Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EM11

Protein Details
Accession R1EM11    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-59ISESLRLKVNKKRDQRKLKRASLLPAHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-51KKRDQRKLKR
Subcellular Location(s) nucl 12cyto_nucl 12, cyto 10, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG npa:UCRNP2_4682  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MPIIYDFQIFLEDPREISTPQEPANSGNEDSISESLRLKVNKKRDQRKLKRASLLPAHSDPSGLHSMVGGLEISINNDFISSNHGDDVFASSSRPGSMGSSFATASSVERPSTPDKAFAISFSPPPVDGDHKSSSNPEGSATSDDDITAENAQARLSPDACIFVANLPKDKTDAEIFEALTREFEKYGTCYIKIKRDRSMPIAFVQYRDPQVAVTVLEHAPGTLILTRKCRVERAKAPRCLYVYRRDGKLPSEKEVLKLLAKSGELDKVWAPTETELEKYGLAPGFCVRFKFYQDSVEAIMVHRGDEMYHVESFHAPDKMNHAVFARDSYLMEPNPSCSVPNYNAGIHLNSALWVGELPPSITKAELARVFGGQKRLITHIDLRIRWSRGAKFESYAIVRFLDPYSAVEAARATHRKLRLITGHSVRIEFAYKSFSPGFKGFRGNHSSSGNVNSHPGYVGPPSFYDAHNQMGAPGPYNHGSLRSYSQGSYGMSNGGIDSNSMHSYQGNIDCMNFYTNGQASGAHTQAQLSSHRCSGGTLHPVFSTLQGHSASSSQAQTGGGFTLMNHPAQYISPTSSVAQANNTFPVVNGTAAQVNGTYSAVNGTLNGVAAQMNGNYPLNNNNGSQMNGNYPANNTGAQLNGAYPANTFQASPRFFARP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.17
4 0.2
5 0.24
6 0.25
7 0.27
8 0.3
9 0.28
10 0.28
11 0.33
12 0.33
13 0.29
14 0.26
15 0.24
16 0.21
17 0.22
18 0.21
19 0.19
20 0.16
21 0.17
22 0.18
23 0.24
24 0.28
25 0.32
26 0.39
27 0.48
28 0.56
29 0.66
30 0.74
31 0.79
32 0.85
33 0.9
34 0.93
35 0.93
36 0.92
37 0.91
38 0.86
39 0.84
40 0.82
41 0.77
42 0.72
43 0.64
44 0.58
45 0.48
46 0.43
47 0.34
48 0.3
49 0.27
50 0.21
51 0.18
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.09
57 0.05
58 0.07
59 0.07
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.16
74 0.2
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.15
94 0.16
95 0.14
96 0.15
97 0.19
98 0.23
99 0.3
100 0.29
101 0.29
102 0.28
103 0.31
104 0.3
105 0.27
106 0.25
107 0.21
108 0.21
109 0.19
110 0.19
111 0.16
112 0.17
113 0.19
114 0.21
115 0.21
116 0.26
117 0.28
118 0.29
119 0.29
120 0.3
121 0.31
122 0.28
123 0.26
124 0.21
125 0.18
126 0.19
127 0.2
128 0.2
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.12
150 0.13
151 0.17
152 0.17
153 0.21
154 0.2
155 0.21
156 0.22
157 0.21
158 0.22
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.21
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.18
175 0.19
176 0.2
177 0.25
178 0.29
179 0.38
180 0.45
181 0.47
182 0.48
183 0.52
184 0.56
185 0.57
186 0.57
187 0.49
188 0.44
189 0.47
190 0.41
191 0.35
192 0.34
193 0.3
194 0.27
195 0.26
196 0.23
197 0.15
198 0.16
199 0.15
200 0.12
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.07
211 0.1
212 0.12
213 0.17
214 0.18
215 0.22
216 0.24
217 0.3
218 0.33
219 0.4
220 0.48
221 0.55
222 0.63
223 0.67
224 0.68
225 0.65
226 0.63
227 0.59
228 0.53
229 0.51
230 0.5
231 0.47
232 0.47
233 0.45
234 0.43
235 0.43
236 0.48
237 0.42
238 0.38
239 0.39
240 0.37
241 0.36
242 0.37
243 0.33
244 0.25
245 0.23
246 0.19
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.12
259 0.1
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.17
278 0.21
279 0.2
280 0.22
281 0.22
282 0.23
283 0.21
284 0.2
285 0.18
286 0.13
287 0.14
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.15
306 0.19
307 0.18
308 0.18
309 0.16
310 0.15
311 0.15
312 0.16
313 0.13
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.12
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.13
327 0.13
328 0.17
329 0.17
330 0.16
331 0.17
332 0.18
333 0.17
334 0.14
335 0.13
336 0.09
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.07
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.17
359 0.2
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.19
364 0.19
365 0.19
366 0.21
367 0.24
368 0.28
369 0.27
370 0.3
371 0.33
372 0.33
373 0.34
374 0.34
375 0.31
376 0.31
377 0.34
378 0.31
379 0.27
380 0.27
381 0.27
382 0.25
383 0.22
384 0.18
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.2
402 0.23
403 0.26
404 0.28
405 0.32
406 0.33
407 0.35
408 0.4
409 0.4
410 0.42
411 0.39
412 0.38
413 0.33
414 0.28
415 0.25
416 0.18
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.18
421 0.2
422 0.19
423 0.21
424 0.24
425 0.27
426 0.24
427 0.32
428 0.3
429 0.35
430 0.42
431 0.4
432 0.41
433 0.39
434 0.38
435 0.32
436 0.35
437 0.3
438 0.23
439 0.23
440 0.19
441 0.17
442 0.16
443 0.15
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.13
450 0.15
451 0.15
452 0.17
453 0.17
454 0.18
455 0.18
456 0.17
457 0.16
458 0.19
459 0.18
460 0.17
461 0.15
462 0.16
463 0.16
464 0.18
465 0.17
466 0.15
467 0.16
468 0.16
469 0.19
470 0.2
471 0.2
472 0.19
473 0.2
474 0.2
475 0.2
476 0.19
477 0.16
478 0.14
479 0.12
480 0.11
481 0.1
482 0.09
483 0.07
484 0.06
485 0.07
486 0.09
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.15
493 0.17
494 0.17
495 0.16
496 0.16
497 0.16
498 0.17
499 0.17
500 0.14
501 0.11
502 0.13
503 0.14
504 0.14
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.17
509 0.17
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.15
514 0.17
515 0.19
516 0.19
517 0.21
518 0.21
519 0.22
520 0.22
521 0.21
522 0.23
523 0.25
524 0.3
525 0.29
526 0.29
527 0.28
528 0.29
529 0.29
530 0.27
531 0.23
532 0.15
533 0.17
534 0.16
535 0.16
536 0.16
537 0.16
538 0.16
539 0.15
540 0.16
541 0.12
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.14
551 0.16
552 0.16
553 0.15
554 0.15
555 0.15
556 0.16
557 0.18
558 0.13
559 0.15
560 0.15
561 0.17
562 0.17
563 0.21
564 0.23
565 0.21
566 0.24
567 0.24
568 0.25
569 0.26
570 0.25
571 0.2
572 0.19
573 0.22
574 0.18
575 0.15
576 0.14
577 0.14
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.11
582 0.1
583 0.11
584 0.1
585 0.08
586 0.07
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.08
593 0.09
594 0.09
595 0.08
596 0.07
597 0.08
598 0.09
599 0.08
600 0.08
601 0.11
602 0.12
603 0.12
604 0.13
605 0.17
606 0.2
607 0.22
608 0.22
609 0.24
610 0.25
611 0.26
612 0.27
613 0.25
614 0.25
615 0.28
616 0.28
617 0.25
618 0.25
619 0.26
620 0.25
621 0.24
622 0.21
623 0.17
624 0.17
625 0.17
626 0.16
627 0.13
628 0.15
629 0.15
630 0.14
631 0.13
632 0.14
633 0.15
634 0.15
635 0.15
636 0.16
637 0.25
638 0.27
639 0.29