Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TRH1

Protein Details
Accession A7TRH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-69GHFNRRRSSHHHHGRPKVKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-71RRRSSHHHHGRPKVKHTK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 10, cyto 9, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031456  Caf20  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005845  C:mRNA cap binding complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
KEGG vpo:Kpol_413p6  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17052  CAF20  
Amino Acid Sequences MVRYTVDELFHLKPTESLPVQFDAEEFKAIIEKVKQIQALKEEEFNAHGGHFNRRRSSHHHHGRPKVKHTKPKVTTDSDGWSTFEAANKKVNEDEESENVSVAVVPETLKVKPNNKNISSSRPADNKDIIADKQTHSFNAFAALESDEEEET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.27
3 0.25
4 0.24
5 0.23
6 0.24
7 0.25
8 0.23
9 0.22
10 0.19
11 0.18
12 0.17
13 0.15
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.16
18 0.13
19 0.16
20 0.18
21 0.22
22 0.25
23 0.25
24 0.28
25 0.29
26 0.32
27 0.29
28 0.28
29 0.26
30 0.23
31 0.23
32 0.2
33 0.16
34 0.12
35 0.14
36 0.13
37 0.22
38 0.27
39 0.3
40 0.35
41 0.37
42 0.4
43 0.45
44 0.53
45 0.55
46 0.6
47 0.65
48 0.68
49 0.76
50 0.81
51 0.79
52 0.79
53 0.79
54 0.75
55 0.75
56 0.75
57 0.76
58 0.71
59 0.74
60 0.7
61 0.63
62 0.58
63 0.51
64 0.46
65 0.38
66 0.33
67 0.25
68 0.2
69 0.17
70 0.15
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.18
80 0.2
81 0.22
82 0.19
83 0.22
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.12
89 0.09
90 0.07
91 0.04
92 0.05
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.15
97 0.19
98 0.27
99 0.35
100 0.45
101 0.52
102 0.53
103 0.6
104 0.59
105 0.62
106 0.61
107 0.56
108 0.53
109 0.5
110 0.51
111 0.48
112 0.47
113 0.39
114 0.37
115 0.38
116 0.31
117 0.3
118 0.29
119 0.26
120 0.29
121 0.29
122 0.27
123 0.25
124 0.24
125 0.2
126 0.24
127 0.22
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.15