Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7SDV3

Protein Details
Accession M7SDV3    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-110TLKAGKRKGTATKKPKEGRRLKKRTRDGDEADBasic
152-176IERAARKEVKKPAKRRKKDEVDLEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-104KAGKRKGTATKKPKEGRRLKKRTR
147-169RRRRAIERAARKEVKKPAKRRKK
415-421QKGKKKG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG ela:UCREL1_8630  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDGGSAAVSPPAAPSLHEEDPDDQPKELGDYDVADAGDSDKDSDALSEIDEDQFDDFNPENVHIDERPVDIDEDVARTLKAGKRKGTATKKPKEGRRLKKRTRDGDEADVPDGEILSSKRVRKGPEESEKPSPEPENEENLTPEERRRRAIERAARKEVKKPAKRRKKDEVDLEDELDEKIADLKLRMENACTADNKAREEGSPAVHKLKLLPEVMSLLNRNTNQAAVIDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDILTALTRLPIEKDTLLSSGIGKVVLFYTKSKRPEVGIKRVAERLLGEWSRPILKRTDDYKKRHVETRDFDYQAAKLRQATGSSQLTLTQRPAATSIRDAERERILAPTTTSNRARVVGLPSSYSIAPRSTFDPSRGPEHRPIGASGLEAFRKTFQKGKKKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.15
3 0.21
4 0.24
5 0.25
6 0.27
7 0.29
8 0.37
9 0.43
10 0.39
11 0.32
12 0.3
13 0.29
14 0.29
15 0.26
16 0.19
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.17
21 0.16
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.12
44 0.11
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.16
49 0.17
50 0.2
51 0.16
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.18
56 0.17
57 0.17
58 0.14
59 0.15
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.16
67 0.18
68 0.25
69 0.29
70 0.34
71 0.39
72 0.45
73 0.55
74 0.61
75 0.68
76 0.71
77 0.74
78 0.79
79 0.82
80 0.84
81 0.85
82 0.85
83 0.86
84 0.86
85 0.88
86 0.88
87 0.9
88 0.92
89 0.91
90 0.88
91 0.86
92 0.8
93 0.77
94 0.72
95 0.64
96 0.55
97 0.45
98 0.36
99 0.27
100 0.22
101 0.13
102 0.09
103 0.07
104 0.11
105 0.16
106 0.19
107 0.25
108 0.29
109 0.32
110 0.36
111 0.44
112 0.49
113 0.55
114 0.59
115 0.58
116 0.63
117 0.63
118 0.58
119 0.53
120 0.46
121 0.37
122 0.37
123 0.34
124 0.32
125 0.3
126 0.3
127 0.28
128 0.27
129 0.28
130 0.22
131 0.25
132 0.27
133 0.28
134 0.3
135 0.33
136 0.36
137 0.41
138 0.5
139 0.53
140 0.55
141 0.61
142 0.67
143 0.69
144 0.66
145 0.67
146 0.67
147 0.69
148 0.67
149 0.7
150 0.72
151 0.77
152 0.84
153 0.86
154 0.87
155 0.86
156 0.85
157 0.84
158 0.8
159 0.75
160 0.67
161 0.6
162 0.49
163 0.39
164 0.31
165 0.2
166 0.13
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.09
173 0.1
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.18
180 0.16
181 0.17
182 0.19
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.15
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.18
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.17
200 0.15
201 0.13
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.13
206 0.1
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.11
274 0.17
275 0.23
276 0.27
277 0.29
278 0.3
279 0.32
280 0.41
281 0.47
282 0.51
283 0.52
284 0.51
285 0.52
286 0.53
287 0.5
288 0.41
289 0.33
290 0.24
291 0.25
292 0.23
293 0.2
294 0.18
295 0.2
296 0.25
297 0.25
298 0.25
299 0.22
300 0.25
301 0.31
302 0.37
303 0.47
304 0.5
305 0.56
306 0.64
307 0.69
308 0.7
309 0.7
310 0.7
311 0.68
312 0.65
313 0.66
314 0.65
315 0.57
316 0.54
317 0.49
318 0.43
319 0.43
320 0.38
321 0.32
322 0.25
323 0.26
324 0.27
325 0.27
326 0.27
327 0.26
328 0.26
329 0.25
330 0.24
331 0.26
332 0.26
333 0.26
334 0.26
335 0.24
336 0.22
337 0.22
338 0.25
339 0.23
340 0.24
341 0.25
342 0.28
343 0.28
344 0.32
345 0.34
346 0.35
347 0.35
348 0.34
349 0.31
350 0.29
351 0.26
352 0.23
353 0.23
354 0.28
355 0.29
356 0.35
357 0.37
358 0.37
359 0.37
360 0.37
361 0.37
362 0.32
363 0.33
364 0.31
365 0.3
366 0.29
367 0.28
368 0.29
369 0.27
370 0.25
371 0.21
372 0.18
373 0.18
374 0.19
375 0.21
376 0.26
377 0.28
378 0.3
379 0.36
380 0.37
381 0.45
382 0.47
383 0.5
384 0.51
385 0.53
386 0.54
387 0.49
388 0.47
389 0.41
390 0.38
391 0.33
392 0.28
393 0.27
394 0.25
395 0.23
396 0.23
397 0.25
398 0.28
399 0.31
400 0.36
401 0.4