FuNGI

F4RUY0

Protein Details

Accession

F4RUY0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
415-445	KDTAKPTTGNKSRRRARKRKPKNRTTAEDDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-438	NKSRRRARKRKPKNR
744-763	NRSQGPSRGKPRGSRGSMKG

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	mlr:MELLADRAFT_108979 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MDQSPQNEPIVLLPNSNEPILETNLTVEAHISITSTDIKSNSESMEISNSELNAETNESTTNIDSSTVKTEDEKCIKSEPNSDGLLEVTGETPQIELAQNVIVNQSNSQITLPQGQDLKSLDQAIEEAIRKATSQDPCQSQDSTFQPIQHAVTDLAASSSSYPTYPTMSTQPARNFVPNPSNPHFIGSDPLQYRNDSQTPHRPTAPNLPQDILHIIESDFTNADGTTIDERRETELSRITEELRIKVRLSRYQRARDEMSGSETETESNSDEVQIQSHLRPSNGEKVEDEEENQFSETDESDVDGSGDEEAERIKNNKLLETIKAEIDESCAMDSKPDNTNESLPHNSEPISSETLDSTNPTPTSVQTLPEGSAVSCEQDPHLDSTKTPAVSNQAAASESTHQEEVSPTHPVDTKDTAKPTTGNKSRRRARKRKPKNRTTAEDDESESGSGSDVNDMDVAIKIGPTTEHELKDVPAEIIELPFDNVPESDLKDIKSFGVIASLIDNIVVIKGDINMGYETVLDEGSMICWKDGTLIGKVFETFGAVTEPHYSIRLPSKLQEMSKNPTENKRFSTDTPVYFVPSQTSFLFTSHIQAQPKGTDASNLYDEEVTNVDEIEFSDDEAEAAYVRSCRNARKAAAMEKRQQTKPGANKVQSGPSYLPNPDLLISAGKHMLDKRPSDVLNYNDEDGDGADTDYSVLERPKGLDFNMTTPSISASASNNNNQNRNTSARSTNKRGSDSRGNNRSQGPSRGKPRGSRGSMKGGRNNSSSDQRDTHSKPPHNSGPSNSQFPSPSRADVIPSSTPTNWSNPSSSSTLPSTSFTPFIHPLPANPTHAVPQYVPQAFGGFGGYNPNPPVYNPYNYNLANSSGTASHNTPSYGFAPSLPNMSRIPTCQTYPTFPSQPQQQGYTGQTGFPTMSPNGFAINGYQPTQSSYYPPYTPSPLSMGSAQFQQQPQQQQRSFNPDSLPIQQPSVNGIHYNPRFFPPSNQPHLPPHPHQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.27
4	0.23
5	0.17
6	0.2
7	0.22
8	0.22
9	0.17
10	0.17
11	0.19
12	0.19
13	0.17
14	0.14
15	0.12
16	0.11
17	0.11
18	0.1
19	0.07
20	0.1
21	0.14
22	0.14
23	0.16
24	0.16
25	0.19
26	0.21
27	0.23
28	0.22
29	0.2
30	0.19
31	0.18
32	0.22
33	0.21
34	0.2
35	0.2
36	0.19
37	0.18
38	0.18
39	0.17
40	0.13
41	0.15
42	0.13
43	0.12
44	0.13
45	0.13
46	0.15
47	0.15
48	0.15
49	0.12
50	0.14
51	0.14
52	0.16
53	0.2
54	0.19
55	0.19
56	0.23
57	0.27
58	0.35
59	0.41
60	0.41
61	0.38
62	0.43
63	0.47
64	0.46
65	0.5
66	0.44
67	0.41
68	0.41
69	0.38
70	0.33
71	0.28
72	0.25
73	0.17
74	0.14
75	0.09
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.06
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.09
85	0.1
86	0.11
87	0.11
88	0.13
89	0.13
90	0.13
91	0.14
92	0.16
93	0.14
94	0.15
95	0.15
96	0.15
97	0.15
98	0.21
99	0.21
100	0.22
101	0.24
102	0.24
103	0.27
104	0.28
105	0.29
106	0.24
107	0.25
108	0.2
109	0.18
110	0.18
111	0.15
112	0.17
113	0.16
114	0.14
115	0.15
116	0.15
117	0.15
118	0.17
119	0.23
120	0.24
121	0.29
122	0.36
123	0.4
124	0.43
125	0.47
126	0.46
127	0.4
128	0.41
129	0.38
130	0.37
131	0.34
132	0.32
133	0.31
134	0.32
135	0.32
136	0.26
137	0.24
138	0.18
139	0.16
140	0.15
141	0.13
142	0.11
143	0.09
144	0.09
145	0.08
146	0.09
147	0.08
148	0.08
149	0.1
150	0.11
151	0.14
152	0.14
153	0.16
154	0.2
155	0.26
156	0.29
157	0.34
158	0.37
159	0.39
160	0.41
161	0.43
162	0.4
163	0.39
164	0.46
165	0.44
166	0.48
167	0.48
168	0.5
169	0.46
170	0.46
171	0.41
172	0.32
173	0.31
174	0.25
175	0.28
176	0.25
177	0.29
178	0.28
179	0.29
180	0.31
181	0.33
182	0.34
183	0.29
184	0.34
185	0.4
186	0.46
187	0.49
188	0.52
189	0.47
190	0.48
191	0.56
192	0.57
193	0.53
194	0.48
195	0.45
196	0.4
197	0.4
198	0.38
199	0.28
200	0.2
201	0.15
202	0.12
203	0.13
204	0.13
205	0.12
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.07
212	0.08
213	0.12
214	0.13
215	0.14
216	0.14
217	0.16
218	0.19
219	0.21
220	0.21
221	0.2
222	0.25
223	0.26
224	0.28
225	0.28
226	0.25
227	0.29
228	0.3
229	0.3
230	0.27
231	0.28
232	0.26
233	0.3
234	0.34
235	0.37
236	0.43
237	0.49
238	0.54
239	0.61
240	0.65
241	0.66
242	0.64
243	0.59
244	0.54
245	0.46
246	0.41
247	0.32
248	0.28
249	0.24
250	0.2
251	0.18
252	0.14
253	0.14
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.11
262	0.12
263	0.12
264	0.17
265	0.18
266	0.17
267	0.2
268	0.23
269	0.31
270	0.31
271	0.31
272	0.26
273	0.29
274	0.32
275	0.3
276	0.28
277	0.21
278	0.19
279	0.18
280	0.18
281	0.14
282	0.12
283	0.12
284	0.1
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.05
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.06
299	0.08
300	0.09
301	0.11
302	0.14
303	0.15
304	0.17
305	0.2
306	0.21
307	0.23
308	0.26
309	0.26
310	0.23
311	0.23
312	0.21
313	0.17
314	0.18
315	0.15
316	0.11
317	0.09
318	0.1
319	0.09
320	0.1
321	0.11
322	0.12
323	0.16
324	0.17
325	0.19
326	0.2
327	0.23
328	0.24
329	0.28
330	0.27
331	0.24
332	0.23
333	0.22
334	0.2
335	0.18
336	0.18
337	0.17
338	0.16
339	0.15
340	0.14
341	0.14
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.13
349	0.12
350	0.12
351	0.18
352	0.17
353	0.17
354	0.16
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.16
359	0.1
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.12
369	0.16
370	0.15
371	0.15
372	0.19
373	0.23
374	0.22
375	0.21
376	0.19
377	0.19
378	0.2
379	0.21
380	0.17
381	0.13
382	0.13
383	0.13
384	0.13
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.11
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.12
393	0.11
394	0.12
395	0.11
396	0.12
397	0.15
398	0.16
399	0.19
400	0.22
401	0.24
402	0.26
403	0.29
404	0.28
405	0.26
406	0.28
407	0.27
408	0.33
409	0.37
410	0.43
411	0.49
412	0.58
413	0.65
414	0.73
415	0.81
416	0.81
417	0.84
418	0.86
419	0.9
420	0.91
421	0.94
422	0.94
423	0.93
424	0.91
425	0.87
426	0.84
427	0.8
428	0.71
429	0.62
430	0.53
431	0.43
432	0.35
433	0.28
434	0.19
435	0.11
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.06
453	0.12
454	0.14
455	0.15
456	0.16
457	0.17
458	0.17
459	0.18
460	0.16
461	0.1
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.04
473	0.05
474	0.06
475	0.07
476	0.08
477	0.09
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.02
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.03
510	0.04
511	0.03
512	0.04
513	0.05
514	0.05
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.08
520	0.09
521	0.1
522	0.11
523	0.12
524	0.12
525	0.12
526	0.11
527	0.09
528	0.08
529	0.06
530	0.05
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.16
541	0.17
542	0.16
543	0.17
544	0.22
545	0.25
546	0.27
547	0.32
548	0.3
549	0.33
550	0.38
551	0.41
552	0.38
553	0.43
554	0.46
555	0.43
556	0.42
557	0.41
558	0.38
559	0.35
560	0.42
561	0.38
562	0.33
563	0.34
564	0.31
565	0.29
566	0.26
567	0.25
568	0.18
569	0.15
570	0.16
571	0.13
572	0.16
573	0.14
574	0.14
575	0.16
576	0.13
577	0.15
578	0.16
579	0.2
580	0.18
581	0.18
582	0.19
583	0.18
584	0.2
585	0.18
586	0.15
587	0.13
588	0.14
589	0.16
590	0.16
591	0.16
592	0.15
593	0.14
594	0.13
595	0.12
596	0.11
597	0.09
598	0.07
599	0.07
600	0.06
601	0.05
602	0.06
603	0.08
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.06
615	0.06
616	0.11
617	0.13
618	0.17
619	0.24
620	0.29
621	0.29
622	0.35
623	0.39
624	0.45
625	0.52
626	0.54
627	0.55
628	0.57
629	0.63
630	0.57
631	0.57
632	0.52
633	0.51
634	0.53
635	0.56
636	0.56
637	0.51
638	0.55
639	0.52
640	0.55
641	0.47
642	0.42
643	0.33
644	0.29
645	0.3
646	0.26
647	0.25
648	0.18
649	0.18
650	0.15
651	0.14
652	0.12
653	0.11
654	0.1
655	0.1
656	0.11
657	0.11
658	0.12
659	0.13
660	0.19
661	0.22
662	0.23
663	0.25
664	0.28
665	0.28
666	0.31
667	0.34
668	0.31
669	0.32
670	0.32
671	0.3
672	0.25
673	0.24
674	0.2
675	0.15
676	0.13
677	0.07
678	0.06
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.05
684	0.06
685	0.06
686	0.07
687	0.08
688	0.1
689	0.12
690	0.13
691	0.14
692	0.18
693	0.18
694	0.2
695	0.23
696	0.22
697	0.19
698	0.18
699	0.19
700	0.14
701	0.13
702	0.11
703	0.1
704	0.16
705	0.19
706	0.24
707	0.29
708	0.33
709	0.38
710	0.37
711	0.38
712	0.35
713	0.37
714	0.37
715	0.35
716	0.39
717	0.44
718	0.51
719	0.56
720	0.58
721	0.59
722	0.6
723	0.58
724	0.57
725	0.58
726	0.6
727	0.63
728	0.65
729	0.62
730	0.61
731	0.62
732	0.62
733	0.56
734	0.56
735	0.53
736	0.53
737	0.59
738	0.64
739	0.64
740	0.63
741	0.68
742	0.68
743	0.67
744	0.67
745	0.63
746	0.65
747	0.68
748	0.68
749	0.66
750	0.62
751	0.6
752	0.54
753	0.53
754	0.46
755	0.48
756	0.45
757	0.43
758	0.39
759	0.37
760	0.43
761	0.45
762	0.49
763	0.5
764	0.53
765	0.53
766	0.58
767	0.65
768	0.63
769	0.61
770	0.57
771	0.57
772	0.55
773	0.56
774	0.49
775	0.43
776	0.39
777	0.38
778	0.39
779	0.31
780	0.28
781	0.27
782	0.26
783	0.27
784	0.26
785	0.29
786	0.25
787	0.26
788	0.28
789	0.25
790	0.28
791	0.27
792	0.3
793	0.29
794	0.28
795	0.28
796	0.26
797	0.3
798	0.3
799	0.29
800	0.27
801	0.26
802	0.25
803	0.25
804	0.25
805	0.23
806	0.21
807	0.23
808	0.2
809	0.23
810	0.24
811	0.24
812	0.28
813	0.26
814	0.26
815	0.3
816	0.34
817	0.32
818	0.31
819	0.31
820	0.28
821	0.3
822	0.31
823	0.24
824	0.25
825	0.29
826	0.29
827	0.28
828	0.25
829	0.23
830	0.21
831	0.21
832	0.18
833	0.1
834	0.09
835	0.15
836	0.15
837	0.17
838	0.18
839	0.19
840	0.17
841	0.18
842	0.25
843	0.24
844	0.29
845	0.3
846	0.32
847	0.38
848	0.37
849	0.39
850	0.33
851	0.31
852	0.26
853	0.23
854	0.22
855	0.17
856	0.18
857	0.19
858	0.18
859	0.17
860	0.18
861	0.18
862	0.17
863	0.19
864	0.19
865	0.18
866	0.17
867	0.18
868	0.2
869	0.21
870	0.26
871	0.23
872	0.25
873	0.23
874	0.27
875	0.27
876	0.25
877	0.31
878	0.29
879	0.3
880	0.33
881	0.36
882	0.38
883	0.41
884	0.46
885	0.44
886	0.42
887	0.46
888	0.49
889	0.54
890	0.51
891	0.49
892	0.44
893	0.45
894	0.45
895	0.46
896	0.38
897	0.3
898	0.27
899	0.25
900	0.24
901	0.19
902	0.2
903	0.15
904	0.15
905	0.16
906	0.16
907	0.16
908	0.16
909	0.16
910	0.14
911	0.19
912	0.2
913	0.2
914	0.21
915	0.2
916	0.23
917	0.26
918	0.24
919	0.22
920	0.25
921	0.29
922	0.29
923	0.32
924	0.33
925	0.36
926	0.36
927	0.34
928	0.33
929	0.3
930	0.31
931	0.31
932	0.29
933	0.25
934	0.27
935	0.27
936	0.28
937	0.28
938	0.32
939	0.35
940	0.43
941	0.5
942	0.57
943	0.59
944	0.62
945	0.67
946	0.7
947	0.68
948	0.61
949	0.55
950	0.51
951	0.51
952	0.49
953	0.48
954	0.4
955	0.39
956	0.37
957	0.35
958	0.33
959	0.32
960	0.27
961	0.22
962	0.23
963	0.3
964	0.33
965	0.37
966	0.35
967	0.36
968	0.4
969	0.41
970	0.46
971	0.47
972	0.53
973	0.57
974	0.6
975	0.6
976	0.64
977	0.71

F4RUY0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer