Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PMJ1

Protein Details
Accession A0A1D8PMJ1    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-54MRVKKPTSKRTTTRMREGIKKKAAAKRRKDKKIAKKDVTWKSRKSKDPGIPASFHydrophilic
71-90EKERREQLKLQKQQERQEALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-47KKPTSKRTTTRMREGIKKKAAAKRRKDKKIAKKDVTWKSRKSKD
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030378  G_CP_dom  
IPR014813  Gnl3_N_dom  
IPR006073  GTP-bd  
IPR023179  GTP-bd_ortho_bundle_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG cal:CAALFM_C406210CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08701  GN3L_Grn1  
PF01926  MMR_HSR1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51721  G_CP  
CDD cd04178  Nucleostemin_like  
Amino Acid Sequences MRVKKPTSKRTTTRMREGIKKKAAAKRRKDKKIAKKDVTWKSRKSKDPGIPASFPYKDKIITELEEGRRIEKERREQLKLQKQQERQEALARGEIVEDDDEMDEDDQEEGDGANGLAALLESAQQAAKDYDGEDYEDNENEDMVDSEEDVEYEISDIEDTQDEEFGELEKSRKAYDKIFKTVVDEADVILYVLDARDPESTRSRKVEQAVLQNPGKRLILVLNKVDLIPTHALNQWLNFLKSSFPTVPVKAAPGATNSTSFNKNLTNSMTSDALLKALKSYASKSNLKRSIIVGVIGYPNVGKSSIINALTNRHGNNSKACPVGNQAGVTTSLREVKIDNKLKVLDSPGIVFPDEIVNTKKQSKTQQLAKLALLSAIPPKQIVDPIPAITMLLKKFSKDTEMADGLKNFYQLPPLPSSDLNEFVKHFLIHIARSKGRLGRGGVPNLESAAMSVLNDWRDGRIIGWTLPKASKSAAGVSSEEVDLDAPKSSLRGEKEPPKVEQTTIVSTWAKEFDLDGLLGDNFGLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.81
3 0.82
4 0.82
5 0.82
6 0.8
7 0.77
8 0.75
9 0.75
10 0.78
11 0.78
12 0.82
13 0.82
14 0.84
15 0.88
16 0.9
17 0.92
18 0.93
19 0.94
20 0.94
21 0.91
22 0.9
23 0.9
24 0.9
25 0.9
26 0.87
27 0.85
28 0.84
29 0.85
30 0.84
31 0.82
32 0.82
33 0.8
34 0.81
35 0.81
36 0.78
37 0.72
38 0.66
39 0.65
40 0.59
41 0.51
42 0.43
43 0.37
44 0.31
45 0.29
46 0.3
47 0.27
48 0.25
49 0.29
50 0.34
51 0.35
52 0.39
53 0.38
54 0.37
55 0.36
56 0.38
57 0.4
58 0.41
59 0.48
60 0.52
61 0.6
62 0.65
63 0.69
64 0.76
65 0.79
66 0.8
67 0.79
68 0.78
69 0.77
70 0.79
71 0.8
72 0.74
73 0.66
74 0.64
75 0.59
76 0.51
77 0.47
78 0.39
79 0.29
80 0.25
81 0.22
82 0.16
83 0.12
84 0.1
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.11
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.17
160 0.19
161 0.26
162 0.34
163 0.39
164 0.43
165 0.45
166 0.44
167 0.42
168 0.43
169 0.36
170 0.29
171 0.22
172 0.17
173 0.14
174 0.14
175 0.1
176 0.06
177 0.06
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.07
184 0.08
185 0.12
186 0.2
187 0.23
188 0.27
189 0.31
190 0.33
191 0.35
192 0.36
193 0.4
194 0.36
195 0.43
196 0.43
197 0.44
198 0.44
199 0.42
200 0.4
201 0.36
202 0.31
203 0.21
204 0.18
205 0.18
206 0.21
207 0.21
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.2
213 0.14
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.16
224 0.15
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.13
229 0.17
230 0.13
231 0.15
232 0.17
233 0.17
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.15
238 0.15
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.15
257 0.13
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.11
268 0.15
269 0.21
270 0.28
271 0.31
272 0.41
273 0.45
274 0.45
275 0.44
276 0.39
277 0.36
278 0.3
279 0.27
280 0.17
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.04
290 0.04
291 0.07
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.16
297 0.19
298 0.21
299 0.19
300 0.19
301 0.21
302 0.21
303 0.26
304 0.27
305 0.28
306 0.27
307 0.27
308 0.24
309 0.25
310 0.27
311 0.23
312 0.19
313 0.15
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.13
318 0.1
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.16
324 0.26
325 0.32
326 0.31
327 0.31
328 0.32
329 0.32
330 0.33
331 0.31
332 0.24
333 0.17
334 0.18
335 0.17
336 0.16
337 0.16
338 0.14
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.14
345 0.17
346 0.22
347 0.24
348 0.27
349 0.35
350 0.43
351 0.48
352 0.55
353 0.6
354 0.61
355 0.61
356 0.57
357 0.5
358 0.41
359 0.33
360 0.24
361 0.17
362 0.15
363 0.14
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.15
369 0.16
370 0.16
371 0.17
372 0.17
373 0.18
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.17
378 0.13
379 0.17
380 0.17
381 0.17
382 0.19
383 0.2
384 0.23
385 0.21
386 0.24
387 0.25
388 0.28
389 0.29
390 0.3
391 0.3
392 0.28
393 0.27
394 0.24
395 0.18
396 0.15
397 0.18
398 0.18
399 0.21
400 0.22
401 0.24
402 0.25
403 0.25
404 0.29
405 0.26
406 0.29
407 0.27
408 0.25
409 0.24
410 0.23
411 0.24
412 0.21
413 0.18
414 0.18
415 0.19
416 0.2
417 0.27
418 0.32
419 0.32
420 0.34
421 0.38
422 0.38
423 0.39
424 0.4
425 0.37
426 0.4
427 0.45
428 0.48
429 0.45
430 0.42
431 0.39
432 0.34
433 0.31
434 0.21
435 0.14
436 0.1
437 0.09
438 0.07
439 0.08
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.15
449 0.16
450 0.18
451 0.24
452 0.24
453 0.26
454 0.29
455 0.29
456 0.26
457 0.26
458 0.27
459 0.23
460 0.27
461 0.26
462 0.26
463 0.26
464 0.26
465 0.27
466 0.22
467 0.2
468 0.15
469 0.13
470 0.11
471 0.11
472 0.1
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.12
477 0.17
478 0.22
479 0.27
480 0.35
481 0.45
482 0.54
483 0.59
484 0.61
485 0.62
486 0.59
487 0.54
488 0.53
489 0.48
490 0.45
491 0.4
492 0.41
493 0.35
494 0.33
495 0.34
496 0.29
497 0.24
498 0.19
499 0.18
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.12