Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RZU8

Protein Details
Accession F4RZU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-81PAPPHQRGGEKRKARWRPKCSVKVRERLHRVMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-68RGGEKRKARWRPK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_110449  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MPTDDSHSDYSYQDEFTSYQPTHPTGRSDATPSRWPVHPQWDPEHDGPFPAPPHQRGGEKRKARWRPKCSVKVRERLHRVMTQKLWLAGRDRVGPLCEKFGVLGNTGNLYNLVVDQSPRCDCPDWLNGYVCKHLLFVFIKVLGVSPKLPWYFQKALLSTEVENIFSTAPEAPVVPTSALVRSIYADVKSQSKASGDLASRRKPIGEEDDCPICYDKLLSEPAQDLMFCDKVCGNSWHAECHHKYAKHLNLQGKNMICVYCRSDLKMPVSRVAGTRITGDGRINLAAAVGIPYMYSGPYVPPHNNFLLHSVSLSGLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.18
4 0.25
5 0.21
6 0.22
7 0.25
8 0.28
9 0.31
10 0.32
11 0.34
12 0.32
13 0.35
14 0.35
15 0.38
16 0.41
17 0.41
18 0.46
19 0.46
20 0.46
21 0.45
22 0.48
23 0.48
24 0.52
25 0.52
26 0.51
27 0.54
28 0.55
29 0.58
30 0.55
31 0.52
32 0.42
33 0.38
34 0.33
35 0.3
36 0.25
37 0.26
38 0.29
39 0.27
40 0.33
41 0.35
42 0.42
43 0.47
44 0.55
45 0.58
46 0.61
47 0.67
48 0.72
49 0.79
50 0.83
51 0.84
52 0.84
53 0.84
54 0.87
55 0.89
56 0.88
57 0.88
58 0.86
59 0.86
60 0.85
61 0.85
62 0.82
63 0.77
64 0.73
65 0.68
66 0.63
67 0.6
68 0.55
69 0.49
70 0.43
71 0.4
72 0.36
73 0.32
74 0.32
75 0.27
76 0.27
77 0.26
78 0.25
79 0.23
80 0.23
81 0.25
82 0.22
83 0.22
84 0.2
85 0.17
86 0.16
87 0.19
88 0.18
89 0.15
90 0.16
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.2
110 0.26
111 0.27
112 0.28
113 0.3
114 0.29
115 0.29
116 0.3
117 0.25
118 0.19
119 0.15
120 0.12
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.12
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.2
138 0.22
139 0.24
140 0.28
141 0.24
142 0.25
143 0.26
144 0.26
145 0.19
146 0.19
147 0.16
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.17
182 0.16
183 0.23
184 0.29
185 0.32
186 0.34
187 0.33
188 0.32
189 0.27
190 0.3
191 0.31
192 0.29
193 0.27
194 0.28
195 0.31
196 0.31
197 0.31
198 0.28
199 0.19
200 0.15
201 0.14
202 0.11
203 0.11
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.17
219 0.19
220 0.18
221 0.23
222 0.24
223 0.27
224 0.29
225 0.35
226 0.34
227 0.39
228 0.44
229 0.39
230 0.42
231 0.47
232 0.53
233 0.54
234 0.59
235 0.6
236 0.58
237 0.6
238 0.62
239 0.53
240 0.47
241 0.4
242 0.34
243 0.26
244 0.23
245 0.24
246 0.24
247 0.25
248 0.27
249 0.3
250 0.35
251 0.41
252 0.46
253 0.44
254 0.42
255 0.43
256 0.41
257 0.38
258 0.37
259 0.32
260 0.25
261 0.25
262 0.22
263 0.22
264 0.22
265 0.22
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.16
270 0.14
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.06
283 0.09
284 0.13
285 0.19
286 0.23
287 0.26
288 0.32
289 0.34
290 0.35
291 0.34
292 0.33
293 0.32
294 0.28
295 0.25
296 0.21