Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GFE7

Protein Details
Accession R1GFE7    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-35DPSKLTRQRKPKDAGPKVQTHydrophilic
241-264AMPPPSFKRTVKKKKDLSSALGIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-260KRTVKKKKDLSSA
262-266GIKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
KEGG npa:UCRNP2_6294  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVLSKYYPPDFDPSKLTRQRKPKDAGPKVQTVRLMAPFSMKCTACGEFIYKGRKFNARKETTDESYYAIKIYRFYIRCTRCSAEITFKTDPRNMDYTSERGAKRNFEPWREEKLNQETDEERLDRLEREEAERDAMAELETKTLDAKTEMAIADALDEIRTRNARVERGEFVAEAKVEKDPRDAERERQEKEDEEAARRAFETANGERVRRLDESAAVEEPAVASSSSSSAAADAAAMPPPSFKRTVKKKKDLSSALGIKKKPSLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.5
3 0.48
4 0.46
5 0.49
6 0.54
7 0.59
8 0.59
9 0.67
10 0.73
11 0.75
12 0.77
13 0.75
14 0.77
15 0.8
16 0.82
17 0.77
18 0.78
19 0.71
20 0.68
21 0.62
22 0.54
23 0.48
24 0.43
25 0.39
26 0.29
27 0.33
28 0.29
29 0.3
30 0.34
31 0.29
32 0.26
33 0.27
34 0.28
35 0.23
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.27
40 0.34
41 0.32
42 0.34
43 0.37
44 0.45
45 0.46
46 0.52
47 0.57
48 0.55
49 0.56
50 0.6
51 0.63
52 0.58
53 0.56
54 0.47
55 0.38
56 0.34
57 0.31
58 0.24
59 0.19
60 0.15
61 0.14
62 0.16
63 0.22
64 0.21
65 0.26
66 0.35
67 0.37
68 0.39
69 0.44
70 0.44
71 0.38
72 0.4
73 0.39
74 0.38
75 0.37
76 0.41
77 0.39
78 0.39
79 0.4
80 0.39
81 0.38
82 0.33
83 0.33
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.27
88 0.28
89 0.32
90 0.28
91 0.29
92 0.3
93 0.31
94 0.3
95 0.36
96 0.36
97 0.34
98 0.4
99 0.4
100 0.47
101 0.47
102 0.46
103 0.44
104 0.46
105 0.47
106 0.41
107 0.39
108 0.31
109 0.28
110 0.3
111 0.24
112 0.17
113 0.13
114 0.14
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.11
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.11
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.14
154 0.17
155 0.2
156 0.23
157 0.27
158 0.26
159 0.28
160 0.28
161 0.23
162 0.21
163 0.19
164 0.15
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.16
171 0.17
172 0.2
173 0.28
174 0.29
175 0.33
176 0.42
177 0.47
178 0.47
179 0.47
180 0.47
181 0.41
182 0.42
183 0.41
184 0.34
185 0.32
186 0.34
187 0.3
188 0.28
189 0.27
190 0.24
191 0.17
192 0.18
193 0.21
194 0.18
195 0.26
196 0.27
197 0.28
198 0.28
199 0.29
200 0.31
201 0.25
202 0.25
203 0.19
204 0.21
205 0.25
206 0.26
207 0.26
208 0.22
209 0.2
210 0.18
211 0.16
212 0.13
213 0.09
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.12
231 0.15
232 0.18
233 0.23
234 0.26
235 0.35
236 0.46
237 0.57
238 0.65
239 0.73
240 0.79
241 0.84
242 0.9
243 0.86
244 0.81
245 0.8
246 0.78
247 0.77
248 0.74
249 0.66
250 0.59