Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GCH0

Protein Details
Accession R1GCH0    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MATSVQPPQQRKQPSRKGKKAWRKNVDVSDVQHydrophilic
276-309EENALKQKRPDRKTPQQRKKAERRKEAERKAKWEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-24RKQPSRKGKKAWRK
281-315KQKRPDRKTPQQRKKAERRKEAERKAKWEAQMKKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG npa:UCRNP2_9712  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MATSVQPPQQRKQPSRKGKKAWRKNVDVSDVQTGLEEIRDEVIHGGVVADKASDELFVVDPTGSAEIKKEVQKHHKPLKADEILAQRSAVPAVDSRKRASKVTDGIVEPSSKRHKVGKYVSHKELQRLKSIAHGGDTTEKDVVQADGNATHDPWAAEDRKQDPRFSFLPEKKPIREPETLKHAPVVLSATGKPFPAVKKPDAGRSYNPTFEDWNSLLTREGEKEVEAEKKRLKEAEEERLREERAAAAAAESDPESDNGNDSAWESEWEGIQSEAEENALKQKRPDRKTPQQRKKAERRKEAERKAKWEAQMKKKQQQAEQIKQLAKEVEEREKLKAEKALVQRDAESSEDEEEVIRRRKFGKAPIPEAPLEVVLPDELQDSLRLLKPEGNLIKDRYRNMILRGKIESRKGAQRKQAKTTVTEKWSYKDWTLEKAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.87
3 0.9
4 0.92
5 0.93
6 0.95
7 0.95
8 0.95
9 0.94
10 0.91
11 0.9
12 0.88
13 0.84
14 0.77
15 0.69
16 0.64
17 0.54
18 0.45
19 0.36
20 0.27
21 0.2
22 0.17
23 0.14
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.13
54 0.18
55 0.23
56 0.28
57 0.35
58 0.46
59 0.56
60 0.65
61 0.71
62 0.71
63 0.7
64 0.7
65 0.71
66 0.65
67 0.56
68 0.52
69 0.5
70 0.48
71 0.44
72 0.39
73 0.28
74 0.24
75 0.23
76 0.17
77 0.1
78 0.11
79 0.17
80 0.24
81 0.26
82 0.29
83 0.36
84 0.38
85 0.4
86 0.4
87 0.42
88 0.4
89 0.42
90 0.44
91 0.37
92 0.38
93 0.37
94 0.35
95 0.27
96 0.28
97 0.31
98 0.28
99 0.3
100 0.35
101 0.37
102 0.45
103 0.54
104 0.57
105 0.61
106 0.67
107 0.69
108 0.68
109 0.66
110 0.64
111 0.64
112 0.57
113 0.53
114 0.46
115 0.42
116 0.41
117 0.42
118 0.35
119 0.28
120 0.25
121 0.2
122 0.25
123 0.25
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.13
142 0.13
143 0.15
144 0.2
145 0.24
146 0.34
147 0.35
148 0.38
149 0.34
150 0.37
151 0.37
152 0.39
153 0.44
154 0.4
155 0.47
156 0.51
157 0.55
158 0.53
159 0.59
160 0.57
161 0.53
162 0.54
163 0.5
164 0.47
165 0.52
166 0.5
167 0.44
168 0.39
169 0.34
170 0.27
171 0.24
172 0.2
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.19
183 0.24
184 0.23
185 0.29
186 0.31
187 0.39
188 0.4
189 0.41
190 0.37
191 0.39
192 0.41
193 0.37
194 0.36
195 0.3
196 0.27
197 0.25
198 0.26
199 0.19
200 0.19
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.11
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.18
213 0.18
214 0.21
215 0.24
216 0.25
217 0.27
218 0.27
219 0.27
220 0.28
221 0.32
222 0.39
223 0.42
224 0.42
225 0.44
226 0.44
227 0.43
228 0.35
229 0.3
230 0.2
231 0.13
232 0.12
233 0.09
234 0.06
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.14
266 0.17
267 0.17
268 0.21
269 0.29
270 0.38
271 0.43
272 0.54
273 0.55
274 0.64
275 0.75
276 0.82
277 0.85
278 0.86
279 0.9
280 0.9
281 0.92
282 0.91
283 0.9
284 0.89
285 0.85
286 0.86
287 0.87
288 0.87
289 0.86
290 0.82
291 0.78
292 0.75
293 0.74
294 0.69
295 0.67
296 0.66
297 0.67
298 0.71
299 0.72
300 0.72
301 0.72
302 0.72
303 0.68
304 0.69
305 0.69
306 0.68
307 0.67
308 0.67
309 0.64
310 0.59
311 0.56
312 0.47
313 0.37
314 0.34
315 0.3
316 0.31
317 0.35
318 0.36
319 0.37
320 0.41
321 0.41
322 0.38
323 0.38
324 0.32
325 0.34
326 0.4
327 0.45
328 0.42
329 0.43
330 0.4
331 0.38
332 0.37
333 0.3
334 0.24
335 0.18
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.19
342 0.25
343 0.24
344 0.26
345 0.28
346 0.35
347 0.4
348 0.48
349 0.52
350 0.53
351 0.59
352 0.63
353 0.65
354 0.59
355 0.54
356 0.45
357 0.36
358 0.26
359 0.19
360 0.13
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.12
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.21
374 0.21
375 0.3
376 0.33
377 0.35
378 0.36
379 0.41
380 0.48
381 0.49
382 0.5
383 0.47
384 0.49
385 0.47
386 0.5
387 0.53
388 0.49
389 0.48
390 0.52
391 0.53
392 0.53
393 0.55
394 0.55
395 0.53
396 0.59
397 0.64
398 0.66
399 0.68
400 0.72
401 0.74
402 0.76
403 0.78
404 0.71
405 0.68
406 0.67
407 0.66
408 0.63
409 0.62
410 0.56
411 0.52
412 0.54
413 0.53
414 0.49
415 0.49
416 0.45