Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R1EFH6

Protein Details
Accession R1EFH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-135SPRPSGRFYDRGNKRKRRHNDDDYDDRRDERRPTRQRRTEEPTVAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-107KRKRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
KEGG npa:UCRNP2_6835  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MASAMEGIAYQDASTYHQDIREVASDFRQRALEDGEIEVDAPSRSNYYSVYCDWDKAGDFYRPAPRSRTHARWAHVSEHDLDDDNMADVSPRPSGRFYDRGNKRKRRHNDDDYDDRRDERRPTRQRRTEEPTVAKLRKQLLSIAESLARDSEDDARDIARLASDNYEDEEFRLSFLHLSVQLSVTEQPFKIPFTAAVILYLNDAKPEFVKEVLDAVQKIAQEKLEAGDWRVFKLLLRFLACLQGLFEGEGVFSVLDELFSRAVDLQAASSEDTVGLELVKIILLTIPYVISSGAPGVQQAASDILEKTEIVASASHVLEAMVEQYPGVGGSNDDKPFGYQSVIGLLQKQLQNEAAKDWKLSFLPKVHNPVKRENGSEETKEPVKYAFPAINIPSPVNGGPRPLFPESYFSLFADQDVETVPKTSDIAASLLRDSLVDTINILDYSRNAVAGFLINIDCYWAPDTFVKRGTPFDRLKETDEQTTWKPEDIIVDAVFSQIFTLPAPEHKLVYYHSLITEACKLAPGAIAPSLGRAIRFLFRHVDVMDMELSYRFMDWFAHHLSNFDFRWKWSEWSDEVNMPDIHPRKAFIIGALDKEIRLSFAKRIRETLPPDWPNLITEAKEKDTPDFKYESDQTPYAPQGRELLSLLKKKASEDEIQKVINSIHEQAAEHDVADVLTPSTDAYVTCICYIGSKSLSHVLSCIERCKERLLAIGPASETARKQIITSVTEYWKDQPGIAVNIVDKLLNYTILSPMCVVQWALSDRLGAGGALSESWIFEMVAGTVGKVTNRVRQIVAARLQKGLPEEQVQLLDDTLTKERDAMRQLFQVIDDVTSGVAQGAADGFIEADGSEGMDEEKGKLIKAWGERWSRVFRRKAAVEEAIVGESIVEVKVAALNAAVEAEKAAAEQAAAEAEAAAAETAAAEAAAAEEGANGTADLMTVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.19
4 0.21
5 0.22
6 0.22
7 0.26
8 0.27
9 0.26
10 0.25
11 0.3
12 0.35
13 0.35
14 0.37
15 0.35
16 0.3
17 0.31
18 0.33
19 0.28
20 0.23
21 0.23
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.14
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.14
34 0.16
35 0.21
36 0.22
37 0.28
38 0.28
39 0.29
40 0.28
41 0.29
42 0.27
43 0.25
44 0.28
45 0.25
46 0.26
47 0.3
48 0.39
49 0.4
50 0.42
51 0.44
52 0.44
53 0.47
54 0.55
55 0.57
56 0.57
57 0.61
58 0.61
59 0.65
60 0.65
61 0.64
62 0.58
63 0.53
64 0.47
65 0.42
66 0.4
67 0.32
68 0.28
69 0.22
70 0.18
71 0.16
72 0.13
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.19
81 0.24
82 0.3
83 0.36
84 0.4
85 0.46
86 0.56
87 0.64
88 0.73
89 0.79
90 0.8
91 0.83
92 0.88
93 0.88
94 0.88
95 0.89
96 0.88
97 0.86
98 0.89
99 0.84
100 0.8
101 0.71
102 0.64
103 0.55
104 0.51
105 0.51
106 0.49
107 0.54
108 0.59
109 0.68
110 0.76
111 0.83
112 0.85
113 0.85
114 0.85
115 0.83
116 0.82
117 0.77
118 0.75
119 0.75
120 0.71
121 0.64
122 0.61
123 0.57
124 0.51
125 0.46
126 0.42
127 0.36
128 0.37
129 0.36
130 0.32
131 0.29
132 0.25
133 0.25
134 0.21
135 0.16
136 0.13
137 0.13
138 0.17
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.15
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.17
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.14
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.17
171 0.15
172 0.17
173 0.16
174 0.17
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.17
179 0.15
180 0.17
181 0.19
182 0.16
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.16
200 0.18
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.18
206 0.17
207 0.15
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.2
221 0.22
222 0.21
223 0.23
224 0.23
225 0.22
226 0.27
227 0.26
228 0.21
229 0.18
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.07
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.16
325 0.14
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.14
337 0.17
338 0.18
339 0.18
340 0.2
341 0.2
342 0.19
343 0.19
344 0.18
345 0.17
346 0.16
347 0.18
348 0.19
349 0.19
350 0.25
351 0.28
352 0.36
353 0.41
354 0.45
355 0.47
356 0.51
357 0.54
358 0.51
359 0.5
360 0.45
361 0.44
362 0.43
363 0.41
364 0.35
365 0.3
366 0.3
367 0.27
368 0.24
369 0.19
370 0.16
371 0.15
372 0.16
373 0.14
374 0.13
375 0.15
376 0.16
377 0.18
378 0.18
379 0.17
380 0.15
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.18
389 0.18
390 0.18
391 0.16
392 0.2
393 0.19
394 0.22
395 0.21
396 0.17
397 0.18
398 0.16
399 0.16
400 0.14
401 0.12
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.07
447 0.06
448 0.07
449 0.1
450 0.13
451 0.14
452 0.16
453 0.17
454 0.16
455 0.2
456 0.21
457 0.26
458 0.26
459 0.28
460 0.31
461 0.32
462 0.35
463 0.36
464 0.36
465 0.31
466 0.29
467 0.29
468 0.24
469 0.27
470 0.24
471 0.18
472 0.17
473 0.14
474 0.15
475 0.13
476 0.14
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.06
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.07
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.17
497 0.16
498 0.13
499 0.12
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.15
504 0.11
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.08
521 0.12
522 0.12
523 0.14
524 0.16
525 0.16
526 0.18
527 0.18
528 0.18
529 0.13
530 0.14
531 0.13
532 0.1
533 0.09
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.1
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.15
547 0.16
548 0.2
549 0.19
550 0.2
551 0.17
552 0.16
553 0.21
554 0.22
555 0.24
556 0.21
557 0.25
558 0.22
559 0.26
560 0.28
561 0.25
562 0.24
563 0.25
564 0.23
565 0.19
566 0.24
567 0.21
568 0.21
569 0.19
570 0.2
571 0.17
572 0.19
573 0.19
574 0.14
575 0.18
576 0.17
577 0.18
578 0.2
579 0.19
580 0.16
581 0.17
582 0.16
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.16
587 0.22
588 0.29
589 0.29
590 0.33
591 0.34
592 0.39
593 0.44
594 0.43
595 0.47
596 0.42
597 0.43
598 0.41
599 0.39
600 0.32
601 0.28
602 0.24
603 0.15
604 0.17
605 0.18
606 0.19
607 0.21
608 0.21
609 0.22
610 0.26
611 0.28
612 0.28
613 0.27
614 0.25
615 0.28
616 0.31
617 0.31
618 0.3
619 0.28
620 0.25
621 0.26
622 0.29
623 0.28
624 0.24
625 0.21
626 0.21
627 0.21
628 0.22
629 0.2
630 0.23
631 0.24
632 0.29
633 0.29
634 0.29
635 0.28
636 0.28
637 0.31
638 0.29
639 0.3
640 0.31
641 0.36
642 0.37
643 0.36
644 0.35
645 0.32
646 0.28
647 0.24
648 0.2
649 0.16
650 0.14
651 0.15
652 0.15
653 0.16
654 0.19
655 0.16
656 0.14
657 0.12
658 0.1
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.05
668 0.05
669 0.07
670 0.08
671 0.1
672 0.1
673 0.1
674 0.1
675 0.11
676 0.12
677 0.13
678 0.14
679 0.13
680 0.15
681 0.21
682 0.21
683 0.2
684 0.19
685 0.18
686 0.21
687 0.23
688 0.26
689 0.23
690 0.24
691 0.26
692 0.29
693 0.3
694 0.26
695 0.29
696 0.27
697 0.28
698 0.27
699 0.27
700 0.24
701 0.22
702 0.22
703 0.19
704 0.16
705 0.14
706 0.16
707 0.14
708 0.14
709 0.18
710 0.21
711 0.22
712 0.25
713 0.27
714 0.28
715 0.29
716 0.3
717 0.29
718 0.3
719 0.28
720 0.25
721 0.23
722 0.23
723 0.24
724 0.23
725 0.22
726 0.16
727 0.17
728 0.17
729 0.14
730 0.11
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.13
737 0.13
738 0.13
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.07
745 0.11
746 0.13
747 0.14
748 0.13
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.09
754 0.06
755 0.06
756 0.05
757 0.05
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.06
763 0.05
764 0.05
765 0.05
766 0.05
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.09
772 0.09
773 0.14
774 0.17
775 0.21
776 0.25
777 0.27
778 0.27
779 0.31
780 0.35
781 0.37
782 0.43
783 0.43
784 0.41
785 0.4
786 0.4
787 0.37
788 0.36
789 0.31
790 0.27
791 0.23
792 0.24
793 0.23
794 0.24
795 0.23
796 0.2
797 0.17
798 0.15
799 0.12
800 0.13
801 0.15
802 0.15
803 0.14
804 0.16
805 0.19
806 0.24
807 0.29
808 0.3
809 0.31
810 0.33
811 0.35
812 0.33
813 0.3
814 0.28
815 0.22
816 0.18
817 0.14
818 0.11
819 0.1
820 0.09
821 0.08
822 0.06
823 0.05
824 0.05
825 0.05
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.05
831 0.04
832 0.05
833 0.04
834 0.04
835 0.04
836 0.04
837 0.04
838 0.04
839 0.05
840 0.06
841 0.07
842 0.08
843 0.13
844 0.13
845 0.14
846 0.15
847 0.18
848 0.22
849 0.28
850 0.32
851 0.36
852 0.42
853 0.46
854 0.51
855 0.58
856 0.61
857 0.65
858 0.67
859 0.64
860 0.67
861 0.68
862 0.67
863 0.65
864 0.6
865 0.52
866 0.47
867 0.42
868 0.33
869 0.28
870 0.22
871 0.15
872 0.1
873 0.1
874 0.07
875 0.05
876 0.04
877 0.05
878 0.07
879 0.07
880 0.07
881 0.06
882 0.07
883 0.07
884 0.08
885 0.08
886 0.06
887 0.06
888 0.06
889 0.06
890 0.06
891 0.06
892 0.05
893 0.05
894 0.05
895 0.06
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.05
900 0.05
901 0.05
902 0.05
903 0.04
904 0.04
905 0.03
906 0.03
907 0.03
908 0.03
909 0.03
910 0.03
911 0.03
912 0.03
913 0.04
914 0.04
915 0.04
916 0.04
917 0.05
918 0.05
919 0.06
920 0.05
921 0.05
922 0.05