Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GMY9

Protein Details
Accession R1GMY9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-307LDKGIEHIKRRNRLRRWTLFVFIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR045242  Syntaxin  
IPR006011  Syntaxin_N  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG npa:UCRNP2_3544  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00804  Syntaxin  
CDD cd15849  SNARE_Sso1  
Amino Acid Sequences MSHGGYQQYGGNPYGGENPYGQSIGGGAGYGASNPYGGQDQNDYAHDSNYAEMGNLNGPPQQSSRVMGTDEFLARVDGAKQRIRQLTSQITEISTIHQRLLSDAGSSGANQQLEHLTSQTQILNTQIKDEIKFLETDAARTGGNPTKDSQIRNLKNSFTSELQSYQKIEAEYRERYREQIKRQIRIVNPEASEAEVNEAAQQEWGTEGIFQTALKSNRSAQANSVLGAVRARHNDIQRIEKTMSELALLFTQLNEQVVLQEDQVVKGEQQTEGVYQQAQAANTELDKGIEHIKRRNRLRRWTLFVFILIICIIALVLGLYFGLRKNNNGNNNNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.21
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.21
8 0.19
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.07
14 0.05
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.07
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.14
27 0.16
28 0.18
29 0.2
30 0.23
31 0.21
32 0.21
33 0.2
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.13
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.13
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.22
54 0.2
55 0.2
56 0.19
57 0.18
58 0.16
59 0.14
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.14
65 0.19
66 0.24
67 0.26
68 0.33
69 0.38
70 0.4
71 0.4
72 0.42
73 0.45
74 0.42
75 0.41
76 0.35
77 0.3
78 0.28
79 0.26
80 0.22
81 0.19
82 0.18
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.18
88 0.15
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.12
110 0.16
111 0.15
112 0.17
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.16
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.16
133 0.21
134 0.24
135 0.25
136 0.3
137 0.36
138 0.39
139 0.43
140 0.44
141 0.39
142 0.38
143 0.39
144 0.34
145 0.25
146 0.22
147 0.18
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.15
157 0.18
158 0.21
159 0.23
160 0.27
161 0.25
162 0.27
163 0.35
164 0.38
165 0.41
166 0.46
167 0.5
168 0.5
169 0.54
170 0.58
171 0.52
172 0.53
173 0.5
174 0.44
175 0.38
176 0.35
177 0.31
178 0.25
179 0.23
180 0.15
181 0.13
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.07
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.17
203 0.18
204 0.24
205 0.27
206 0.25
207 0.22
208 0.27
209 0.26
210 0.25
211 0.24
212 0.19
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.13
217 0.14
218 0.17
219 0.21
220 0.23
221 0.3
222 0.32
223 0.39
224 0.37
225 0.4
226 0.37
227 0.33
228 0.33
229 0.28
230 0.25
231 0.17
232 0.16
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.09
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.12
253 0.14
254 0.16
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.12
262 0.11
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.12
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.18
276 0.21
277 0.26
278 0.33
279 0.42
280 0.51
281 0.61
282 0.7
283 0.71
284 0.78
285 0.84
286 0.85
287 0.85
288 0.81
289 0.76
290 0.67
291 0.59
292 0.5
293 0.39
294 0.3
295 0.21
296 0.16
297 0.1
298 0.08
299 0.07
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.06
309 0.14
310 0.15
311 0.2
312 0.29
313 0.38
314 0.48