Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EMV1

Protein Details
Accession R1EMV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-53IDSVLGEQRPRKRTRRTKDELKQELEREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-39RKRT
Subcellular Location(s) cyto 14, nucl 8, cyto_pero 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG npa:UCRNP2_4128  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MEHLAQAFERVSLAADSVNTSDPDWIDSVLGEQRPRKRTRRTKDELKQELEREFLTPSTSLNTHWLNELQQRWDAPINYADLFELAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEITVPASSATAKNSTSLLRKPAKRADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAAAEDEFLRNQQSEKAKKQGGLDRVINFGVEGGLLEVPPGFARGLDFKKKPSTDQQNADEVEKALGEEPAPVESVDGILSEEVDGVQPSAGESGDEEHQDDDDIDSLLPVEFPALAPRGNLSLSASKRANKEWAHMVDVNRDIPNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNEFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKQKNIYVISTPKRPVPLEHYLWSNKVMHKIVDADKHFIEKGWKEANDVLSGKDKVKASKPEESNANIWVHLVQHLRKENLLPACIFVFSKRRCEENADALANLDFCTASEKSAIHMIIEKSIARLKPEDRVLPQIRRLRELLSRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKILFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGRQFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDPVGSVIIVTPGAEEAPPAARLRQMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKAVKLSEADLEKIKREACEICDVDLELCHQACMNYQRLTNELHLALLATPVGKRLFDARRLVVYKKDGVRTAGMLLRDGTSKGHEPTVQIDLAEVLKGDPEALKLASDEFQPLCEAWTFEDWNEVNMSKFIRDLTYRGLLEERRKQAEIAQNRKCLQCPKFLQHVNQNLQLLPDYEQRISVLKDLGFIDEKSRVELKGKVACEIHSADELVLTELILENVLADYEPEEIAALLSAFVFQEKTDVTPTLTPRLEQGQAKIVEISEKVNHIQTLHQVILSADDSNDFVSRPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPTLYTKMQTCQELIKRDICNAASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.11
4 0.12
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.15
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.13
14 0.12
15 0.15
16 0.18
17 0.21
18 0.24
19 0.3
20 0.38
21 0.47
22 0.56
23 0.63
24 0.68
25 0.76
26 0.82
27 0.86
28 0.87
29 0.89
30 0.9
31 0.92
32 0.9
33 0.86
34 0.83
35 0.76
36 0.69
37 0.6
38 0.51
39 0.41
40 0.33
41 0.27
42 0.22
43 0.17
44 0.16
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.22
49 0.24
50 0.23
51 0.25
52 0.26
53 0.27
54 0.33
55 0.36
56 0.33
57 0.34
58 0.34
59 0.35
60 0.39
61 0.35
62 0.31
63 0.29
64 0.29
65 0.26
66 0.26
67 0.22
68 0.17
69 0.16
70 0.13
71 0.11
72 0.08
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.18
77 0.2
78 0.22
79 0.27
80 0.32
81 0.33
82 0.35
83 0.36
84 0.37
85 0.38
86 0.39
87 0.35
88 0.34
89 0.3
90 0.29
91 0.3
92 0.26
93 0.24
94 0.23
95 0.21
96 0.17
97 0.18
98 0.18
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.15
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.26
112 0.29
113 0.36
114 0.42
115 0.47
116 0.54
117 0.62
118 0.63
119 0.65
120 0.65
121 0.64
122 0.63
123 0.59
124 0.58
125 0.49
126 0.44
127 0.37
128 0.33
129 0.25
130 0.17
131 0.18
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.17
156 0.26
157 0.34
158 0.4
159 0.48
160 0.5
161 0.53
162 0.6
163 0.6
164 0.57
165 0.56
166 0.55
167 0.48
168 0.47
169 0.43
170 0.36
171 0.28
172 0.21
173 0.14
174 0.09
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.14
188 0.21
189 0.3
190 0.32
191 0.36
192 0.45
193 0.47
194 0.5
195 0.54
196 0.58
197 0.58
198 0.64
199 0.64
200 0.62
201 0.62
202 0.58
203 0.49
204 0.39
205 0.3
206 0.22
207 0.18
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.05
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.18
267 0.19
268 0.25
269 0.27
270 0.3
271 0.33
272 0.35
273 0.4
274 0.35
275 0.37
276 0.39
277 0.39
278 0.4
279 0.41
280 0.4
281 0.37
282 0.38
283 0.36
284 0.29
285 0.26
286 0.22
287 0.2
288 0.21
289 0.16
290 0.14
291 0.16
292 0.16
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.2
297 0.25
298 0.25
299 0.21
300 0.22
301 0.18
302 0.17
303 0.16
304 0.17
305 0.14
306 0.16
307 0.18
308 0.17
309 0.16
310 0.16
311 0.17
312 0.18
313 0.18
314 0.16
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.09
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.11
351 0.17
352 0.18
353 0.2
354 0.22
355 0.25
356 0.25
357 0.28
358 0.36
359 0.37
360 0.45
361 0.46
362 0.5
363 0.52
364 0.53
365 0.59
366 0.52
367 0.47
368 0.43
369 0.44
370 0.37
371 0.32
372 0.31
373 0.2
374 0.18
375 0.15
376 0.08
377 0.05
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.08
400 0.1
401 0.09
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.06
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.06
426 0.06
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.12
461 0.15
462 0.21
463 0.23
464 0.28
465 0.33
466 0.37
467 0.41
468 0.39
469 0.39
470 0.38
471 0.44
472 0.43
473 0.41
474 0.38
475 0.35
476 0.36
477 0.33
478 0.3
479 0.3
480 0.33
481 0.31
482 0.32
483 0.35
484 0.33
485 0.33
486 0.33
487 0.29
488 0.23
489 0.24
490 0.23
491 0.19
492 0.19
493 0.22
494 0.23
495 0.27
496 0.27
497 0.24
498 0.24
499 0.25
500 0.24
501 0.2
502 0.21
503 0.15
504 0.19
505 0.21
506 0.21
507 0.21
508 0.24
509 0.24
510 0.23
511 0.23
512 0.19
513 0.19
514 0.2
515 0.19
516 0.2
517 0.2
518 0.2
519 0.25
520 0.32
521 0.32
522 0.39
523 0.41
524 0.4
525 0.42
526 0.42
527 0.37
528 0.32
529 0.28
530 0.2
531 0.18
532 0.15
533 0.12
534 0.13
535 0.14
536 0.12
537 0.17
538 0.2
539 0.2
540 0.2
541 0.21
542 0.22
543 0.22
544 0.21
545 0.16
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.13
550 0.1
551 0.17
552 0.17
553 0.24
554 0.25
555 0.26
556 0.27
557 0.33
558 0.35
559 0.33
560 0.36
561 0.29
562 0.28
563 0.26
564 0.25
565 0.18
566 0.15
567 0.09
568 0.04
569 0.04
570 0.08
571 0.07
572 0.08
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.12
577 0.12
578 0.09
579 0.12
580 0.12
581 0.12
582 0.13
583 0.12
584 0.1
585 0.14
586 0.14
587 0.12
588 0.15
589 0.14
590 0.19
591 0.22
592 0.24
593 0.22
594 0.31
595 0.34
596 0.35
597 0.41
598 0.41
599 0.39
600 0.39
601 0.38
602 0.32
603 0.31
604 0.31
605 0.27
606 0.23
607 0.22
608 0.2
609 0.19
610 0.17
611 0.13
612 0.1
613 0.08
614 0.06
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.05
626 0.05
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.08
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.06
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.08
655 0.1
656 0.14
657 0.19
658 0.23
659 0.29
660 0.3
661 0.32
662 0.37
663 0.42
664 0.44
665 0.47
666 0.46
667 0.41
668 0.47
669 0.46
670 0.41
671 0.34
672 0.29
673 0.22
674 0.19
675 0.18
676 0.11
677 0.11
678 0.1
679 0.08
680 0.09
681 0.11
682 0.11
683 0.12
684 0.12
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.12
689 0.1
690 0.1
691 0.09
692 0.08
693 0.07
694 0.06
695 0.05
696 0.05
697 0.04
698 0.03
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.05
704 0.07
705 0.07
706 0.08
707 0.09
708 0.09
709 0.11
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.18
714 0.19
715 0.2
716 0.2
717 0.21
718 0.2
719 0.22
720 0.21
721 0.21
722 0.25
723 0.3
724 0.33
725 0.38
726 0.36
727 0.39
728 0.39
729 0.37
730 0.33
731 0.26
732 0.23
733 0.15
734 0.14
735 0.09
736 0.08
737 0.06
738 0.06
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.09
743 0.11
744 0.14
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.16
749 0.18
750 0.18
751 0.2
752 0.2
753 0.21
754 0.22
755 0.2
756 0.19
757 0.18
758 0.18
759 0.14
760 0.13
761 0.12
762 0.12
763 0.12
764 0.12
765 0.14
766 0.14
767 0.13
768 0.12
769 0.16
770 0.15
771 0.17
772 0.21
773 0.19
774 0.19
775 0.21
776 0.22
777 0.17
778 0.19
779 0.2
780 0.18
781 0.26
782 0.25
783 0.24
784 0.23
785 0.23
786 0.21
787 0.18
788 0.17
789 0.11
790 0.1
791 0.09
792 0.08
793 0.08
794 0.12
795 0.16
796 0.19
797 0.2
798 0.21
799 0.22
800 0.24
801 0.27
802 0.25
803 0.23
804 0.18
805 0.16
806 0.14
807 0.14
808 0.12
809 0.1
810 0.08
811 0.05
812 0.05
813 0.08
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.16
818 0.21
819 0.26
820 0.31
821 0.31
822 0.37
823 0.41
824 0.42
825 0.4
826 0.39
827 0.39
828 0.4
829 0.42
830 0.36
831 0.36
832 0.35
833 0.31
834 0.3
835 0.26
836 0.21
837 0.18
838 0.17
839 0.16
840 0.15
841 0.14
842 0.12
843 0.13
844 0.16
845 0.16
846 0.18
847 0.18
848 0.19
849 0.21
850 0.24
851 0.21
852 0.18
853 0.16
854 0.15
855 0.14
856 0.13
857 0.09
858 0.06
859 0.06
860 0.06
861 0.06
862 0.05
863 0.06
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.1
869 0.1
870 0.11
871 0.13
872 0.11
873 0.12
874 0.12
875 0.12
876 0.12
877 0.12
878 0.12
879 0.11
880 0.14
881 0.15
882 0.14
883 0.2
884 0.19
885 0.19
886 0.21
887 0.19
888 0.16
889 0.17
890 0.18
891 0.12
892 0.13
893 0.13
894 0.14
895 0.15
896 0.16
897 0.2
898 0.25
899 0.25
900 0.26
901 0.29
902 0.31
903 0.37
904 0.44
905 0.45
906 0.43
907 0.44
908 0.43
909 0.46
910 0.51
911 0.53
912 0.54
913 0.55
914 0.58
915 0.61
916 0.62
917 0.6
918 0.59
919 0.52
920 0.52
921 0.51
922 0.51
923 0.58
924 0.61
925 0.63
926 0.63
927 0.7
928 0.65
929 0.63
930 0.57
931 0.47
932 0.43
933 0.37
934 0.3
935 0.23
936 0.24
937 0.22
938 0.21
939 0.21
940 0.21
941 0.22
942 0.22
943 0.22
944 0.19
945 0.16
946 0.19
947 0.19
948 0.21
949 0.21
950 0.2
951 0.2
952 0.22
953 0.22
954 0.23
955 0.24
956 0.22
957 0.23
958 0.27
959 0.31
960 0.33
961 0.34
962 0.34
963 0.34
964 0.33
965 0.34
966 0.32
967 0.27
968 0.21
969 0.21
970 0.16
971 0.16
972 0.16
973 0.13
974 0.11
975 0.08
976 0.07
977 0.07
978 0.07
979 0.06
980 0.05
981 0.04
982 0.04
983 0.05
984 0.04
985 0.04
986 0.05
987 0.06
988 0.06
989 0.06
990 0.06
991 0.06
992 0.06
993 0.06
994 0.05
995 0.04
996 0.04
997 0.05
998 0.05
999 0.05
1000 0.06
1001 0.05
1002 0.07
1003 0.08
1004 0.1
1005 0.13
1006 0.14
1007 0.16
1008 0.21
1009 0.24
1010 0.3
1011 0.3
1012 0.28
1013 0.29
1014 0.33
1015 0.36
1016 0.33
1017 0.33
1018 0.34
1019 0.34
1020 0.35
1021 0.32
1022 0.28
1023 0.25
1024 0.23
1025 0.24
1026 0.18
1027 0.19
1028 0.2
1029 0.22
1030 0.23
1031 0.21
1032 0.23
1033 0.25
1034 0.28
1035 0.26
1036 0.24
1037 0.22
1038 0.21
1039 0.23
1040 0.21
1041 0.17
1042 0.11
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.12
1046 0.13
1047 0.1
1048 0.12
1049 0.14
1050 0.16
1051 0.17
1052 0.18
1053 0.17
1054 0.17
1055 0.23
1056 0.21
1057 0.22
1058 0.21
1059 0.23
1060 0.21
1061 0.21
1062 0.2
1063 0.14
1064 0.13
1065 0.1
1066 0.11
1067 0.17
1068 0.21
1069 0.22
1070 0.25
1071 0.26
1072 0.27
1073 0.28
1074 0.28
1075 0.21
1076 0.17
1077 0.16
1078 0.13
1079 0.14
1080 0.12
1081 0.11
1082 0.12
1083 0.1
1084 0.09
1085 0.1
1086 0.1
1087 0.11
1088 0.16
1089 0.17
1090 0.19
1091 0.24
1092 0.29
1093 0.35
1094 0.37
1095 0.38
1096 0.36
1097 0.39
1098 0.43
1099 0.44
1100 0.42
1101 0.37
1102 0.35
1103 0.37
1104 0.39
1105 0.34
1106 0.26
1107 0.24
1108 0.26
1109 0.24
1110 0.24
1111 0.23
1112 0.24
1113 0.29
1114 0.31
1115 0.3
1116 0.34
1117 0.41
1118 0.47
1119 0.48
1120 0.5
1121 0.47
1122 0.47
1123 0.51
1124 0.43
1125 0.39