Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7SD85

Protein Details
Accession M7SD85    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-315EEEEEKRKREEREREDRERRTREEQAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-318KKRREREEEEEKRKREEREREDRERRTREEQARL
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12.5, cyto 10.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ela:UCREL1_8885  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MDKHLDTRFDRVEKALGTLADSIAKYNPSTNSAREFVAADAELGKGLEELQTHQFNHRRLQDLRTASASLDAQIKDTLRLLANTRKELVSTPATVFPDGARHYYDIDYDELLRYARIISKTTMPPVLPAEPGISAAAPGEGVGVGGGGGSGIETAVTTPGGMATPGGGGNGGATPNGVQSSSAAAATNGMATPLPSQQSSSTNEPPPSSQQPPISTAGTSFNTVASTNTNTTLPEHINAHLNPQAAFEFAPWPGEDGVRGGGLAALAFLADRGVDPEGYDPEEEKKRREREEEEEKRKREEREREDRERRTREEQARLRARESEQAEAWRRASVVGGPGPGAGGVGGAGGVVPASSPTGEKRQFQFMGDLDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.32
3 0.25
4 0.24
5 0.23
6 0.21
7 0.2
8 0.19
9 0.17
10 0.16
11 0.18
12 0.16
13 0.2
14 0.21
15 0.23
16 0.27
17 0.29
18 0.32
19 0.33
20 0.33
21 0.3
22 0.29
23 0.23
24 0.23
25 0.19
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.1
37 0.16
38 0.21
39 0.22
40 0.3
41 0.36
42 0.37
43 0.45
44 0.47
45 0.49
46 0.47
47 0.51
48 0.52
49 0.5
50 0.5
51 0.44
52 0.39
53 0.32
54 0.33
55 0.28
56 0.21
57 0.22
58 0.18
59 0.17
60 0.19
61 0.19
62 0.17
63 0.18
64 0.19
65 0.15
66 0.17
67 0.2
68 0.25
69 0.3
70 0.31
71 0.32
72 0.3
73 0.29
74 0.29
75 0.3
76 0.25
77 0.23
78 0.22
79 0.25
80 0.26
81 0.25
82 0.24
83 0.19
84 0.21
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.19
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.22
107 0.24
108 0.26
109 0.28
110 0.24
111 0.24
112 0.25
113 0.25
114 0.19
115 0.17
116 0.15
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.1
185 0.13
186 0.17
187 0.22
188 0.25
189 0.27
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.3
194 0.32
195 0.29
196 0.29
197 0.29
198 0.29
199 0.32
200 0.33
201 0.29
202 0.23
203 0.21
204 0.21
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.19
225 0.19
226 0.2
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.13
233 0.13
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.02
257 0.02
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.08
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.17
269 0.26
270 0.27
271 0.31
272 0.39
273 0.45
274 0.51
275 0.57
276 0.57
277 0.58
278 0.67
279 0.73
280 0.75
281 0.77
282 0.73
283 0.73
284 0.73
285 0.71
286 0.69
287 0.69
288 0.68
289 0.7
290 0.77
291 0.8
292 0.85
293 0.87
294 0.87
295 0.84
296 0.8
297 0.77
298 0.78
299 0.75
300 0.76
301 0.74
302 0.75
303 0.77
304 0.73
305 0.68
306 0.63
307 0.57
308 0.55
309 0.5
310 0.45
311 0.38
312 0.43
313 0.47
314 0.45
315 0.43
316 0.36
317 0.33
318 0.28
319 0.27
320 0.21
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.16
328 0.13
329 0.07
330 0.04
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.02
340 0.03
341 0.04
342 0.05
343 0.07
344 0.12
345 0.22
346 0.27
347 0.33
348 0.36
349 0.44
350 0.46
351 0.46
352 0.48
353 0.4
354 0.42
355 0.37