Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GHP5

Protein Details
Accession R1GHP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23AEKEKPKTKSSTKPSSRSASKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-39EKPKTKSSTKPSSRSASKASSGEKKVKKSSSSKD
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9, nucl 8.5, mito 8, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003511  HORMA_dom  
IPR036570  HORMA_dom_sf  
IPR045091  Mad2-like  
KEGG npa:UCRNP2_5470  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02301  HORMA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50815  HORMA  
Amino Acid Sequences MSAEKEKPKTKSSTKPSSRSASKASSGEKKVKKSSSSKDAEAKTHKLALKGSSKVVSEFFEYSIHTILFQRGVYPAEDFSAVKKYGLTMMVSSDDQVKAYIKKIMSQLSKWMLGSKINKLVVVITSRETGEHVERWQFDVDIFGKNAKTRSSRTSGTPAAADEAGSENATAAEPADATPEKTEAEIQSEIQSLFRQITASVTFLPMLDGNCTFNVLVYADADSDVPVEWGDSDAKEIENGEKVQLRSFSTSNHRVDTMVSYRLAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.8
3 0.81
4 0.81
5 0.78
6 0.73
7 0.69
8 0.64
9 0.6
10 0.57
11 0.56
12 0.56
13 0.56
14 0.61
15 0.61
16 0.63
17 0.65
18 0.67
19 0.68
20 0.68
21 0.7
22 0.71
23 0.7
24 0.68
25 0.68
26 0.65
27 0.66
28 0.63
29 0.59
30 0.51
31 0.52
32 0.48
33 0.43
34 0.42
35 0.4
36 0.41
37 0.39
38 0.39
39 0.35
40 0.34
41 0.32
42 0.31
43 0.26
44 0.22
45 0.21
46 0.18
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.14
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.16
88 0.14
89 0.18
90 0.21
91 0.26
92 0.27
93 0.27
94 0.31
95 0.3
96 0.31
97 0.27
98 0.26
99 0.2
100 0.23
101 0.25
102 0.22
103 0.25
104 0.24
105 0.24
106 0.22
107 0.22
108 0.18
109 0.17
110 0.14
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.11
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.15
134 0.15
135 0.17
136 0.19
137 0.23
138 0.27
139 0.29
140 0.3
141 0.35
142 0.34
143 0.31
144 0.29
145 0.24
146 0.21
147 0.19
148 0.15
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.13
170 0.1
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.16
226 0.17
227 0.19
228 0.23
229 0.24
230 0.27
231 0.29
232 0.3
233 0.3
234 0.3
235 0.33
236 0.37
237 0.45
238 0.44
239 0.44
240 0.42
241 0.38
242 0.39
243 0.4
244 0.35
245 0.3