FuNGI

M7SP56

Protein Details

Accession

M7SP56

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
127-147	TEDSSKKKSKDAKADKSEKSS	Hydrophilic
474-500	ADKEKEKEKEKDKDKVKEKEKGKDKDR	Basic
513-534	QTSTQSERPKRGGRGRGRKGGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
96-163	EKKANKAREAANAKSSKHGRHESQGGKSKGATEDSSKKKSKDAKADKSEKSSEKDKEKAKEPVKLLTK
476-498	KEKEKEKEKDKDKVKEKEKGKDK
520-536	RPKRGGRGRGRKGGGGG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	ela:UCREL1_4802 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MVQSSTWEDAKRTMNDSALVGPPYVEVAQFQKIPTAKKRTDPRQGTIDQDPEFQAFLQSLTQPTPTKEADNEQAPEETTPEDTKVTITPLVQYLKEKKANKAREAANAKSSKHGRHESQGGKSKGATEDSSKKKSKDAKADKSEKSSEKDKEKAKEPVKLLTKKAAAQEAAEAAKVVAAQATASKSAEESAQPKSRRAGIAAAAKILQRDLGLSPGSAHRRARQDAAKAEVVSKADTGKETKETKATPSAAPAAETSTSPASPSTPTAPKASASEGSRRSRNKASKQNTSKEDAKGKGSETSGTAAKPLPQPTPIILKRKDNTASSTPASPAPPAATLAPSTSTPTPPTGPKAATGKSTAASKSGSSQKKGGGSSQQPSVTAGATRAFIKHANPSQGITEALLKQVMETFGPVTFVEIDKRKGFAYVDFGDHDALIKGVAASPVTVAQGAVQVLERKEIVKKTTAAAPQQQNAADKEKEKEKEKDKDKVKEKEKGKDKDRASTSEGQGQDQTQTSTQSERPKRGGRGRGRKGGGGGGGGTQKEASAAATVATPGEAASSSSKAAPSAAPANAPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.34
3	0.34
4	0.32
5	0.29
6	0.26
7	0.22
8	0.19
9	0.17
10	0.18
11	0.16
12	0.13
13	0.11
14	0.13
15	0.18
16	0.19
17	0.2
18	0.24
19	0.27
20	0.34
21	0.42
22	0.48
23	0.48
24	0.56
25	0.66
26	0.7
27	0.77
28	0.77
29	0.74
30	0.73
31	0.71
32	0.68
33	0.64
34	0.61
35	0.51
36	0.47
37	0.42
38	0.34
39	0.32
40	0.26
41	0.2
42	0.13
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.13
47	0.14
48	0.19
49	0.2
50	0.22
51	0.26
52	0.26
53	0.28
54	0.29
55	0.33
56	0.34
57	0.38
58	0.38
59	0.34
60	0.33
61	0.31
62	0.28
63	0.24
64	0.19
65	0.16
66	0.16
67	0.15
68	0.15
69	0.14
70	0.15
71	0.15
72	0.17
73	0.16
74	0.15
75	0.16
76	0.2
77	0.23
78	0.23
79	0.28
80	0.32
81	0.39
82	0.47
83	0.48
84	0.53
85	0.6
86	0.67
87	0.67
88	0.68
89	0.63
90	0.65
91	0.68
92	0.62
93	0.61
94	0.57
95	0.53
96	0.53
97	0.54
98	0.49
99	0.51
100	0.55
101	0.49
102	0.52
103	0.6
104	0.58
105	0.62
106	0.66
107	0.6
108	0.54
109	0.5
110	0.47
111	0.4
112	0.37
113	0.3
114	0.27
115	0.35
116	0.41
117	0.49
118	0.51
119	0.49
120	0.54
121	0.61
122	0.63
123	0.64
124	0.68
125	0.7
126	0.75
127	0.83
128	0.8
129	0.77
130	0.76
131	0.69
132	0.63
133	0.61
134	0.58
135	0.56
136	0.59
137	0.59
138	0.58
139	0.61
140	0.66
141	0.62
142	0.63
143	0.57
144	0.59
145	0.61
146	0.6
147	0.56
148	0.53
149	0.51
150	0.47
151	0.48
152	0.43
153	0.34
154	0.29
155	0.28
156	0.23
157	0.21
158	0.17
159	0.14
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.07
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.08
173	0.09
174	0.1
175	0.11
176	0.12
177	0.18
178	0.25
179	0.27
180	0.29
181	0.31
182	0.34
183	0.32
184	0.31
185	0.28
186	0.26
187	0.31
188	0.3
189	0.28
190	0.25
191	0.24
192	0.22
193	0.19
194	0.14
195	0.07
196	0.08
197	0.07
198	0.09
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.14
203	0.18
204	0.2
205	0.22
206	0.25
207	0.31
208	0.33
209	0.38
210	0.37
211	0.4
212	0.39
213	0.42
214	0.39
215	0.34
216	0.32
217	0.28
218	0.24
219	0.19
220	0.16
221	0.12
222	0.1
223	0.11
224	0.12
225	0.11
226	0.17
227	0.19
228	0.2
229	0.23
230	0.23
231	0.25
232	0.29
233	0.3
234	0.24
235	0.24
236	0.26
237	0.22
238	0.22
239	0.19
240	0.14
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.09
250	0.1
251	0.13
252	0.15
253	0.17
254	0.18
255	0.19
256	0.18
257	0.19
258	0.19
259	0.19
260	0.18
261	0.23
262	0.28
263	0.31
264	0.36
265	0.37
266	0.39
267	0.44
268	0.51
269	0.53
270	0.57
271	0.6
272	0.65
273	0.71
274	0.73
275	0.68
276	0.65
277	0.6
278	0.55
279	0.54
280	0.45
281	0.4
282	0.34
283	0.32
284	0.29
285	0.25
286	0.21
287	0.16
288	0.16
289	0.14
290	0.13
291	0.13
292	0.1
293	0.13
294	0.16
295	0.17
296	0.16
297	0.16
298	0.17
299	0.18
300	0.27
301	0.28
302	0.33
303	0.33
304	0.39
305	0.39
306	0.44
307	0.46
308	0.38
309	0.39
310	0.35
311	0.36
312	0.3
313	0.3
314	0.26
315	0.24
316	0.23
317	0.18
318	0.15
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.1
327	0.09
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.13
332	0.15
333	0.16
334	0.17
335	0.2
336	0.21
337	0.2
338	0.23
339	0.26
340	0.25
341	0.25
342	0.25
343	0.23
344	0.21
345	0.23
346	0.2
347	0.17
348	0.16
349	0.15
350	0.18
351	0.26
352	0.29
353	0.28
354	0.31
355	0.32
356	0.36
357	0.36
358	0.34
359	0.33
360	0.33
361	0.34
362	0.36
363	0.33
364	0.29
365	0.3
366	0.27
367	0.2
368	0.16
369	0.14
370	0.1
371	0.1
372	0.11
373	0.1
374	0.11
375	0.12
376	0.13
377	0.2
378	0.23
379	0.27
380	0.27
381	0.28
382	0.27
383	0.27
384	0.25
385	0.18
386	0.18
387	0.14
388	0.13
389	0.13
390	0.11
391	0.1
392	0.12
393	0.11
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.14
404	0.17
405	0.21
406	0.21
407	0.22
408	0.21
409	0.22
410	0.22
411	0.19
412	0.23
413	0.21
414	0.22
415	0.21
416	0.22
417	0.2
418	0.19
419	0.18
420	0.11
421	0.09
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.09
439	0.12
440	0.12
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.19
445	0.22
446	0.24
447	0.25
448	0.27
449	0.28
450	0.34
451	0.38
452	0.38
453	0.43
454	0.46
455	0.43
456	0.45
457	0.45
458	0.41
459	0.4
460	0.4
461	0.35
462	0.32
463	0.34
464	0.39
465	0.43
466	0.47
467	0.52
468	0.56
469	0.63
470	0.68
471	0.73
472	0.74
473	0.78
474	0.81
475	0.82
476	0.81
477	0.8
478	0.8
479	0.8
480	0.81
481	0.81
482	0.78
483	0.77
484	0.72
485	0.73
486	0.7
487	0.65
488	0.62
489	0.6
490	0.56
491	0.55
492	0.52
493	0.44
494	0.41
495	0.37
496	0.33
497	0.26
498	0.26
499	0.19
500	0.21
501	0.21
502	0.24
503	0.28
504	0.35
505	0.42
506	0.46
507	0.53
508	0.58
509	0.67
510	0.72
511	0.77
512	0.77
513	0.81
514	0.83
515	0.85
516	0.8
517	0.73
518	0.66
519	0.6
520	0.5
521	0.4
522	0.32
523	0.25
524	0.25
525	0.22
526	0.2
527	0.15
528	0.14
529	0.13
530	0.12
531	0.1
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.05
541	0.06
542	0.06
543	0.08
544	0.1
545	0.12
546	0.13
547	0.15
548	0.16
549	0.15
550	0.17
551	0.15
552	0.18
553	0.22
554	0.22

M7SP56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer