Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GX20

Protein Details
Accession R1GX20    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-127RPAPAPKKPLSKKKLEKAAKBasic
303-322RDIRRQFKQAEVKSKKTRDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-43KR
108-131RPAPAPKKPLSKKKLEKAAKAVKK
173-184KRRKASGGNKKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG npa:UCRNP2_233  -  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MSTRKRNDWLETGDASDDEEAGYDSEAEGQSKGRALAGRASKRRKVDDESDAESVADDDDDDFDPSLLRKEAAKAPQTATPPADDEAGSGAAHDDEHDDEDGNDHPLRPAPAPKKPLSKKKLEKAAKAVKKTGVVYLSRIPPFMKPAAVKSLLGQHGQVGRVFLTPEDPAVHKRRKASGGNKKKSFVDGWVEFVDKKDAKQCVELLNARIVGGKKGGYYYDDVWNMRYLTGFKWHHLTEQIANENAERASRMRAEIARSTRENKEFLQNVERAKMLEGMAAKKKSKSTTKEGQGNVAAPPSERDIRRQFKQAEVKSKKTRDVPEQPEEVKRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.3
3 0.22
4 0.16
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.07
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.13
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.16
22 0.17
23 0.24
24 0.33
25 0.41
26 0.49
27 0.57
28 0.61
29 0.65
30 0.71
31 0.69
32 0.67
33 0.65
34 0.65
35 0.62
36 0.61
37 0.55
38 0.48
39 0.42
40 0.34
41 0.27
42 0.18
43 0.11
44 0.06
45 0.05
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.16
58 0.22
59 0.29
60 0.33
61 0.33
62 0.34
63 0.38
64 0.4
65 0.39
66 0.33
67 0.28
68 0.25
69 0.23
70 0.22
71 0.17
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.1
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.12
90 0.12
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.23
97 0.26
98 0.33
99 0.39
100 0.43
101 0.52
102 0.58
103 0.67
104 0.65
105 0.7
106 0.72
107 0.74
108 0.8
109 0.76
110 0.73
111 0.73
112 0.77
113 0.73
114 0.67
115 0.62
116 0.53
117 0.5
118 0.45
119 0.38
120 0.31
121 0.25
122 0.25
123 0.26
124 0.29
125 0.26
126 0.26
127 0.23
128 0.2
129 0.23
130 0.21
131 0.2
132 0.15
133 0.17
134 0.21
135 0.22
136 0.21
137 0.18
138 0.24
139 0.22
140 0.22
141 0.2
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.13
157 0.2
158 0.24
159 0.26
160 0.29
161 0.33
162 0.38
163 0.45
164 0.51
165 0.55
166 0.62
167 0.69
168 0.69
169 0.67
170 0.61
171 0.56
172 0.46
173 0.38
174 0.34
175 0.26
176 0.25
177 0.24
178 0.24
179 0.22
180 0.21
181 0.23
182 0.16
183 0.16
184 0.19
185 0.21
186 0.21
187 0.23
188 0.24
189 0.22
190 0.26
191 0.28
192 0.23
193 0.23
194 0.22
195 0.2
196 0.21
197 0.18
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.13
206 0.14
207 0.19
208 0.21
209 0.21
210 0.22
211 0.23
212 0.22
213 0.19
214 0.18
215 0.13
216 0.12
217 0.21
218 0.21
219 0.2
220 0.25
221 0.25
222 0.26
223 0.27
224 0.29
225 0.24
226 0.28
227 0.3
228 0.26
229 0.26
230 0.24
231 0.23
232 0.2
233 0.16
234 0.12
235 0.1
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.17
240 0.2
241 0.24
242 0.3
243 0.34
244 0.36
245 0.38
246 0.42
247 0.44
248 0.45
249 0.44
250 0.39
251 0.43
252 0.41
253 0.41
254 0.43
255 0.4
256 0.39
257 0.38
258 0.36
259 0.28
260 0.26
261 0.24
262 0.18
263 0.17
264 0.17
265 0.21
266 0.28
267 0.33
268 0.33
269 0.34
270 0.39
271 0.44
272 0.51
273 0.52
274 0.53
275 0.59
276 0.66
277 0.71
278 0.68
279 0.66
280 0.59
281 0.53
282 0.46
283 0.38
284 0.29
285 0.21
286 0.22
287 0.21
288 0.25
289 0.25
290 0.32
291 0.4
292 0.48
293 0.52
294 0.59
295 0.57
296 0.6
297 0.69
298 0.7
299 0.71
300 0.71
301 0.76
302 0.77
303 0.8
304 0.78
305 0.76
306 0.76
307 0.75
308 0.77
309 0.76
310 0.73
311 0.75
312 0.71
313 0.69
314 0.64
315 0.55
316 0.48
317 0.42