Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GMB3

Protein Details
Accession R1GMB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-440KLEQDKAKKAERERKLKNLNANEQKKYLEKEREKDLRRSQRKKVMRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-440IRKLKKTQEEERAEERKLEQDKAKKAERERKLKNLNANEQKKYLEKEREKDLRRSQRKKVMRS
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, mito 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG npa:UCRNP2_3804  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MANFLNNILGSKPSSSAAPGDADFADFAGAPDPSPASISPVSAVSGAPDSFSTGAARPYTKWYRVWERTTPADFYQEAFILPFIIIVVALHVWGTKANRRKAQAFVKAHAPLLRQEFASVGYSGQKPPTIEDVQASGLAKISAEELESPDQLLKEVSANEYQTYATGRQNAAFVDIKLSLLKRYNPLIRYGEQVLGLFFESMPAPTERVEATIYAFDGKESSLVPGAAKTPNSTFDGFVWAVVHKNLMKGLRDDRYDLSLTSTKDHAKLPVWYTVMSESAEITESLLTPELAKAVEKAGDSLEALVISDQPMDQPKKLDDTVSRKRVSLSFVLPSDNDYSHILPLFQYFLRLPDQLVSVAHFRPEAMRRVKQTREEEIRKLKKTQEEERAEERKLEQDKAKKAERERKLKNLNANEQKKYLEKEREKDLRRSQRKKVMRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.18
4 0.17
5 0.19
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.14
12 0.12
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.11
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.12
41 0.16
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.27
46 0.34
47 0.36
48 0.4
49 0.44
50 0.53
51 0.59
52 0.65
53 0.63
54 0.61
55 0.65
56 0.64
57 0.59
58 0.5
59 0.46
60 0.39
61 0.33
62 0.3
63 0.23
64 0.19
65 0.16
66 0.14
67 0.11
68 0.1
69 0.08
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.07
81 0.11
82 0.17
83 0.26
84 0.34
85 0.4
86 0.45
87 0.49
88 0.55
89 0.61
90 0.64
91 0.6
92 0.55
93 0.56
94 0.53
95 0.51
96 0.45
97 0.37
98 0.32
99 0.32
100 0.31
101 0.24
102 0.22
103 0.21
104 0.19
105 0.2
106 0.16
107 0.11
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.18
113 0.16
114 0.18
115 0.24
116 0.22
117 0.21
118 0.2
119 0.21
120 0.19
121 0.21
122 0.19
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.18
159 0.16
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.14
168 0.16
169 0.17
170 0.22
171 0.27
172 0.26
173 0.31
174 0.32
175 0.3
176 0.32
177 0.3
178 0.27
179 0.22
180 0.21
181 0.16
182 0.12
183 0.11
184 0.08
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.17
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.12
231 0.08
232 0.08
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.16
237 0.2
238 0.23
239 0.24
240 0.26
241 0.24
242 0.25
243 0.25
244 0.22
245 0.21
246 0.21
247 0.2
248 0.2
249 0.21
250 0.2
251 0.21
252 0.22
253 0.2
254 0.18
255 0.22
256 0.22
257 0.25
258 0.24
259 0.23
260 0.22
261 0.21
262 0.2
263 0.16
264 0.13
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.19
302 0.2
303 0.25
304 0.25
305 0.28
306 0.29
307 0.36
308 0.45
309 0.51
310 0.51
311 0.46
312 0.48
313 0.47
314 0.44
315 0.39
316 0.32
317 0.29
318 0.28
319 0.3
320 0.27
321 0.27
322 0.26
323 0.21
324 0.2
325 0.17
326 0.17
327 0.17
328 0.17
329 0.15
330 0.13
331 0.13
332 0.14
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.14
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.14
349 0.13
350 0.18
351 0.23
352 0.29
353 0.34
354 0.39
355 0.46
356 0.54
357 0.6
358 0.63
359 0.66
360 0.67
361 0.7
362 0.7
363 0.72
364 0.75
365 0.78
366 0.73
367 0.72
368 0.68
369 0.66
370 0.68
371 0.68
372 0.68
373 0.66
374 0.68
375 0.72
376 0.71
377 0.64
378 0.59
379 0.51
380 0.49
381 0.45
382 0.45
383 0.44
384 0.47
385 0.55
386 0.59
387 0.66
388 0.65
389 0.71
390 0.75
391 0.77
392 0.79
393 0.79
394 0.82
395 0.83
396 0.83
397 0.83
398 0.83
399 0.83
400 0.83
401 0.83
402 0.77
403 0.7
404 0.67
405 0.62
406 0.59
407 0.58
408 0.58
409 0.59
410 0.6
411 0.67
412 0.74
413 0.75
414 0.78
415 0.8
416 0.8
417 0.82
418 0.85
419 0.85
420 0.86