FuNGI

R1G4R0

Protein Details

Accession

R1G4R0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
45-69	APSAPAPPAKKPRPAPKPFDPSKYT	Hydrophilic
149-176	QVIGIRVRSNRPKPKSKKKPKLEGGAAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
53-60	AKKPRPAP
156-170	RSNRPKPKSKKKPKL

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 10.5, nucl 5.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001406 PsdUridine_synth_TruA IPR020097 PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom IPR020095 PsdUridine_synth_TruA_C IPR020094 TruA/RsuA/RluB/E/F_N
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
KEGG	npa:UCRNP2_10176 -
Pfam	View protein in Pfam PF01416 PseudoU_synth_1

Amino Acid Sequences

MDTAAWTDEQFVSRRAEIEQRLARVTELEHKLAAQNATYTSPTTAPSAPAPPAKKPRPAPKPFDPSKYTTRLIALKFAYLGSNYNGFEHHANNTTPLPTIEEELWRALKKTRLILPTPKPGLSEDDINWEGCEYSKCGRTDRGVSAFGQVIGIRVRSNRPKPKSKKKPKLEGGAATAGEAMEGVETGPAGVEGAAEDAEEFEEEPPFDDVKDELSYCRVLNNVLPPDIRMLAWCPNPGLDFSARFNCKERRYKYFFTNPAFAPTPGAAGVYGGARGSMREGWLDVAAMREAASYLEGYHDFRNFCKVDPAKQISNFERRIFHTSVDRWNGGSGFARYAAAAPFQIPGLADADGKAVAGSSGESSVDDDNGPGLFTFNVHGSAFLWHQVRHLVAVLFLVGQGLEKPSIVRELLDVERNTTKPKYEMASDTPLVLWDCVFPADPEGHPEQSQPDSLDWIYVGDERAFKGTGGNGLEEKFGHGGLIPALWEYVPVMKKERMEPVEVINARYLERKSLDKKVIAARKEDADE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.25
3	0.31
4	0.32
5	0.4
6	0.42
7	0.41
8	0.43
9	0.42
10	0.39
11	0.32
12	0.31
13	0.31
14	0.31
15	0.29
16	0.27
17	0.27
18	0.29
19	0.32
20	0.3
21	0.21
22	0.18
23	0.18
24	0.21
25	0.21
26	0.2
27	0.18
28	0.18
29	0.18
30	0.2
31	0.19
32	0.19
33	0.22
34	0.24
35	0.26
36	0.32
37	0.34
38	0.4
39	0.49
40	0.53
41	0.59
42	0.65
43	0.71
44	0.75
45	0.81
46	0.8
47	0.8
48	0.84
49	0.82
50	0.81
51	0.76
52	0.71
53	0.7
54	0.68
55	0.59
56	0.51
57	0.49
58	0.47
59	0.43
60	0.43
61	0.36
62	0.31
63	0.29
64	0.28
65	0.24
66	0.18
67	0.19
68	0.15
69	0.18
70	0.17
71	0.17
72	0.17
73	0.18
74	0.19
75	0.19
76	0.2
77	0.2
78	0.2
79	0.22
80	0.23
81	0.22
82	0.21
83	0.2
84	0.19
85	0.16
86	0.18
87	0.17
88	0.18
89	0.18
90	0.2
91	0.23
92	0.2
93	0.21
94	0.23
95	0.26
96	0.28
97	0.33
98	0.37
99	0.4
100	0.45
101	0.53
102	0.56
103	0.61
104	0.6
105	0.55
106	0.49
107	0.44
108	0.44
109	0.37
110	0.34
111	0.25
112	0.28
113	0.28
114	0.27
115	0.25
116	0.2
117	0.18
118	0.14
119	0.15
120	0.11
121	0.14
122	0.2
123	0.21
124	0.24
125	0.28
126	0.31
127	0.35
128	0.38
129	0.39
130	0.34
131	0.34
132	0.33
133	0.3
134	0.26
135	0.21
136	0.15
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.1
141	0.11
142	0.18
143	0.27
144	0.37
145	0.46
146	0.53
147	0.63
148	0.73
149	0.82
150	0.87
151	0.89
152	0.9
153	0.9
154	0.94
155	0.91
156	0.9
157	0.86
158	0.78
159	0.71
160	0.64
161	0.53
162	0.42
163	0.34
164	0.23
165	0.16
166	0.11
167	0.07
168	0.03
169	0.03
170	0.03
171	0.02
172	0.02
173	0.03
174	0.02
175	0.02
176	0.03
177	0.02
178	0.02
179	0.02
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.11
199	0.1
200	0.09
201	0.1
202	0.12
203	0.11
204	0.12
205	0.1
206	0.09
207	0.11
208	0.16
209	0.16
210	0.17
211	0.17
212	0.16
213	0.18
214	0.18
215	0.15
216	0.1
217	0.1
218	0.14
219	0.15
220	0.15
221	0.14
222	0.14
223	0.14
224	0.14
225	0.14
226	0.1
227	0.11
228	0.12
229	0.19
230	0.2
231	0.21
232	0.25
233	0.29
234	0.36
235	0.43
236	0.45
237	0.48
238	0.54
239	0.57
240	0.6
241	0.63
242	0.62
243	0.56
244	0.56
245	0.47
246	0.44
247	0.42
248	0.34
249	0.26
250	0.19
251	0.16
252	0.12
253	0.12
254	0.07
255	0.05
256	0.06
257	0.04
258	0.04
259	0.03
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.06
284	0.08
285	0.09
286	0.12
287	0.12
288	0.13
289	0.19
290	0.18
291	0.18
292	0.25
293	0.25
294	0.28
295	0.37
296	0.41
297	0.39
298	0.41
299	0.46
300	0.42
301	0.49
302	0.47
303	0.4
304	0.38
305	0.37
306	0.41
307	0.37
308	0.34
309	0.32
310	0.31
311	0.36
312	0.37
313	0.34
314	0.28
315	0.28
316	0.26
317	0.21
318	0.2
319	0.14
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.05
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.07
363	0.07
364	0.09
365	0.08
366	0.09
367	0.09
368	0.11
369	0.11
370	0.14
371	0.16
372	0.14
373	0.15
374	0.17
375	0.16
376	0.15
377	0.16
378	0.12
379	0.1
380	0.1
381	0.09
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.14
398	0.16
399	0.22
400	0.22
401	0.23
402	0.27
403	0.28
404	0.32
405	0.29
406	0.29
407	0.25
408	0.28
409	0.28
410	0.28
411	0.32
412	0.33
413	0.37
414	0.35
415	0.34
416	0.3
417	0.29
418	0.25
419	0.2
420	0.15
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.08
426	0.1
427	0.12
428	0.12
429	0.17
430	0.2
431	0.21
432	0.21
433	0.22
434	0.24
435	0.24
436	0.26
437	0.22
438	0.19
439	0.21
440	0.2
441	0.2
442	0.16
443	0.14
444	0.13
445	0.13
446	0.14
447	0.12
448	0.13
449	0.14
450	0.16
451	0.16
452	0.15
453	0.15
454	0.15
455	0.18
456	0.18
457	0.2
458	0.19
459	0.19
460	0.2
461	0.18
462	0.19
463	0.15
464	0.13
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.09
469	0.1
470	0.08
471	0.07
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.13
477	0.16
478	0.18
479	0.23
480	0.27
481	0.31
482	0.36
483	0.45
484	0.41
485	0.43
486	0.43
487	0.42
488	0.48
489	0.46
490	0.43
491	0.36
492	0.34
493	0.31
494	0.34
495	0.3
496	0.27
497	0.29
498	0.36
499	0.39
500	0.48
501	0.54
502	0.51
503	0.57
504	0.61
505	0.66
506	0.6
507	0.59
508	0.54

R1G4R0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer