Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PT86

Protein Details
Accession A0A1D8PT86    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-66TEIYKSSSKIKAKTKRKSQHRPSQKKKILQLIHQHydrophilic
88-118DSINKNVAKNNSKKKSDRKHKKGSKGEFGIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-59SKIKAKTKRKSQHRPSQKKK
97-112NNSKKKSDRKHKKGSK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
IPR016850  TIF_Rrn11_budding_yeast  
Gene Ontology GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG cal:CAALFM_CR06480CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MFEDITFRNNEHRRATRTSHRLINKYQELKKFTEIYKSSSKIKAKTKRKSQHRPSQKKKILQLIHQEFDKRSLLKPEETYEIWHELSDSINKNVAKNNSKKKSDRKHKKGSKGEFGIDTEPEPETGGELSIDQGDELLRKKVSDIIEGNNEEEEQEEDEKEDEELDEDENLMTHKLNQFVNNFDTSNRLSKFKFIIESNGLEILPRINEEDNTTTNNNNNNNDTDSIEMIHKSKSAFRQHINNLTTLLHLQIMKQNWSIAYKIFALLIRFPQVDIRTIWPLGIEILMQLSNKNGSNSLKVKKFFNYLSSFYMITDTNPATRFISTNHKYRNNVAPVWRSGSKTLTPLYVITSLWYIFVLGDYEQVLNKINELILEPPYNSEGVLYFISSLCHLCLGWKLVDTYITGDNDNFDVVDERYNVEKQLNIIKNKMNEDFERCEKYQFIYPKDEIESQFKELLTVVSNKSNEKTPTLNKNGNDITMNNVSASSSSSSEENDLDWDAISSDEDEDEDDKVHTKANSLIPTQIDSLYHLKNHNGNKQHHINHDDENLVEVNFSDDESMDGESNIHSKMNYHQEEEIPASQPLDLGDMMMNGNHDNEEEEEEEMDGDTQAIESIDSDDLDHYDHINKTLNSFDTRRNSLELYNVKSSSVEPIDTFKISPSPSSPDNKDKTSQQTMLDFDFDFDFDSDSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.67
3 0.68
4 0.71
5 0.71
6 0.71
7 0.72
8 0.73
9 0.72
10 0.75
11 0.74
12 0.74
13 0.75
14 0.74
15 0.7
16 0.68
17 0.67
18 0.63
19 0.56
20 0.56
21 0.51
22 0.49
23 0.53
24 0.53
25 0.53
26 0.55
27 0.6
28 0.58
29 0.66
30 0.7
31 0.72
32 0.79
33 0.83
34 0.85
35 0.89
36 0.92
37 0.93
38 0.94
39 0.94
40 0.95
41 0.94
42 0.96
43 0.94
44 0.91
45 0.88
46 0.87
47 0.83
48 0.79
49 0.8
50 0.76
51 0.71
52 0.66
53 0.62
54 0.52
55 0.5
56 0.47
57 0.38
58 0.33
59 0.38
60 0.39
61 0.41
62 0.43
63 0.42
64 0.42
65 0.41
66 0.41
67 0.36
68 0.36
69 0.3
70 0.27
71 0.24
72 0.19
73 0.21
74 0.23
75 0.22
76 0.2
77 0.26
78 0.27
79 0.28
80 0.34
81 0.4
82 0.43
83 0.5
84 0.59
85 0.63
86 0.71
87 0.78
88 0.82
89 0.85
90 0.87
91 0.89
92 0.88
93 0.9
94 0.92
95 0.93
96 0.93
97 0.91
98 0.9
99 0.84
100 0.78
101 0.69
102 0.62
103 0.54
104 0.44
105 0.35
106 0.26
107 0.21
108 0.17
109 0.15
110 0.12
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.09
123 0.1
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.19
129 0.2
130 0.25
131 0.25
132 0.27
133 0.33
134 0.34
135 0.34
136 0.29
137 0.28
138 0.21
139 0.19
140 0.15
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.09
161 0.12
162 0.15
163 0.17
164 0.22
165 0.23
166 0.26
167 0.28
168 0.27
169 0.25
170 0.22
171 0.24
172 0.22
173 0.27
174 0.25
175 0.26
176 0.24
177 0.28
178 0.3
179 0.29
180 0.31
181 0.25
182 0.29
183 0.3
184 0.3
185 0.27
186 0.26
187 0.23
188 0.18
189 0.17
190 0.12
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.13
197 0.16
198 0.16
199 0.2
200 0.21
201 0.2
202 0.23
203 0.28
204 0.29
205 0.29
206 0.3
207 0.28
208 0.28
209 0.28
210 0.26
211 0.21
212 0.17
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.16
221 0.23
222 0.31
223 0.35
224 0.38
225 0.46
226 0.5
227 0.58
228 0.55
229 0.47
230 0.4
231 0.35
232 0.32
233 0.23
234 0.18
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.13
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.17
245 0.17
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.18
263 0.17
264 0.17
265 0.17
266 0.13
267 0.13
268 0.11
269 0.09
270 0.06
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.11
282 0.17
283 0.23
284 0.28
285 0.32
286 0.33
287 0.35
288 0.35
289 0.38
290 0.33
291 0.34
292 0.32
293 0.29
294 0.3
295 0.3
296 0.27
297 0.23
298 0.24
299 0.17
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.23
311 0.24
312 0.3
313 0.36
314 0.4
315 0.41
316 0.45
317 0.51
318 0.45
319 0.44
320 0.41
321 0.38
322 0.34
323 0.37
324 0.35
325 0.27
326 0.25
327 0.25
328 0.22
329 0.2
330 0.2
331 0.16
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.11
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.06
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.07
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.08
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.12
409 0.12
410 0.21
411 0.26
412 0.26
413 0.28
414 0.31
415 0.34
416 0.36
417 0.38
418 0.32
419 0.28
420 0.32
421 0.33
422 0.34
423 0.37
424 0.34
425 0.33
426 0.3
427 0.3
428 0.31
429 0.32
430 0.31
431 0.32
432 0.32
433 0.33
434 0.35
435 0.36
436 0.32
437 0.32
438 0.31
439 0.27
440 0.29
441 0.26
442 0.23
443 0.2
444 0.19
445 0.15
446 0.15
447 0.14
448 0.17
449 0.18
450 0.19
451 0.21
452 0.25
453 0.24
454 0.25
455 0.29
456 0.31
457 0.39
458 0.45
459 0.5
460 0.45
461 0.5
462 0.48
463 0.44
464 0.38
465 0.29
466 0.27
467 0.24
468 0.23
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.12
473 0.14
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.12
481 0.11
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.13
502 0.12
503 0.13
504 0.18
505 0.23
506 0.27
507 0.26
508 0.29
509 0.27
510 0.29
511 0.28
512 0.23
513 0.18
514 0.17
515 0.21
516 0.2
517 0.22
518 0.22
519 0.24
520 0.3
521 0.37
522 0.41
523 0.45
524 0.47
525 0.52
526 0.6
527 0.62
528 0.62
529 0.59
530 0.54
531 0.5
532 0.49
533 0.41
534 0.32
535 0.29
536 0.23
537 0.18
538 0.15
539 0.11
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.07
544 0.06
545 0.07
546 0.08
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.08
556 0.1
557 0.16
558 0.26
559 0.28
560 0.3
561 0.31
562 0.32
563 0.36
564 0.39
565 0.34
566 0.26
567 0.24
568 0.21
569 0.19
570 0.18
571 0.15
572 0.12
573 0.1
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.1
586 0.12
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.13
591 0.13
592 0.11
593 0.1
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.07
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.11
609 0.11
610 0.11
611 0.15
612 0.16
613 0.18
614 0.24
615 0.24
616 0.24
617 0.29
618 0.3
619 0.31
620 0.33
621 0.4
622 0.41
623 0.45
624 0.46
625 0.44
626 0.43
627 0.39
628 0.45
629 0.43
630 0.41
631 0.43
632 0.41
633 0.38
634 0.36
635 0.35
636 0.34
637 0.29
638 0.25
639 0.19
640 0.24
641 0.27
642 0.28
643 0.27
644 0.22
645 0.24
646 0.24
647 0.26
648 0.24
649 0.27
650 0.32
651 0.39
652 0.44
653 0.5
654 0.55
655 0.56
656 0.58
657 0.59
658 0.62
659 0.63
660 0.6
661 0.54
662 0.53
663 0.52
664 0.49
665 0.44
666 0.35
667 0.28
668 0.25
669 0.21
670 0.18
671 0.15