FuNGI

R1GSQ6

Protein Details

Accession

R1GSQ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
141-167	LSYKDIMKKREREREERERQEKKARGE	Basic
188-211	GTNGATGGRKRKKRWDVSSEDASA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
148-165	KKREREREERERQEKKAR
196-201	RKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 17, cyto 4.5, cyto_nucl 4.5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
KEGG	npa:UCRNP2_4216 -
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFEAITRLQQERNAAASGKKGSKTFDPANQRTDNSTKASLTESFDTDLYERNGGNKYDGYLTSIPANDDEDMEDVEDGRRLVGQYTATRAQMDEFTTGDGMEEDILMDREKQAQIQSRETDYQRRRFERGGGDEEGLSYKDIMKKREREREERERQEKKARGEEVEEHQPTLKDGSDKENVENGTNGATGGRKRKKRWDVSSEDASANGANGAVESEPKKRSRWDQTPSVPVPGAPDATPRRKSRWDQAPALGATPVGGTAGLATPAHPSQGGAAVLSFGTDISGRNAPISDEELDELLPGEDKGYKILIPPPGYEPVRAPAKKVAATPTPAGLAGGFMMQEPADTRALGKQLPSEIPGVGELQFFKAEDMQYFGKLMDGQDEEELSVDEMKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARNFGAGPLFNQILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDMVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHPDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLKGLVDCIGDNLNDEQTKVRTVTALAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTGQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVISQCASTEGVTAGYLKENVLNEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVVNLKDESEPYRKMTVETLEKVIASLGAADIGERLEERLIDGILHAFQEQSIEDVVMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLVSRIALVMKQCGEDSLMGKLGTVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNIFETSPHVIDRIIEAIEAVRVAVGTGVVMNYVWAGLFHPARKVRQPYWRLYNDAYVHSADSMVPYYPDMGDPNCVRHELNIIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.26
3	0.29
4	0.31
5	0.29
6	0.29
7	0.32
8	0.36
9	0.38
10	0.39
11	0.37
12	0.39
13	0.43
14	0.5
15	0.5
16	0.52
17	0.56
18	0.58
19	0.64
20	0.64
21	0.6
22	0.58
23	0.56
24	0.52
25	0.46
26	0.45
27	0.38
28	0.34
29	0.36
30	0.32
31	0.33
32	0.31
33	0.28
34	0.26
35	0.26
36	0.26
37	0.23
38	0.25
39	0.23
40	0.22
41	0.2
42	0.22
43	0.27
44	0.26
45	0.29
46	0.25
47	0.25
48	0.26
49	0.26
50	0.28
51	0.25
52	0.25
53	0.26
54	0.26
55	0.25
56	0.21
57	0.23
58	0.17
59	0.17
60	0.17
61	0.14
62	0.13
63	0.13
64	0.12
65	0.1
66	0.11
67	0.12
68	0.1
69	0.09
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.13
74	0.17
75	0.18
76	0.25
77	0.28
78	0.28
79	0.28
80	0.27
81	0.26
82	0.25
83	0.24
84	0.19
85	0.16
86	0.17
87	0.16
88	0.15
89	0.14
90	0.11
91	0.09
92	0.07
93	0.07
94	0.06
95	0.07
96	0.08
97	0.08
98	0.09
99	0.1
100	0.14
101	0.15
102	0.17
103	0.23
104	0.31
105	0.35
106	0.41
107	0.44
108	0.45
109	0.5
110	0.52
111	0.56
112	0.56
113	0.61
114	0.64
115	0.65
116	0.65
117	0.62
118	0.65
119	0.64
120	0.62
121	0.59
122	0.52
123	0.48
124	0.43
125	0.4
126	0.34
127	0.25
128	0.19
129	0.13
130	0.14
131	0.19
132	0.24
133	0.3
134	0.37
135	0.46
136	0.56
137	0.66
138	0.7
139	0.73
140	0.79
141	0.84
142	0.85
143	0.86
144	0.87
145	0.84
146	0.83
147	0.84
148	0.81
149	0.77
150	0.76
151	0.69
152	0.62
153	0.6
154	0.58
155	0.54
156	0.57
157	0.5
158	0.42
159	0.4
160	0.37
161	0.32
162	0.29
163	0.25
164	0.18
165	0.18
166	0.24
167	0.29
168	0.3
169	0.31
170	0.34
171	0.33
172	0.31
173	0.3
174	0.24
175	0.19
176	0.17
177	0.15
178	0.11
179	0.13
180	0.16
181	0.26
182	0.35
183	0.42
184	0.49
185	0.6
186	0.69
187	0.77
188	0.82
189	0.82
190	0.81
191	0.8
192	0.81
193	0.73
194	0.63
195	0.52
196	0.43
197	0.32
198	0.24
199	0.16
200	0.09
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.05
205	0.08
206	0.11
207	0.16
208	0.21
209	0.24
210	0.27
211	0.33
212	0.42
213	0.5
214	0.57
215	0.59
216	0.64
217	0.68
218	0.75
219	0.71
220	0.65
221	0.54
222	0.45
223	0.41
224	0.32
225	0.27
226	0.18
227	0.24
228	0.28
229	0.36
230	0.43
231	0.43
232	0.48
233	0.55
234	0.6
235	0.63
236	0.66
237	0.66
238	0.64
239	0.65
240	0.65
241	0.57
242	0.51
243	0.41
244	0.3
245	0.22
246	0.17
247	0.12
248	0.05
249	0.05
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.09
257	0.09
258	0.1
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.13
263	0.12
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.08
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.05
274	0.08
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.13
281	0.15
282	0.13
283	0.12
284	0.13
285	0.12
286	0.12
287	0.11
288	0.1
289	0.07
290	0.06
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.11
299	0.16
300	0.21
301	0.21
302	0.22
303	0.25
304	0.31
305	0.31
306	0.31
307	0.28
308	0.28
309	0.36
310	0.34
311	0.34
312	0.32
313	0.36
314	0.37
315	0.37
316	0.37
317	0.31
318	0.34
319	0.33
320	0.28
321	0.25
322	0.22
323	0.2
324	0.14
325	0.1
326	0.07
327	0.06
328	0.05
329	0.04
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.11
339	0.13
340	0.14
341	0.14
342	0.13
343	0.16
344	0.17
345	0.17
346	0.16
347	0.14
348	0.14
349	0.14
350	0.13
351	0.1
352	0.1
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.1
359	0.1
360	0.09
361	0.13
362	0.13
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.11
367	0.12
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.11
372	0.11
373	0.12
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.13
384	0.14
385	0.16
386	0.19
387	0.24
388	0.26
389	0.35
390	0.42
391	0.44
392	0.49
393	0.49
394	0.47
395	0.49
396	0.49
397	0.45
398	0.45
399	0.43
400	0.42
401	0.45
402	0.44
403	0.42
404	0.48
405	0.5
406	0.45
407	0.43
408	0.42
409	0.46
410	0.53
411	0.5
412	0.42
413	0.33
414	0.31
415	0.3
416	0.27
417	0.19
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.14
438	0.15
439	0.15
440	0.13
441	0.14
442	0.13
443	0.17
444	0.19
445	0.17
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.13
452	0.13
453	0.14
454	0.14
455	0.15
456	0.17
457	0.16
458	0.17
459	0.18
460	0.19
461	0.16
462	0.15
463	0.13
464	0.14
465	0.14
466	0.13
467	0.12
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.06
473	0.04
474	0.03
475	0.04
476	0.05
477	0.05
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.07
482	0.09
483	0.1
484	0.12
485	0.12
486	0.14
487	0.14
488	0.14
489	0.14
490	0.12
491	0.1
492	0.07
493	0.07
494	0.05
495	0.05
496	0.04
497	0.04
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.06
505	0.07
506	0.1
507	0.14
508	0.15
509	0.15
510	0.19
511	0.2
512	0.21
513	0.22
514	0.18
515	0.15
516	0.15
517	0.15
518	0.13
519	0.12
520	0.12
521	0.1
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.05
528	0.04
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.02
535	0.03
536	0.03
537	0.04
538	0.06
539	0.08
540	0.11
541	0.16
542	0.2
543	0.23
544	0.28
545	0.37
546	0.45
547	0.53
548	0.56
549	0.58
550	0.61
551	0.65
552	0.62
553	0.57
554	0.5
555	0.45
556	0.44
557	0.38
558	0.33
559	0.26
560	0.24
561	0.19
562	0.17
563	0.13
564	0.08
565	0.06
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.05
570	0.05
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.08
580	0.08
581	0.08
582	0.09
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.08
587	0.08
588	0.08
589	0.1
590	0.09
591	0.09
592	0.08
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.07
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.05
602	0.03
603	0.02
604	0.02
605	0.02
606	0.02
607	0.02
608	0.02
609	0.03
610	0.03
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.05
621	0.05
622	0.06
623	0.08
624	0.13
625	0.22
626	0.24
627	0.25
628	0.31
629	0.34
630	0.36
631	0.36
632	0.37
633	0.31
634	0.3
635	0.29
636	0.24
637	0.2
638	0.18
639	0.15
640	0.08
641	0.05
642	0.04
643	0.03
644	0.04
645	0.03
646	0.04
647	0.05
648	0.05
649	0.04
650	0.07
651	0.08
652	0.08
653	0.08
654	0.08
655	0.07
656	0.08
657	0.08
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.06
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.06
668	0.08
669	0.08
670	0.1
671	0.12
672	0.13
673	0.13
674	0.14
675	0.16
676	0.13
677	0.15
678	0.14
679	0.13
680	0.16
681	0.21
682	0.21
683	0.19
684	0.19
685	0.18
686	0.18
687	0.17
688	0.14
689	0.09
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.07
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.08
698	0.08
699	0.09
700	0.11
701	0.11
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.12
706	0.15
707	0.15
708	0.17
709	0.21
710	0.22
711	0.23
712	0.31
713	0.36
714	0.4
715	0.48
716	0.5
717	0.5
718	0.58
719	0.56
720	0.49
721	0.46
722	0.4
723	0.36
724	0.31
725	0.27
726	0.2
727	0.21
728	0.2
729	0.16
730	0.15
731	0.1
732	0.09
733	0.08
734	0.07
735	0.05
736	0.05
737	0.06
738	0.07
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.07
743	0.11
744	0.11
745	0.12
746	0.11
747	0.12
748	0.13
749	0.14
750	0.18
751	0.18
752	0.2
753	0.21
754	0.24
755	0.23
756	0.23
757	0.25
758	0.26
759	0.27
760	0.27
761	0.26
762	0.23
763	0.23
764	0.22
765	0.19
766	0.14
767	0.08
768	0.06
769	0.04
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.04
774	0.03
775	0.04
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.05
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.07
788	0.06
789	0.05
790	0.05
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.05
796	0.05
797	0.06
798	0.06
799	0.05
800	0.05
801	0.04
802	0.03
803	0.03
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.04
809	0.04
810	0.04
811	0.08
812	0.09
813	0.12
814	0.12
815	0.13
816	0.14
817	0.2
818	0.3
819	0.29
820	0.31
821	0.3
822	0.33
823	0.33
824	0.32
825	0.29
826	0.21
827	0.22
828	0.21
829	0.21
830	0.25
831	0.26
832	0.27
833	0.29
834	0.32
835	0.37
836	0.4
837	0.39
838	0.33
839	0.33
840	0.32
841	0.29
842	0.26
843	0.19
844	0.14
845	0.12
846	0.12
847	0.1
848	0.1
849	0.09
850	0.07
851	0.1
852	0.1
853	0.11
854	0.11
855	0.11
856	0.12
857	0.12
858	0.12
859	0.12
860	0.13
861	0.12
862	0.12
863	0.12
864	0.11
865	0.09
866	0.09
867	0.07
868	0.05
869	0.06
870	0.06
871	0.08
872	0.08
873	0.08
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.06
878	0.06
879	0.05
880	0.04
881	0.04
882	0.04
883	0.05
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.05
894	0.08
895	0.08
896	0.09
897	0.1
898	0.13
899	0.14
900	0.13
901	0.16
902	0.15
903	0.16
904	0.19
905	0.2
906	0.24
907	0.26
908	0.27
909	0.27
910	0.29
911	0.33
912	0.37
913	0.45
914	0.45
915	0.5
916	0.53
917	0.59
918	0.62
919	0.63
920	0.61
921	0.6
922	0.57
923	0.53
924	0.5
925	0.42
926	0.35
927	0.28
928	0.23
929	0.14
930	0.11
931	0.08
932	0.08
933	0.08
934	0.09
935	0.1
936	0.11
937	0.14
938	0.17
939	0.19
940	0.22
941	0.23
942	0.23
943	0.25
944	0.25
945	0.24
946	0.24
947	0.22
948	0.21
949	0.18
950	0.18
951	0.19
952	0.18
953	0.19
954	0.15
955	0.18
956	0.22
957	0.22
958	0.24
959	0.22
960	0.27
961	0.33
962	0.43
963	0.49
964	0.5
965	0.59
966	0.65
967	0.72
968	0.67
969	0.6
970	0.51
971	0.41
972	0.36
973	0.28
974	0.2
975	0.11
976	0.13
977	0.12
978	0.12
979	0.11
980	0.11
981	0.11
982	0.1
983	0.1
984	0.07
985	0.07
986	0.08
987	0.1
988	0.12
989	0.12
990	0.13
991	0.14
992	0.16
993	0.19
994	0.26
995	0.31
996	0.35
997	0.38
998	0.41
999	0.41
1000	0.41
1001	0.38
1002	0.29
1003	0.25
1004	0.19
1005	0.15
1006	0.11
1007	0.09
1008	0.08
1009	0.07
1010	0.06
1011	0.04
1012	0.04
1013	0.04
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.06
1017	0.09
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.11
1021	0.16
1022	0.16
1023	0.18
1024	0.18
1025	0.17
1026	0.18
1027	0.18
1028	0.19
1029	0.2
1030	0.23
1031	0.25
1032	0.26
1033	0.24
1034	0.27
1035	0.27
1036	0.26
1037	0.2
1038	0.17
1039	0.14
1040	0.14
1041	0.15
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.13
1047	0.12
1048	0.12
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.11
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.08
1056	0.07
1057	0.08
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.07
1064	0.06
1065	0.07
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.1
1069	0.11
1070	0.14
1071	0.19
1072	0.21
1073	0.23
1074	0.2
1075	0.2
1076	0.22
1077	0.27
1078	0.3
1079	0.27
1080	0.27
1081	0.26
1082	0.26
1083	0.25
1084	0.23
1085	0.18
1086	0.11
1087	0.1
1088	0.08
1089	0.06
1090	0.05
1091	0.05
1092	0.05
1093	0.04
1094	0.04
1095	0.04
1096	0.03
1097	0.04
1098	0.05
1099	0.05
1100	0.06
1101	0.06
1102	0.07
1103	0.09
1104	0.09
1105	0.08
1106	0.08
1107	0.1
1108	0.11
1109	0.11
1110	0.1
1111	0.14
1112	0.21
1113	0.23
1114	0.24
1115	0.23
1116	0.21
1117	0.22
1118	0.23
1119	0.21
1120	0.14
1121	0.11
1122	0.11
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.1
1126	0.08
1127	0.06
1128	0.05
1129	0.05
1130	0.05
1131	0.05
1132	0.04
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.05
1137	0.05
1138	0.05
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.04
1142	0.06
1143	0.11
1144	0.15
1145	0.17
1146	0.25
1147	0.31
1148	0.36
1149	0.45
1150	0.53
1151	0.55
1152	0.62
1153	0.67
1154	0.69
1155	0.74
1156	0.74
1157	0.71
1158	0.66
1159	0.67
1160	0.6
1161	0.55
1162	0.49
1163	0.4
1164	0.35
1165	0.29
1166	0.27
1167	0.18
1168	0.16
1169	0.15
1170	0.12
1171	0.12
1172	0.12
1173	0.13
1174	0.13
1175	0.14
1176	0.15
1177	0.15
1178	0.22
1179	0.23
1180	0.27
1181	0.28
1182	0.29
1183	0.28
1184	0.27

R1GSQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer