Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1FYC7

Protein Details
Accession R1FYC7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-56EDEDDPPKPRPKQKPADLLREVEAcidic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 13, cyto 8.5, cyto_nucl 7, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG npa:UCRNP2_9144  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MGDRLLVGLNTGCLRIYRVNEVSDEPELAPTPAEDEDDPPKPRPKQKPADLLREVEKFSRRPIQQLAMIKESSILVSLSDNYVSIYDLQTYDLQERLEKTKGAATFAVTSNIVKDPSTGIPSIVSRLAVAVKRRIILWSWQDMELSEDTAEITLISTVKSLTWATGTKIVAGMDPGFVMVDIETQEVADIVKPSSLSDSAGQQVNRFGAVNTSGMGYMAMGGWVPKPMATRLGDKELLLAKDVNSLFVDTDGKALEKRQIPWTTAPEALGYSYPYMLALQPPAKGALEVRNPDTLNLLQTISIPNAAFLHVPQPNISLAHAGKGFLVASDRCIWRMGALHYEEQIDELIAKGRYDEAVSLLNMLEDTLLKDKNGRIREVQILKAQSLFQQRRYREAMDLFSDAVAQPEKVIALYPKSIAGDLSIVEEPSESDAEAETEDEGGKTDEETAPAEKQTGNTLTRAMFGRLVAEQKKPDSDTASIRSFKADSDNVSIKGKKSADNLAEEDRPLREFSLKHFKADYRLII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.22
4 0.28
5 0.31
6 0.32
7 0.34
8 0.37
9 0.37
10 0.33
11 0.31
12 0.24
13 0.22
14 0.21
15 0.19
16 0.17
17 0.13
18 0.14
19 0.12
20 0.14
21 0.13
22 0.16
23 0.21
24 0.28
25 0.32
26 0.35
27 0.43
28 0.49
29 0.58
30 0.65
31 0.7
32 0.74
33 0.8
34 0.85
35 0.85
36 0.87
37 0.82
38 0.75
39 0.71
40 0.64
41 0.56
42 0.51
43 0.49
44 0.41
45 0.42
46 0.47
47 0.42
48 0.44
49 0.48
50 0.48
51 0.49
52 0.55
53 0.54
54 0.5
55 0.48
56 0.42
57 0.37
58 0.31
59 0.24
60 0.17
61 0.12
62 0.07
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.17
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.22
87 0.25
88 0.25
89 0.26
90 0.23
91 0.21
92 0.22
93 0.23
94 0.24
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.18
99 0.17
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.1
113 0.11
114 0.15
115 0.16
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.25
121 0.26
122 0.24
123 0.28
124 0.29
125 0.3
126 0.3
127 0.3
128 0.3
129 0.28
130 0.29
131 0.22
132 0.18
133 0.11
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.11
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.12
216 0.14
217 0.18
218 0.2
219 0.25
220 0.25
221 0.23
222 0.25
223 0.23
224 0.22
225 0.18
226 0.16
227 0.12
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.13
243 0.14
244 0.17
245 0.23
246 0.25
247 0.27
248 0.3
249 0.32
250 0.3
251 0.27
252 0.25
253 0.18
254 0.16
255 0.15
256 0.12
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.14
274 0.17
275 0.19
276 0.2
277 0.23
278 0.23
279 0.23
280 0.24
281 0.18
282 0.15
283 0.14
284 0.12
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.08
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.07
313 0.1
314 0.07
315 0.09
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.17
323 0.16
324 0.17
325 0.19
326 0.19
327 0.19
328 0.2
329 0.18
330 0.16
331 0.14
332 0.09
333 0.07
334 0.06
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.04
353 0.06
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.12
358 0.16
359 0.23
360 0.26
361 0.27
362 0.27
363 0.31
364 0.4
365 0.41
366 0.42
367 0.39
368 0.38
369 0.35
370 0.34
371 0.3
372 0.26
373 0.33
374 0.32
375 0.36
376 0.43
377 0.43
378 0.48
379 0.52
380 0.5
381 0.44
382 0.45
383 0.39
384 0.34
385 0.34
386 0.28
387 0.23
388 0.22
389 0.16
390 0.15
391 0.12
392 0.09
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.07
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.13
401 0.13
402 0.15
403 0.15
404 0.15
405 0.14
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.12
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.1
432 0.11
433 0.12
434 0.14
435 0.16
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.16
440 0.16
441 0.21
442 0.24
443 0.23
444 0.22
445 0.25
446 0.23
447 0.26
448 0.27
449 0.23
450 0.19
451 0.18
452 0.19
453 0.19
454 0.26
455 0.26
456 0.29
457 0.32
458 0.33
459 0.38
460 0.38
461 0.38
462 0.35
463 0.36
464 0.38
465 0.4
466 0.43
467 0.41
468 0.39
469 0.4
470 0.35
471 0.32
472 0.33
473 0.29
474 0.27
475 0.32
476 0.36
477 0.36
478 0.41
479 0.43
480 0.37
481 0.42
482 0.41
483 0.38
484 0.38
485 0.44
486 0.43
487 0.46
488 0.48
489 0.46
490 0.46
491 0.43
492 0.4
493 0.33
494 0.3
495 0.26
496 0.24
497 0.23
498 0.22
499 0.29
500 0.38
501 0.38
502 0.4
503 0.44
504 0.44
505 0.47