21
264	0.22
265	0.26
266	0.31
267	0.38
268	0.43
269	0.42
270	0.45
271	0.49
272	0.51
273	0.47
274	0.4
275	0.32
276	0.23
277	0.23
278	0.19
279	0.17
280	0.13
281	0.15
282	0.14
283	0.17
284	0.17
285	0.15
286	0.15
287	0.13
288	0.17
289	0.18
290	0.22
291	0.23
292	0.25
293	0.24
294	0.23
295	0.24
296	0.21
297	0.18
298	0.14
299	0.17
300	0.19
301	0.19
302	0.19
303	0.18
304	0.17
305	0.18
306	0.19
307	0.13
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.15
313	0.15
314	0.14
315	0.14
316	0.15
317	0.2
318	0.23
319	0.23
320	0.2
321	0.25
322	0.27
323	0.31
324	0.39
325	0.37
326	0.39
327	0.39
328	0.42
329	0.39
330	0.42
331	0.4
332	0.33
333	0.29
334	0.24
335	0.26
336	0.23
337	0.2
338	0.16
339	0.14
340	0.13
341	0.13
342	0.16
343	0.13
344	0.2
345	0.2
346	0.2
347	0.22
348	0.28
349	0.3
350	0.3
351	0.31
352	0.25
353	0.31
354	0.31
355	0.29
356	0.24
357	0.21
358	0.19
359	0.2
360	0.21
361	0.15
362	0.16
363	0.17
364	0.17
365	0.2
366	0.2
367	0.19
368	0.18
369	0.19
370	0.19
371	0.18
372	0.16
373	0.14
374	0.16
375	0.15
376	0.16
377	0.15
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.12
382	0.11
383	0.11
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.07
401	0.08
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.07
413	0.08
414	0.11
415	0.13
416	0.17
417	0.19
418	0.2
419	0.19
420	0.21
421	0.22
422	0.22
423	0.25
424	0.21
425	0.2
426	0.24
427	0.25
428	0.24
429	0.22
430	0.21
431	0.16
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.17
436	0.18
437	0.17
438	0.17
439	0.16
440	0.16
441	0.14
442	0.1
443	0.13
444	0.11
445	0.16
446	0.16
447	0.17
448	0.17
449	0.18
450	0.18
451	0.15
452	0.17
453	0.16
454	0.18
455	0.2
456	0.23
457	0.22
458	0.26
459	0.27
460	0.24
461	0.2
462	0.18
463	0.15
464	0.12
465	0.12
466	0.07
467	0.05
468	0.05
469	0.07
470	0.08
471	0.1
472	0.12
473	0.15
474	0.19
475	0.23
476	0.29
477	0.33
478	0.38
479	0.44
480	0.47
481	0.49
482	0.48
483	0.47
484	0.42
485	0.38
486	0.36
487	0.31
488	0.27
489	0.22
490	0.21
491	0.19
492	0.19
493	0.23
494	0.22
495	0.21
496	0.23
497	0.24
498	0.23
499	0.23
500	0.21
501	0.18
502	0.2
503	0.18
504	0.16
505	0.15
506	0.15
507	0.16
508	0.18
509	0.16
510	0.13
511	0.14
512	0.13
513	0.13
514	0.13
515	0.13
516	0.12
517	0.13
518	0.14
519	0.12
520	0.12
521	0.14
522	0.13
523	0.13
524	0.14
525	0.12
526	0.12
527	0.14
528	0.14
529	0.13
530	0.14
531	0.16
532	0.14
533	0.16
534	0.16
535	0.15
536	0.16
537	0.16
538	0.16
539	0.15
540	0.17
541	0.17
542	0.17
543	0.19
544	0.24
545	0.23
546	0.23
547	0.25
548	0.26
549	0.27
550	0.32
551	0.31
552	0.27
553	0.27
554	0.27
555	0.26
556	0.24
557	0.2
558	0.14
559	0.13
560	0.12
561	0.1
562	0.09
563	0.09
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.14
569	0.15
570	0.16
571	0.17
572	0.22
573	0.23
574	0.25
575	0.26
576	0.24
577	0.27
578	0.31
579	0.31
580	0.29
581	0.32
582	0.33
583	0.31
584	0.34
585	0.39
586	0.35
587	0.34
588	0.34
589	0.39
590	0.4
591	0.41
592	0.39
593	0.34
594	0.34
595	0.36
596	0.33
597	0.27
598	0.24
599	0.22
600	0.22
601	0.2
602	0.18
603	0.14
604	0.12
605	0.1
606	0.08
607	0.08
608	0.06
609	0.07
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.09
614	0.11
615	0.11
616	0.12
617	0.11
618	0.14
619	0.14
620	0.13
621	0.17
622	0.17
623	0.18
624	0.18
625	0.19
626	0.15
627	0.17
628	0.18
629	0.14
630	0.17
631	0.18
632	0.23
633	0.24
634	0.24
635	0.23
636	0.22
637	0.22
638	0.18
639	0.15
640	0.1
641	0.1
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.12
646	0.13
647	0.13
648	0.13
649	0.1
650	0.09
651	0.11
652	0.11
653	0.11
654	0.1
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.07
660	0.07
661	0.08
662	0.09
663	0.12
664	0.14
665	0.15
666	0.17
667	0.18
668	0.19
669	0.19
670	0.2
671	0.19
672	0.18
673	0.18
674	0.17
675	0.17
676	0.15
677	0.14
678	0.13
679	0.14
680	0.14
681	0.13
682	0.11
683	0.11
684	0.12
685	0.12
686	0.1
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.08
691	0.09
692	0.08
693	0.1
694	0.11
695	0.09
696	0.1
697	0.1
698	0.12
699	0.15
700	0.16
701	0.14
702	0.14
703	0.15
704	0.15
705	0.18
706	0.19
707	0.2
708	0.28
709	0.36
710	0.39
711	0.44
712	0.5
713	0.56
714	0.64
715	0.69
716	0.71
717	0.74
718	0.8
719	0.8
720	0.77
721	0.73
722	0.71
723	0.71
724	0.71
725	0.67
726	0.67
727	0.71
728	0.71
729	0.72
730	0.72
731	0.64
732	0.61
733	0.59
734	0.53
735	0.47
736	0.43
737	0.44
738	0.41
739	0.44
740	0.39
741	0.37
742	0.34
743	0.38
744	0.44
745	0.41
746	0.43
747	0.41
748	0.4
749	0.37
750	0.36
751	0.3
752	0.29
753	0.29
754	0.21
755	0.2
756	0.23
757	0.23
758	0.25
759	0.25
760	0.25
761	0.28
762	0.29
763	0.32
764	0.28
765	0.28
766	0.28
767	0.32
768	0.31
769	0.24
770	0.27
771	0.3
772	0.33
773	0.34
774	0.37
775	0.4
776	0.39
777	0.39
778	0.39
779	0.4
780	0.44
781	0.52
782	0.54
783	0.47
784	0.52
785	0.52
786	0.53
787	0.51
788	0.45
789	0.41
790	0.46
791	0.48
792	0.45
793	0.51
794	0.56
795	0.55
796	0.57
797	0.57
798	0.54
799	0.57
800	0.64
801	0.65
802	0.65
803	0.65
804	0.64
805	0.63
806	0.57
807	0.53
808	0.46
809	0.46
810	0.44
811	0.43
812	0.41
813	0.39
814	0.46
815	0.45
816	0.42
817	0.33
818	0.26
819	0.22
820	0.23
821	0.22
822	0.15
823	0.11
824	0.13
825	0.15
826	0.19
827	0.19
828	0.19
829	0.22
830	0.22
831	0.27
832	0.27
833	0.27
834	0.29
835	0.32
836	0.31
837	0.28
838	0.28
839	0.26
840	0.24
841	0.22
842	0.19
843	0.18
844	0.19
845	0.19
846	0.21
847	0.2
848	0.2
849	0.22
850	0.22
851	0.23
852	0.23
853	0.26
854	0.24
855	0.22
856	0.23
857	0.2
858	0.19
859	0.17
860	0.14
861	0.1
862	0.09
863	0.09
864	0.08
865	0.08
866	0.1
867	0.1
868	0.1
869	0.1
870	0.1
871	0.1
872	0.1
873	0.09
874	0.08
875	0.09
876	0.09
877	0.13
878	0.17
879	0.17
880	0.17
881	0.19
882	0.19
883	0.21
884	0.25
885	0.26
886	0.28
887	0.32
888	0.33
889	0.34
890	0.34
891	0.3
892	0.27
893	0.26
894	0.2
895	0.19
896	0.2
897	0.19
898	0.22
899	0.29
900	0.33
901	0.3
902	0.32
903	0.32
904	0.32
905	0.3
906	0.26
907	0.19
908	0.14
909	0.14
910	0.13
911	0.1
912	0.08
913	0.1
914	0.11
915	0.14
916	0.15
917	0.15
918	0.15
919	0.16
920	0.17
921	0.16
922	0.16
923	0.13
924	0.14
925	0.15
926	0.15
927	0.16
928	0.15
929	0.14
930	0.14
931	0.13
932	0.11
933	0.1
934	0.09
935	0.07
936	0.06
937	0.06
938	0.09
939	0.11
940	0.13
941	0.13
942	0.14
943	0.2
944	0.31
945	0.42

R1GEX8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer