Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GD18

Protein Details
Accession R1GD18    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50PPSPLPARPPEPKRQKISKVAAVFHydrophilic
292-318PWGPKTLRSRDRKQQRHHHHHQRYGGGBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG npa:UCRNP2_9485  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MMKIQSLLNPLLADHRLDGERDESSLPPSPLPARPPEPKRQKISKVAAVFVKGKAKGDVRYPPHEDVDDPQLAAEHRKFQIYPMGHIKDYPRHIPYNSEKKCFLTKTGREAFEVFQYTFKVPGDDHEYVVMWDYNIGLTRITPFFKCCKYSKTTPARVLNINPGLRDISHSITGGALSAQGYWMPFDAAKAVAATFCFHIRHALTPIFGADFARACTHPTDPSFASFRIGGAVVARSAAQANEWRLLYSMLNSAAFPPGHHYSRSGSAISPVDGGGAQPSPLTPQLPGNYTPWGPKTLRSRDRKQQRHHHHHQRYGGGYGAADLESGYGTDTDQSDRYRFSPQVSPTTQVARWTSVNSGGVAGYPQTPAMTPRGGWGVEEQEQQQQHMTSSPVAAAATTPWLSSVPRSFVPPPREMVVPASGAKRRISKVEEEDEDRDDEDLSAASDEDQCGSMSPDPEIQEMFRSKEARAALLLLRLSDVDGSQMLSSHRDKRVRRAST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.19
4 0.2
5 0.22
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.21
10 0.17
11 0.21
12 0.26
13 0.26
14 0.23
15 0.26
16 0.29
17 0.31
18 0.35
19 0.38
20 0.39
21 0.48
22 0.55
23 0.63
24 0.69
25 0.74
26 0.79
27 0.81
28 0.83
29 0.83
30 0.84
31 0.82
32 0.75
33 0.71
34 0.65
35 0.59
36 0.53
37 0.47
38 0.45
39 0.38
40 0.36
41 0.36
42 0.37
43 0.36
44 0.4
45 0.45
46 0.44
47 0.51
48 0.55
49 0.53
50 0.52
51 0.5
52 0.44
53 0.38
54 0.39
55 0.32
56 0.26
57 0.22
58 0.21
59 0.2
60 0.25
61 0.23
62 0.23
63 0.23
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.34
68 0.3
69 0.35
70 0.37
71 0.4
72 0.37
73 0.4
74 0.43
75 0.42
76 0.45
77 0.45
78 0.4
79 0.4
80 0.41
81 0.47
82 0.53
83 0.56
84 0.57
85 0.55
86 0.52
87 0.51
88 0.58
89 0.52
90 0.49
91 0.49
92 0.48
93 0.53
94 0.59
95 0.57
96 0.52
97 0.52
98 0.46
99 0.4
100 0.38
101 0.29
102 0.23
103 0.23
104 0.22
105 0.22
106 0.2
107 0.16
108 0.13
109 0.16
110 0.23
111 0.22
112 0.22
113 0.21
114 0.21
115 0.19
116 0.21
117 0.17
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.1
127 0.12
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.22
132 0.26
133 0.3
134 0.3
135 0.34
136 0.4
137 0.46
138 0.54
139 0.58
140 0.63
141 0.67
142 0.7
143 0.68
144 0.65
145 0.59
146 0.57
147 0.53
148 0.45
149 0.37
150 0.31
151 0.27
152 0.24
153 0.24
154 0.19
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.1
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.17
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.12
195 0.11
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.17
208 0.16
209 0.18
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.15
214 0.14
215 0.11
216 0.11
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.21
251 0.23
252 0.19
253 0.15
254 0.17
255 0.17
256 0.16
257 0.14
258 0.11
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.1
272 0.12
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.18
277 0.18
278 0.2
279 0.18
280 0.21
281 0.19
282 0.23
283 0.3
284 0.38
285 0.47
286 0.53
287 0.59
288 0.64
289 0.75
290 0.79
291 0.8
292 0.81
293 0.83
294 0.85
295 0.89
296 0.9
297 0.88
298 0.85
299 0.81
300 0.75
301 0.65
302 0.55
303 0.46
304 0.34
305 0.25
306 0.19
307 0.14
308 0.09
309 0.07
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.06
319 0.08
320 0.1
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.17
325 0.2
326 0.21
327 0.23
328 0.27
329 0.29
330 0.36
331 0.36
332 0.38
333 0.35
334 0.39
335 0.36
336 0.33
337 0.31
338 0.26
339 0.25
340 0.23
341 0.23
342 0.22
343 0.22
344 0.17
345 0.16
346 0.13
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.09
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.13
360 0.16
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.19
366 0.21
367 0.21
368 0.23
369 0.24
370 0.24
371 0.24
372 0.2
373 0.18
374 0.18
375 0.18
376 0.13
377 0.14
378 0.13
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.08
383 0.07
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.14
391 0.17
392 0.18
393 0.19
394 0.24
395 0.29
396 0.36
397 0.42
398 0.41
399 0.4
400 0.39
401 0.39
402 0.36
403 0.34
404 0.28
405 0.25
406 0.24
407 0.27
408 0.27
409 0.29
410 0.31
411 0.34
412 0.34
413 0.38
414 0.4
415 0.42
416 0.47
417 0.52
418 0.53
419 0.52
420 0.52
421 0.48
422 0.45
423 0.38
424 0.31
425 0.23
426 0.18
427 0.13
428 0.11
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.13
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.19
444 0.2
445 0.21
446 0.22
447 0.2
448 0.23
449 0.26
450 0.27
451 0.29
452 0.29
453 0.28
454 0.32
455 0.33
456 0.28
457 0.26
458 0.26
459 0.22
460 0.25
461 0.25
462 0.2
463 0.19
464 0.17
465 0.17
466 0.14
467 0.12
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.17
475 0.22
476 0.29
477 0.37
478 0.44
479 0.49
480 0.58