Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1FWY3

Protein Details
Accession R1FWY3    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-157DGDGSGKKKKREGRRDKPKKSRKRRGEDGDEVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-150KRKRADGDGDGSGKKKKREGRRDKPKKSRKRRG
192-193RK
201-212EALKGGRKKSRK
444-456RRLKLGRAGGKRG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
KEGG npa:UCRNP2_9660  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDPEITNSPPDPSTLPEAGNDPGEPVRPDIDEENSTPNPPAAAPGQDMELTEAGQGTGDADAEDKGDNDDGLSDAESVLSDVDEAQFEDFDPNAIAIEDRPAIQVDESNVGLIGVHKRKRADGDGDGSGKKKKREGRRDKPKKSRKRRGEDGDEVSGAEGITTERRARRSTKKAEPLEEDWDSLTPDERRRKALDAKMDEALKGGRKKSRKQQGIDLEAQADAEIEDMRRRMTEAAQADNEGRERGEPAIHKLKLLPEVVALLNRNNLQNNLVDPDINLLQAVRFFLEPLNDGSMPAYNIQRELFTVLAKLPITKDSLVASGIGKVINFYTKTNRAESSIKRQAEKLIGEWTRPILKRTDDYRKKEVAEANYDPLRLPDRTTSKAAASQQAAAERRAKALAPPSFMNRARQEGQLRTYTVAPKSNVVANAAPVRHVGQSEAARRLKLGRAGGKRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.26
4 0.24
5 0.26
6 0.26
7 0.26
8 0.23
9 0.18
10 0.18
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.2
15 0.19
16 0.22
17 0.22
18 0.25
19 0.25
20 0.26
21 0.31
22 0.3
23 0.31
24 0.29
25 0.26
26 0.22
27 0.19
28 0.2
29 0.15
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.18
37 0.16
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.16
102 0.21
103 0.25
104 0.28
105 0.3
106 0.33
107 0.38
108 0.41
109 0.39
110 0.37
111 0.38
112 0.39
113 0.41
114 0.4
115 0.37
116 0.39
117 0.37
118 0.35
119 0.37
120 0.41
121 0.49
122 0.59
123 0.68
124 0.73
125 0.8
126 0.89
127 0.92
128 0.95
129 0.95
130 0.95
131 0.95
132 0.95
133 0.94
134 0.93
135 0.92
136 0.91
137 0.89
138 0.86
139 0.79
140 0.71
141 0.6
142 0.5
143 0.4
144 0.3
145 0.2
146 0.12
147 0.07
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.11
152 0.14
153 0.17
154 0.21
155 0.28
156 0.38
157 0.46
158 0.54
159 0.6
160 0.67
161 0.69
162 0.71
163 0.69
164 0.62
165 0.58
166 0.5
167 0.4
168 0.31
169 0.26
170 0.22
171 0.16
172 0.15
173 0.12
174 0.19
175 0.27
176 0.28
177 0.31
178 0.34
179 0.39
180 0.44
181 0.47
182 0.49
183 0.45
184 0.45
185 0.44
186 0.42
187 0.37
188 0.29
189 0.25
190 0.21
191 0.2
192 0.21
193 0.24
194 0.3
195 0.36
196 0.46
197 0.54
198 0.57
199 0.57
200 0.63
201 0.65
202 0.65
203 0.61
204 0.52
205 0.42
206 0.34
207 0.31
208 0.21
209 0.13
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.14
222 0.14
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.11
230 0.09
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.16
237 0.24
238 0.24
239 0.24
240 0.24
241 0.26
242 0.27
243 0.26
244 0.21
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.13
250 0.1
251 0.11
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.19
319 0.26
320 0.29
321 0.32
322 0.32
323 0.33
324 0.39
325 0.42
326 0.46
327 0.48
328 0.48
329 0.47
330 0.47
331 0.47
332 0.46
333 0.42
334 0.33
335 0.33
336 0.32
337 0.31
338 0.31
339 0.29
340 0.31
341 0.31
342 0.31
343 0.26
344 0.29
345 0.35
346 0.42
347 0.5
348 0.52
349 0.59
350 0.64
351 0.65
352 0.63
353 0.63
354 0.61
355 0.55
356 0.53
357 0.49
358 0.48
359 0.44
360 0.42
361 0.36
362 0.32
363 0.3
364 0.23
365 0.23
366 0.25
367 0.29
368 0.34
369 0.37
370 0.38
371 0.36
372 0.41
373 0.42
374 0.4
375 0.36
376 0.34
377 0.33
378 0.37
379 0.36
380 0.34
381 0.36
382 0.3
383 0.3
384 0.29
385 0.27
386 0.25
387 0.32
388 0.33
389 0.32
390 0.34
391 0.37
392 0.45
393 0.46
394 0.5
395 0.45
396 0.47
397 0.45
398 0.5
399 0.52
400 0.49
401 0.52
402 0.49
403 0.47
404 0.42
405 0.44
406 0.43
407 0.41
408 0.41
409 0.37
410 0.35
411 0.35
412 0.38
413 0.35
414 0.33
415 0.29
416 0.27
417 0.32
418 0.3
419 0.28
420 0.25
421 0.25
422 0.23
423 0.23
424 0.2
425 0.2
426 0.28
427 0.33
428 0.41
429 0.42
430 0.4
431 0.41
432 0.44
433 0.43
434 0.42
435 0.44
436 0.44