Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EAA9

Protein Details
Accession R1EAA9    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-61PPKAYTGRSQAKPAKKRGRPARKVVEDSDDEDEPPKKATPKKAAPKKQIKREPTPEGEETHydrophilic
209-232KEIVTSKKKKPAVKAGRKRKSAETBasic
249-269ASTKASPAKKRAKKDEPESAAHydrophilic
950-982EGDITKDKYIKQPKKKAAPKKKAAKKAAADDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-24QAKPAKKRGRPARK
35-52PPKKATPKKAAPKKQIKR
74-102RSAPSKTPKPAVKTETPKSSPSKAKANGK
215-230KKKKPAVKAGRKRKSA
240-262PPKKPRGRPASTKASPAKKRAKK
960-980KQPKKKAAPKKKAAKKAAADD
982-999DDEPKPKKAAKGKGKAKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
KEGG npa:UCRNP2_8561  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00533  BRCT  
PF08519  RFC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
CDD cd17752  BRCT_RFC1  
cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MPPKAYTGRSQAKPAKKRGRPARKVVEDSDDEDEPPKKATPKKAAPKKQIKREPTPEGEETTASAFFGSSKPARSAPSKTPKPAVKTETPKSSPSKAKANGKTAATPTRTSARKTKPATYVEVKDEDEDFFDDDEDGDDIFTAAFKKKGKQADDYVESSEDEPVTLPQRQASGKSQKKLKEEDDFEAEEDVDMKDADPEDDFVVPDDDKEIVTSKKKKPAVKAGRKRKSAETDDELEEEPPKKPRGRPASTKASPAKKRAKKDEPESAAMQDILASIPTVRPPSPPPKSDGEGKKFNFKATHANSGPAPEAGAVEIPEGEPNCLAGMTFVFTGLLQYLDREAGQQLVKRYGGKVTGAPSSKTSFVVLGNDAGPSKLAKIKQFKLKTINEEGLFALIKKLPANGGDSKAAAAYEEKQAAEAKKIKEMAEEMDKEERRTGVKYAPSQLTQICGNKGQVEKLQRWLRNFPKSQKKGFKLGGPDGTHLVAKLEGYDIVETNASDTRSKKGVNEGLQGVLETTSLHGYFAGDGKKVEESKKKLVLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAAVCKKTQIPMILICNDRRLPKMKPFDYVTFDIPFRRPTTDQIRSRIMTIAYREGLKMPKNVIDALIEGTSADIRQVVNMVSTAKLDEEAMDFDKSKSMSKAWEKHIILKPWDIVGKILQGHMFSESSKHTLNDKTEFYFNDHELSYLMLQENYLGTNPMRAANCQGKDRNLKLLELADNAAESISDGDLVDRMIHGSQQQWSLMPTHAIFSFVRPASFVAGSMAGFKTNFPQWLGKNSSQGKLTRMVKEIQGHMRLRTSGDRHEIRQQYVPILWQELVKKLEQEGKEAVPEVIDLMDSYFLTKDDFDAILELGVGPMDMEKIKIESQTKATFTRMYNQASHPVPFMKASSVVAPKAAKKEKPDLEEAIEESDEGEVADEPDATKKDEDEEGDITKDKYIKQPKKKAAPKKKAAKKAAADDDDDEPKPKKAAKGKGKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.78
4 0.85
5 0.86
6 0.89
7 0.88
8 0.89
9 0.89
10 0.88
11 0.87
12 0.8
13 0.77
14 0.69
15 0.63
16 0.57
17 0.47
18 0.38
19 0.36
20 0.33
21 0.26
22 0.26
23 0.26
24 0.29
25 0.36
26 0.45
27 0.52
28 0.61
29 0.71
30 0.79
31 0.85
32 0.89
33 0.92
34 0.93
35 0.93
36 0.92
37 0.9
38 0.9
39 0.89
40 0.87
41 0.83
42 0.8
43 0.72
44 0.66
45 0.59
46 0.49
47 0.41
48 0.33
49 0.26
50 0.18
51 0.15
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.15
56 0.16
57 0.19
58 0.22
59 0.25
60 0.3
61 0.34
62 0.4
63 0.44
64 0.53
65 0.58
66 0.61
67 0.67
68 0.69
69 0.7
70 0.72
71 0.69
72 0.68
73 0.7
74 0.72
75 0.73
76 0.7
77 0.69
78 0.66
79 0.68
80 0.66
81 0.62
82 0.64
83 0.63
84 0.7
85 0.72
86 0.73
87 0.7
88 0.65
89 0.64
90 0.6
91 0.6
92 0.53
93 0.46
94 0.43
95 0.45
96 0.46
97 0.45
98 0.5
99 0.51
100 0.57
101 0.61
102 0.66
103 0.65
104 0.66
105 0.69
106 0.67
107 0.63
108 0.58
109 0.57
110 0.49
111 0.43
112 0.39
113 0.32
114 0.26
115 0.22
116 0.18
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.13
132 0.16
133 0.21
134 0.28
135 0.36
136 0.4
137 0.45
138 0.51
139 0.56
140 0.59
141 0.56
142 0.52
143 0.45
144 0.41
145 0.35
146 0.29
147 0.19
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.15
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.21
156 0.22
157 0.26
158 0.33
159 0.4
160 0.45
161 0.52
162 0.58
163 0.6
164 0.65
165 0.68
166 0.65
167 0.64
168 0.61
169 0.59
170 0.57
171 0.52
172 0.46
173 0.39
174 0.33
175 0.23
176 0.19
177 0.14
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.12
198 0.14
199 0.23
200 0.32
201 0.38
202 0.47
203 0.53
204 0.58
205 0.64
206 0.71
207 0.74
208 0.76
209 0.8
210 0.82
211 0.86
212 0.87
213 0.82
214 0.79
215 0.77
216 0.73
217 0.69
218 0.64
219 0.59
220 0.54
221 0.52
222 0.44
223 0.35
224 0.32
225 0.26
226 0.22
227 0.23
228 0.26
229 0.3
230 0.33
231 0.42
232 0.5
233 0.56
234 0.64
235 0.67
236 0.72
237 0.69
238 0.74
239 0.71
240 0.71
241 0.69
242 0.69
243 0.72
244 0.68
245 0.75
246 0.77
247 0.79
248 0.79
249 0.8
250 0.81
251 0.76
252 0.73
253 0.65
254 0.56
255 0.46
256 0.37
257 0.29
258 0.18
259 0.13
260 0.08
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.08
266 0.1
267 0.1
268 0.13
269 0.19
270 0.29
271 0.36
272 0.37
273 0.39
274 0.42
275 0.45
276 0.51
277 0.55
278 0.52
279 0.54
280 0.54
281 0.59
282 0.54
283 0.55
284 0.48
285 0.4
286 0.44
287 0.39
288 0.47
289 0.38
290 0.39
291 0.36
292 0.36
293 0.34
294 0.24
295 0.2
296 0.1
297 0.1
298 0.08
299 0.08
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.11
331 0.14
332 0.15
333 0.18
334 0.19
335 0.19
336 0.2
337 0.19
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.22
343 0.22
344 0.22
345 0.22
346 0.23
347 0.23
348 0.21
349 0.19
350 0.15
351 0.14
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.07
361 0.08
362 0.11
363 0.13
364 0.19
365 0.27
366 0.33
367 0.43
368 0.46
369 0.5
370 0.54
371 0.56
372 0.55
373 0.53
374 0.52
375 0.42
376 0.4
377 0.35
378 0.27
379 0.23
380 0.17
381 0.13
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.17
392 0.16
393 0.16
394 0.15
395 0.14
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.1
400 0.11
401 0.1
402 0.11
403 0.14
404 0.14
405 0.19
406 0.23
407 0.21
408 0.24
409 0.26
410 0.25
411 0.24
412 0.24
413 0.22
414 0.22
415 0.22
416 0.21
417 0.26
418 0.27
419 0.26
420 0.26
421 0.24
422 0.2
423 0.2
424 0.2
425 0.18
426 0.22
427 0.24
428 0.28
429 0.3
430 0.29
431 0.29
432 0.27
433 0.24
434 0.22
435 0.21
436 0.17
437 0.16
438 0.16
439 0.18
440 0.18
441 0.18
442 0.19
443 0.21
444 0.22
445 0.29
446 0.36
447 0.35
448 0.38
449 0.44
450 0.48
451 0.52
452 0.56
453 0.56
454 0.6
455 0.63
456 0.68
457 0.69
458 0.66
459 0.64
460 0.62
461 0.56
462 0.51
463 0.49
464 0.47
465 0.39
466 0.36
467 0.29
468 0.27
469 0.23
470 0.18
471 0.14
472 0.08
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.05
483 0.06
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.12
489 0.15
490 0.15
491 0.15
492 0.2
493 0.25
494 0.26
495 0.28
496 0.26
497 0.24
498 0.24
499 0.23
500 0.16
501 0.11
502 0.08
503 0.05
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.12
517 0.13
518 0.18
519 0.23
520 0.27
521 0.32
522 0.37
523 0.37
524 0.36
525 0.35
526 0.32
527 0.28
528 0.24
529 0.18
530 0.13
531 0.13
532 0.11
533 0.1
534 0.08
535 0.05
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.02
544 0.03
545 0.03
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.09
554 0.1
555 0.12
556 0.15
557 0.19
558 0.22
559 0.25
560 0.24
561 0.25
562 0.26
563 0.25
564 0.25
565 0.26
566 0.26
567 0.32
568 0.42
569 0.39
570 0.42
571 0.45
572 0.46
573 0.47
574 0.45
575 0.38
576 0.31
577 0.3
578 0.27
579 0.24
580 0.23
581 0.2
582 0.21
583 0.2
584 0.24
585 0.33
586 0.4
587 0.44
588 0.46
589 0.5
590 0.46
591 0.46
592 0.42
593 0.34
594 0.27
595 0.24
596 0.22
597 0.18
598 0.18
599 0.17
600 0.17
601 0.2
602 0.2
603 0.21
604 0.19
605 0.21
606 0.22
607 0.22
608 0.2
609 0.17
610 0.15
611 0.14
612 0.12
613 0.08
614 0.07
615 0.07
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.05
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.06
631 0.07
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.08
636 0.09
637 0.1
638 0.11
639 0.11
640 0.13
641 0.13
642 0.15
643 0.14
644 0.14
645 0.21
646 0.28
647 0.36
648 0.38
649 0.47
650 0.46
651 0.54
652 0.59
653 0.57
654 0.5
655 0.45
656 0.41
657 0.34
658 0.34
659 0.25
660 0.2
661 0.16
662 0.16
663 0.14
664 0.15
665 0.13
666 0.12
667 0.12
668 0.13
669 0.12
670 0.09
671 0.11
672 0.12
673 0.14
674 0.15
675 0.16
676 0.17
677 0.22
678 0.26
679 0.28
680 0.29
681 0.29
682 0.3
683 0.3
684 0.31
685 0.3
686 0.26
687 0.24
688 0.22
689 0.19
690 0.17
691 0.17
692 0.12
693 0.11
694 0.1
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.09
704 0.1
705 0.14
706 0.14
707 0.14
708 0.2
709 0.26
710 0.29
711 0.33
712 0.36
713 0.39
714 0.46
715 0.47
716 0.5
717 0.44
718 0.42
719 0.37
720 0.37
721 0.32
722 0.26
723 0.24
724 0.15
725 0.14
726 0.13
727 0.11
728 0.07
729 0.06
730 0.05
731 0.04
732 0.04
733 0.04
734 0.05
735 0.05
736 0.06
737 0.05
738 0.05
739 0.06
740 0.06
741 0.07
742 0.08
743 0.1
744 0.13
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.15
749 0.17
750 0.16
751 0.16
752 0.14
753 0.14
754 0.13
755 0.15
756 0.14
757 0.14
758 0.21
759 0.19
760 0.19
761 0.18
762 0.18
763 0.19
764 0.19
765 0.17
766 0.11
767 0.11
768 0.11
769 0.13
770 0.12
771 0.1
772 0.1
773 0.1
774 0.13
775 0.15
776 0.16
777 0.17
778 0.22
779 0.23
780 0.31
781 0.38
782 0.37
783 0.43
784 0.45
785 0.46
786 0.45
787 0.45
788 0.4
789 0.41
790 0.45
791 0.41
792 0.4
793 0.39
794 0.4
795 0.43
796 0.46
797 0.44
798 0.47
799 0.44
800 0.43
801 0.43
802 0.39
803 0.37
804 0.38
805 0.35
806 0.33
807 0.4
808 0.42
809 0.42
810 0.51
811 0.52
812 0.49
813 0.51
814 0.46
815 0.4
816 0.38
817 0.37
818 0.29
819 0.27
820 0.24
821 0.21
822 0.22
823 0.24
824 0.25
825 0.23
826 0.23
827 0.24
828 0.3
829 0.28
830 0.3
831 0.28
832 0.27
833 0.28
834 0.28
835 0.25
836 0.17
837 0.17
838 0.13
839 0.09
840 0.08
841 0.06
842 0.06
843 0.07
844 0.06
845 0.07
846 0.07
847 0.07
848 0.09
849 0.09
850 0.09
851 0.11
852 0.11
853 0.11
854 0.11
855 0.11
856 0.1
857 0.1
858 0.09
859 0.06
860 0.05
861 0.05
862 0.04
863 0.04
864 0.05
865 0.05
866 0.06
867 0.07
868 0.1
869 0.12
870 0.17
871 0.2
872 0.22
873 0.29
874 0.34
875 0.36
876 0.36
877 0.38
878 0.38
879 0.37
880 0.42
881 0.42
882 0.41
883 0.42
884 0.42
885 0.47
886 0.44
887 0.44
888 0.38
889 0.34
890 0.31
891 0.28
892 0.26
893 0.21
894 0.2
895 0.2
896 0.23
897 0.25
898 0.24
899 0.27
900 0.29
901 0.31
902 0.39
903 0.46
904 0.44
905 0.46
906 0.56
907 0.59
908 0.62
909 0.62
910 0.57
911 0.53
912 0.52
913 0.46
914 0.39
915 0.31
916 0.26
917 0.2
918 0.16
919 0.12
920 0.09
921 0.08
922 0.06
923 0.07
924 0.07
925 0.07
926 0.08
927 0.13
928 0.14
929 0.16
930 0.17
931 0.17
932 0.2
933 0.23
934 0.25
935 0.24
936 0.26
937 0.26
938 0.27
939 0.29
940 0.26
941 0.26
942 0.26
943 0.25
944 0.31
945 0.41
946 0.49
947 0.58
948 0.68
949 0.75
950 0.83
951 0.91
952 0.92
953 0.92
954 0.93
955 0.93
956 0.93
957 0.93
958 0.92
959 0.91
960 0.9
961 0.87
962 0.86
963 0.85
964 0.78
965 0.7
966 0.63
967 0.59
968 0.55
969 0.48
970 0.42
971 0.34
972 0.33
973 0.34
974 0.36
975 0.39
976 0.43
977 0.53
978 0.59
979 0.68