Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7SCV9

Protein Details
Accession M7SCV9    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-62EAPVSDRKEKSGKKSRSRKRHRDTTDTAEAEAEGTERKHKRSKSHVFPEDTBasic
74-105VNGNGDSKKEKKSRKSKKDKKRHESQEEEMPEBasic
107-133AVIPNNQDKKKEKRRRHKDGAKASEPMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-33RKEKSGKKSRSRKRHR
81-96KKEKKSRKSKKDKKRH
115-127KKKEKRRRHKDGA
409-422RRKLKQGGGVLRKP
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG ela:UCREL1_9012  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSTAMAENNEVEAPVSDRKEKSGKKSRSRKRHRDTTDTAEAEAEGTERKHKRSKSHVFPEDTSHIITDQTEIPVNGNGDSKKEKKSRKSKKDKKRHESQEEEMPESAVIPNNQDKKKEKRRRHKDGAKASEPMDIDSTPTQSKPVAKVPSDEAFPFFTQTVSQYLPLFPQGMIEPIEGYAEQHLRPLLNRYVPAFRGVLLAYRNPRIGEEPGKGSLTENSEFEETALLESVDEYAVGLAWLTVEADLFCPKRGSWMEGTLNLQSEGFIGVICFDMFNASIEASRLPSGWKWVDLLSGSKDKGKRQTGKIDAGAELPTTESQDEAQDEAQDEAQDGAQDEKEDDGTNQAHSTGYWVDESGSKINGKLRFRIKNYEVGSIGDYGYLSIEGTMLDEEAERAKVADDIETDRRRKLKQGGGVLRKPFKRLPEFSMTKFGKDDEQDDDILRSIGLKSKRPGGGNTAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.26
4 0.27
5 0.33
6 0.42
7 0.48
8 0.55
9 0.6
10 0.67
11 0.72
12 0.82
13 0.87
14 0.89
15 0.94
16 0.94
17 0.94
18 0.94
19 0.92
20 0.91
21 0.88
22 0.85
23 0.84
24 0.74
25 0.64
26 0.53
27 0.44
28 0.35
29 0.27
30 0.19
31 0.11
32 0.11
33 0.19
34 0.23
35 0.3
36 0.37
37 0.43
38 0.52
39 0.61
40 0.7
41 0.72
42 0.79
43 0.82
44 0.8
45 0.76
46 0.74
47 0.67
48 0.58
49 0.47
50 0.37
51 0.29
52 0.23
53 0.21
54 0.16
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.17
61 0.18
62 0.16
63 0.19
64 0.17
65 0.2
66 0.27
67 0.3
68 0.37
69 0.45
70 0.53
71 0.59
72 0.7
73 0.77
74 0.82
75 0.89
76 0.9
77 0.93
78 0.95
79 0.96
80 0.95
81 0.94
82 0.94
83 0.92
84 0.89
85 0.83
86 0.81
87 0.74
88 0.66
89 0.56
90 0.45
91 0.34
92 0.27
93 0.24
94 0.16
95 0.13
96 0.14
97 0.2
98 0.29
99 0.31
100 0.37
101 0.43
102 0.51
103 0.62
104 0.69
105 0.73
106 0.76
107 0.85
108 0.89
109 0.94
110 0.93
111 0.92
112 0.92
113 0.9
114 0.83
115 0.75
116 0.65
117 0.58
118 0.48
119 0.39
120 0.3
121 0.2
122 0.18
123 0.16
124 0.18
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.19
130 0.2
131 0.26
132 0.3
133 0.29
134 0.32
135 0.35
136 0.35
137 0.34
138 0.3
139 0.25
140 0.22
141 0.21
142 0.2
143 0.16
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.15
174 0.17
175 0.17
176 0.19
177 0.2
178 0.23
179 0.23
180 0.24
181 0.2
182 0.16
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.12
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.21
199 0.21
200 0.2
201 0.18
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.11
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.03
232 0.04
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.15
239 0.15
240 0.18
241 0.17
242 0.23
243 0.24
244 0.25
245 0.27
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.17
250 0.1
251 0.09
252 0.07
253 0.06
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.16
282 0.14
283 0.17
284 0.17
285 0.21
286 0.24
287 0.27
288 0.35
289 0.43
290 0.47
291 0.49
292 0.58
293 0.6
294 0.62
295 0.61
296 0.54
297 0.45
298 0.39
299 0.33
300 0.23
301 0.17
302 0.12
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.13
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.12
344 0.15
345 0.14
346 0.16
347 0.15
348 0.17
349 0.22
350 0.28
351 0.29
352 0.34
353 0.42
354 0.48
355 0.52
356 0.6
357 0.57
358 0.6
359 0.59
360 0.57
361 0.49
362 0.42
363 0.38
364 0.3
365 0.27
366 0.18
367 0.15
368 0.1
369 0.09
370 0.07
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.12
390 0.17
391 0.27
392 0.34
393 0.36
394 0.39
395 0.44
396 0.45
397 0.51
398 0.54
399 0.53
400 0.55
401 0.63
402 0.68
403 0.73
404 0.77
405 0.78
406 0.77
407 0.71
408 0.69
409 0.63
410 0.61
411 0.61
412 0.59
413 0.58
414 0.6
415 0.64
416 0.61
417 0.67
418 0.59
419 0.52
420 0.48
421 0.43
422 0.38
423 0.36
424 0.35
425 0.3
426 0.32
427 0.31
428 0.31
429 0.3
430 0.25
431 0.22
432 0.19
433 0.14
434 0.12
435 0.18
436 0.22
437 0.28
438 0.31
439 0.4
440 0.46
441 0.48
442 0.5