Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1ER00

Protein Details
Accession R1ER00    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-35DAEVQPEKRLPKRQKLDAPRGPPPKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-24PKRQK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9, plas 5, cyto 2.5, mito 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021714  Npa1_N  
IPR039844  URB1  
KEGG npa:UCRNP2_3246  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11707  Npa1  
Amino Acid Sequences MSKRTAPAVDAEVQPEKRLPKRQKLDAPRGPPPKAEEIHSSRQLQQLLIFQQDNTQQLRNGIHSLKVFLESILYPSDEYAVPRQRAILREFLDTQKSRTADPDAPFLSNVIQTWSFASQSNNEQLSCAVVAVLALLLKTLSSNLELREYGTQLCRTILQVSQLKLVGRGLSAPKHKDYVISPCLRLLTEVVSFDGGAVAKQVYSKRDFTFDAKILARNLGIRRTEEDAAKDKRRPAVRTNAVKYLLAHFRNQEEGAKIDILKHGMVVRALFDHIRDDPPEIAIEILEVVKSHVIADKEIPRANKTYMLSDRALSNIASLYRVEQPLEDDSDEKSVDVGIPRGRKKNRSEKTTEMAPPTLISAWIHLNDLITFFAIRILIIAFQKLEQVLSKFKHASAKFSHDLWDQAAERLVSEFRERCPKMKDVIAAFRKIPEANLMQQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.38
4 0.41
5 0.5
6 0.55
7 0.59
8 0.68
9 0.76
10 0.83
11 0.86
12 0.89
13 0.88
14 0.85
15 0.84
16 0.83
17 0.76
18 0.69
19 0.64
20 0.61
21 0.54
22 0.51
23 0.5
24 0.49
25 0.56
26 0.59
27 0.56
28 0.52
29 0.55
30 0.52
31 0.43
32 0.39
33 0.36
34 0.32
35 0.34
36 0.3
37 0.25
38 0.28
39 0.31
40 0.32
41 0.29
42 0.29
43 0.25
44 0.28
45 0.31
46 0.29
47 0.3
48 0.28
49 0.29
50 0.27
51 0.28
52 0.25
53 0.25
54 0.22
55 0.17
56 0.18
57 0.14
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.11
65 0.13
66 0.2
67 0.26
68 0.27
69 0.27
70 0.31
71 0.33
72 0.37
73 0.38
74 0.38
75 0.32
76 0.35
77 0.38
78 0.37
79 0.42
80 0.38
81 0.38
82 0.36
83 0.35
84 0.31
85 0.31
86 0.34
87 0.32
88 0.33
89 0.37
90 0.32
91 0.32
92 0.31
93 0.29
94 0.24
95 0.18
96 0.17
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.15
106 0.19
107 0.25
108 0.25
109 0.23
110 0.23
111 0.21
112 0.21
113 0.18
114 0.14
115 0.07
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.18
146 0.21
147 0.21
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.22
152 0.21
153 0.15
154 0.11
155 0.13
156 0.13
157 0.16
158 0.21
159 0.24
160 0.25
161 0.26
162 0.26
163 0.26
164 0.25
165 0.28
166 0.31
167 0.3
168 0.29
169 0.28
170 0.29
171 0.26
172 0.25
173 0.17
174 0.12
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.06
183 0.04
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.07
188 0.09
189 0.11
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.21
194 0.23
195 0.24
196 0.27
197 0.25
198 0.26
199 0.24
200 0.25
201 0.22
202 0.21
203 0.18
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.18
210 0.21
211 0.22
212 0.2
213 0.22
214 0.25
215 0.3
216 0.33
217 0.34
218 0.33
219 0.37
220 0.42
221 0.43
222 0.41
223 0.46
224 0.51
225 0.56
226 0.57
227 0.56
228 0.52
229 0.48
230 0.44
231 0.38
232 0.36
233 0.28
234 0.26
235 0.23
236 0.22
237 0.24
238 0.24
239 0.21
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.08
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.14
283 0.19
284 0.23
285 0.26
286 0.27
287 0.26
288 0.29
289 0.29
290 0.31
291 0.26
292 0.29
293 0.3
294 0.33
295 0.32
296 0.3
297 0.29
298 0.24
299 0.24
300 0.17
301 0.14
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.11
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.16
312 0.18
313 0.2
314 0.18
315 0.15
316 0.15
317 0.17
318 0.17
319 0.14
320 0.11
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.13
325 0.16
326 0.24
327 0.29
328 0.39
329 0.45
330 0.52
331 0.6
332 0.68
333 0.72
334 0.73
335 0.75
336 0.73
337 0.73
338 0.73
339 0.68
340 0.61
341 0.53
342 0.45
343 0.37
344 0.32
345 0.26
346 0.19
347 0.14
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.16
375 0.22
376 0.24
377 0.3
378 0.3
379 0.32
380 0.4
381 0.38
382 0.42
383 0.42
384 0.48
385 0.45
386 0.45
387 0.47
388 0.39
389 0.4
390 0.35
391 0.35
392 0.27
393 0.26
394 0.28
395 0.23
396 0.21
397 0.21
398 0.2
399 0.16
400 0.22
401 0.23
402 0.25
403 0.36
404 0.38
405 0.42
406 0.47
407 0.5
408 0.49
409 0.52
410 0.55
411 0.51
412 0.59
413 0.6
414 0.58
415 0.54
416 0.51
417 0.48
418 0.42
419 0.36
420 0.32
421 0.3