Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AK59

Protein Details
Accession Q5AK59    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAKTTKVKGNKKKSDTSKVVSKVHydrophilic
62-84EDPESKSQSKKEKQKAKDEAKLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044773  DDX18/Has1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005635  C:nuclear envelope  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:1990417  P:snoRNA release from pre-rRNA  
KEGG cal:CAALFM_C504750CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17942  DEADc_DDX18  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAKTTKVKGNKKKSDTSKVVSKVSRKRSHEDSESEVEDNEKVVEELDADFDEVAGLLGDDIEDPESKSQSKKEKQKAKDEAKLEQLTKPQVSNEVPDNDNDDDSSEDVLFENADFSEPTMKAIKEMGFTKMTKVQAKTIPPLLAGRDVLGAAKTGSGKTLAFLIPAIELLYSLKIKPRNGTAVIIITPTRELALQIFGVARELMQFHSQTCGIVIGGADRRQEATKLAKGVNLLVATPGRLLDHLKNTQFVFSNLKALVIDEADRILEIGFEDEMKQIIKVLPNENRQSMLFSATQTTKVEDLARISLRPGPLYINVVPEKDVSTADGLEQGYVVCDSDKRFLLLFSFLKRNVKKKIIVFLSSCNSVKFYSELLNYIDLPVLDLHGKQKQQKRTNTFFEFCNAKQGILVCTDVAARGLDIPAVDWIVQFDPPDDPRDYIHRVGRTARGTQGKGKSLMFLTPSELGFLRYLKAAKVPLNEYEFPANKIANIQSQLTKLIKTNYLLNQSAKDGYRAYLQAYASHGLKTVYQIDKLDLKKVSASFGLDQVPRVNLSIGGTKTKKQKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.86
3 0.82
4 0.81
5 0.77
6 0.77
7 0.74
8 0.74
9 0.73
10 0.75
11 0.77
12 0.74
13 0.74
14 0.74
15 0.76
16 0.74
17 0.7
18 0.66
19 0.62
20 0.59
21 0.53
22 0.44
23 0.37
24 0.29
25 0.24
26 0.18
27 0.12
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.04
42 0.04
43 0.03
44 0.03
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.1
52 0.13
53 0.15
54 0.19
55 0.26
56 0.35
57 0.44
58 0.54
59 0.62
60 0.7
61 0.76
62 0.84
63 0.87
64 0.86
65 0.85
66 0.78
67 0.74
68 0.73
69 0.7
70 0.62
71 0.55
72 0.51
73 0.48
74 0.46
75 0.42
76 0.34
77 0.34
78 0.33
79 0.33
80 0.33
81 0.32
82 0.3
83 0.3
84 0.33
85 0.28
86 0.27
87 0.23
88 0.18
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.12
104 0.12
105 0.15
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.21
110 0.22
111 0.2
112 0.22
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.27
117 0.29
118 0.33
119 0.35
120 0.35
121 0.37
122 0.39
123 0.43
124 0.44
125 0.43
126 0.39
127 0.34
128 0.34
129 0.29
130 0.26
131 0.22
132 0.18
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.13
161 0.17
162 0.19
163 0.22
164 0.26
165 0.29
166 0.31
167 0.32
168 0.28
169 0.26
170 0.25
171 0.23
172 0.19
173 0.14
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.17
212 0.19
213 0.22
214 0.22
215 0.22
216 0.21
217 0.21
218 0.21
219 0.15
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.09
229 0.1
230 0.16
231 0.2
232 0.21
233 0.23
234 0.23
235 0.25
236 0.23
237 0.21
238 0.21
239 0.17
240 0.2
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.09
247 0.09
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.03
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.1
267 0.12
268 0.17
269 0.23
270 0.28
271 0.31
272 0.3
273 0.3
274 0.27
275 0.27
276 0.22
277 0.19
278 0.14
279 0.12
280 0.14
281 0.13
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.15
301 0.15
302 0.17
303 0.18
304 0.18
305 0.18
306 0.16
307 0.16
308 0.13
309 0.13
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.04
323 0.05
324 0.07
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.16
332 0.17
333 0.17
334 0.21
335 0.22
336 0.3
337 0.34
338 0.39
339 0.42
340 0.46
341 0.48
342 0.47
343 0.54
344 0.5
345 0.5
346 0.45
347 0.42
348 0.39
349 0.38
350 0.34
351 0.26
352 0.23
353 0.2
354 0.19
355 0.16
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.16
360 0.16
361 0.17
362 0.16
363 0.15
364 0.14
365 0.1
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.11
372 0.15
373 0.19
374 0.26
375 0.33
376 0.43
377 0.51
378 0.6
379 0.66
380 0.69
381 0.74
382 0.74
383 0.68
384 0.59
385 0.55
386 0.5
387 0.42
388 0.42
389 0.34
390 0.27
391 0.26
392 0.26
393 0.23
394 0.19
395 0.2
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.09
400 0.09
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.08
416 0.09
417 0.12
418 0.13
419 0.18
420 0.18
421 0.18
422 0.19
423 0.25
424 0.29
425 0.31
426 0.35
427 0.34
428 0.35
429 0.38
430 0.43
431 0.41
432 0.39
433 0.41
434 0.42
435 0.42
436 0.47
437 0.5
438 0.48
439 0.47
440 0.44
441 0.4
442 0.34
443 0.34
444 0.28
445 0.22
446 0.21
447 0.2
448 0.2
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.16
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.14
458 0.18
459 0.21
460 0.23
461 0.28
462 0.3
463 0.32
464 0.38
465 0.38
466 0.37
467 0.41
468 0.38
469 0.35
470 0.35
471 0.3
472 0.24
473 0.26
474 0.26
475 0.23
476 0.25
477 0.25
478 0.25
479 0.26
480 0.31
481 0.29
482 0.29
483 0.27
484 0.28
485 0.3
486 0.29
487 0.34
488 0.36
489 0.41
490 0.43
491 0.42
492 0.4
493 0.38
494 0.41
495 0.35
496 0.31
497 0.25
498 0.23
499 0.26
500 0.25
501 0.24
502 0.24
503 0.24
504 0.24
505 0.26
506 0.28
507 0.24
508 0.23
509 0.22
510 0.18
511 0.19
512 0.2
513 0.24
514 0.24
515 0.26
516 0.27
517 0.3
518 0.37
519 0.37
520 0.41
521 0.34
522 0.32
523 0.35
524 0.34
525 0.34
526 0.29
527 0.31
528 0.26
529 0.28
530 0.33
531 0.28
532 0.29
533 0.28
534 0.28
535 0.25
536 0.24
537 0.21
538 0.17
539 0.19
540 0.24
541 0.23
542 0.31
543 0.32
544 0.38
545 0.48