Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7SIZ4

Protein Details
Accession M7SIZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-255SGSSGKAKRERERKTKQLIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-118AARQGGGGAKGGRGAREQGGRGGRFPRTR
240-248KAKRERERK
264-319RPRGGRGGGGARGGARGEGRGEGRGEGRGGRGRGEGRGRGRGDFRGGRGGREGREG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15, cyto 14, nucl 8, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ela:UCREL1_8767  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MTCGKMSVASKNLFALLGNDEEDDTPKAPVKTVDKTTMRSTKRSVEPQAPTKPTANAGGARRAGPGGNEGAFRDRNAGSANNHRKPVDEAARQGGGGAKGGRGAREQGGRGGRFPRTRDDRQAKGPNTGNSEKQAAQSWGATDGDAEQKDEQVGEQIAQSELKDATAEDAETPAAELEPEDKSISYTEYLAQLAEKKLALDTSLDIRKPNEGSKSDKKWASAKELTKEENDEFISGSSGKAKRERERKTKQLIDIDQRYVEPDRPRGGRGGGGARGGARGEGRGEGRGEGRGGRGRGEGRGRGRGDFRGGRGGREGREGREGTSSSFNASDQSAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.19
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.16
10 0.17
11 0.15
12 0.15
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.26
17 0.29
18 0.35
19 0.4
20 0.47
21 0.47
22 0.51
23 0.58
24 0.61
25 0.59
26 0.56
27 0.55
28 0.55
29 0.59
30 0.63
31 0.61
32 0.61
33 0.65
34 0.68
35 0.73
36 0.68
37 0.63
38 0.57
39 0.52
40 0.45
41 0.41
42 0.36
43 0.32
44 0.31
45 0.35
46 0.34
47 0.33
48 0.31
49 0.28
50 0.25
51 0.2
52 0.19
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.19
58 0.2
59 0.19
60 0.21
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.22
65 0.21
66 0.31
67 0.41
68 0.42
69 0.46
70 0.45
71 0.44
72 0.45
73 0.49
74 0.47
75 0.41
76 0.39
77 0.4
78 0.4
79 0.38
80 0.34
81 0.28
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.1
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.13
90 0.15
91 0.17
92 0.2
93 0.21
94 0.23
95 0.29
96 0.28
97 0.3
98 0.31
99 0.33
100 0.34
101 0.36
102 0.39
103 0.41
104 0.46
105 0.54
106 0.58
107 0.56
108 0.61
109 0.69
110 0.61
111 0.6
112 0.6
113 0.53
114 0.52
115 0.5
116 0.43
117 0.35
118 0.37
119 0.31
120 0.27
121 0.26
122 0.2
123 0.19
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.12
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.19
195 0.2
196 0.23
197 0.23
198 0.23
199 0.31
200 0.39
201 0.45
202 0.49
203 0.49
204 0.48
205 0.48
206 0.49
207 0.49
208 0.48
209 0.46
210 0.46
211 0.48
212 0.47
213 0.43
214 0.43
215 0.35
216 0.31
217 0.26
218 0.2
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.1
224 0.14
225 0.16
226 0.19
227 0.25
228 0.32
229 0.4
230 0.49
231 0.59
232 0.63
233 0.71
234 0.77
235 0.81
236 0.81
237 0.79
238 0.78
239 0.75
240 0.74
241 0.69
242 0.62
243 0.53
244 0.46
245 0.42
246 0.35
247 0.34
248 0.29
249 0.29
250 0.33
251 0.33
252 0.35
253 0.34
254 0.34
255 0.31
256 0.3
257 0.3
258 0.25
259 0.24
260 0.23
261 0.21
262 0.2
263 0.18
264 0.15
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.13
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.2
278 0.24
279 0.23
280 0.24
281 0.27
282 0.27
283 0.32
284 0.38
285 0.4
286 0.4
287 0.48
288 0.47
289 0.47
290 0.49
291 0.46
292 0.48
293 0.45
294 0.43
295 0.45
296 0.44
297 0.41
298 0.45
299 0.46
300 0.4
301 0.45
302 0.45
303 0.38
304 0.45
305 0.44
306 0.38
307 0.39
308 0.38
309 0.33
310 0.36
311 0.33
312 0.28
313 0.28
314 0.26
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.15
319 0.2
320 0.19