Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7SD43

Protein Details
Accession M7SD43    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-69ASTNGKEKSSKKSKKVETESESEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-61TPKAKSKKIAKDVALKASTNGKEKSSKKSKK
100-128KKKKVTPKANGSAAKPAAKPAAVNGKAKA
214-222KSEPSKKRK
434-499PPREGGFGGGRGGGGRGGGRGGGGFGGGRGGGGGFGGGRGGGRGGGRGGRGGFGSSGRGGSRGFEG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ela:UCREL1_10967  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKVKQANGKAEKAAKSLSVKNAGVTKASDTPKAKSKKIAKDVALKASTNGKEKSSKKSKKVETESESESDSDASDDSESDAEDSDDSDDSDSSESEADKKKKVTPKANGSAAKPAAKPAAVNGKAKAKAVDSDSDSSDSSDEEEDDDDSDDSDDSEGAATTKAKAKPVVATKEKAKAKAESSDKDSDDSDDSEEDSDDSDSSESEDVKKPEAKSEPSKKRKADEEVETSLKKTKTEASEDEFTVLFVGNLGWGIDDNLLYDAFKDCEGLSNARVVTDKAMQRSRGFGYVDFDTQENAQAALDKMNGFELEGRGMRLDPSKPRPAEDATPGARANDRAKQHGDSVSPESDTLFVGNLPFDADEEMVSEFFGEVSEVKSLRLPTDQESGQRKGFGYVTFSSVEDAKTVFEAKNGGYIGQGRGARAVRLDYASQKPPREGGFGGGRGGGGRGGGRGGGGFGGGRGGGGGFGGGRGGGRGGGRGGRGGFGSSGRGGSRGFEGKKITF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.44
3 0.43
4 0.46
5 0.46
6 0.46
7 0.43
8 0.44
9 0.47
10 0.43
11 0.39
12 0.34
13 0.31
14 0.31
15 0.34
16 0.38
17 0.36
18 0.4
19 0.47
20 0.53
21 0.53
22 0.54
23 0.62
24 0.64
25 0.71
26 0.75
27 0.72
28 0.75
29 0.78
30 0.77
31 0.7
32 0.6
33 0.53
34 0.52
35 0.5
36 0.46
37 0.42
38 0.37
39 0.43
40 0.47
41 0.55
42 0.58
43 0.63
44 0.66
45 0.74
46 0.79
47 0.81
48 0.87
49 0.86
50 0.81
51 0.76
52 0.72
53 0.63
54 0.55
55 0.44
56 0.35
57 0.26
58 0.2
59 0.15
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.14
84 0.23
85 0.27
86 0.31
87 0.34
88 0.41
89 0.48
90 0.58
91 0.62
92 0.63
93 0.7
94 0.73
95 0.79
96 0.75
97 0.69
98 0.68
99 0.61
100 0.55
101 0.45
102 0.39
103 0.33
104 0.29
105 0.27
106 0.23
107 0.3
108 0.29
109 0.31
110 0.32
111 0.37
112 0.38
113 0.39
114 0.36
115 0.27
116 0.27
117 0.27
118 0.29
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.26
123 0.25
124 0.22
125 0.19
126 0.15
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.08
149 0.14
150 0.16
151 0.18
152 0.2
153 0.21
154 0.26
155 0.34
156 0.41
157 0.39
158 0.42
159 0.43
160 0.51
161 0.52
162 0.5
163 0.46
164 0.41
165 0.39
166 0.43
167 0.45
168 0.4
169 0.42
170 0.43
171 0.41
172 0.38
173 0.36
174 0.29
175 0.25
176 0.22
177 0.17
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.1
193 0.14
194 0.15
195 0.18
196 0.22
197 0.21
198 0.26
199 0.3
200 0.33
201 0.38
202 0.48
203 0.56
204 0.61
205 0.69
206 0.66
207 0.66
208 0.67
209 0.64
210 0.6
211 0.55
212 0.52
213 0.48
214 0.48
215 0.44
216 0.39
217 0.37
218 0.31
219 0.25
220 0.2
221 0.21
222 0.21
223 0.26
224 0.28
225 0.28
226 0.3
227 0.3
228 0.3
229 0.25
230 0.21
231 0.16
232 0.13
233 0.08
234 0.05
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.11
263 0.11
264 0.15
265 0.17
266 0.2
267 0.23
268 0.25
269 0.25
270 0.28
271 0.27
272 0.25
273 0.24
274 0.19
275 0.2
276 0.19
277 0.19
278 0.17
279 0.15
280 0.12
281 0.11
282 0.12
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.12
304 0.15
305 0.2
306 0.27
307 0.35
308 0.35
309 0.37
310 0.39
311 0.39
312 0.39
313 0.37
314 0.37
315 0.3
316 0.32
317 0.31
318 0.28
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.24
323 0.24
324 0.26
325 0.29
326 0.3
327 0.32
328 0.32
329 0.3
330 0.27
331 0.29
332 0.26
333 0.24
334 0.22
335 0.19
336 0.16
337 0.15
338 0.11
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.06
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.12
365 0.13
366 0.14
367 0.17
368 0.18
369 0.19
370 0.24
371 0.25
372 0.3
373 0.36
374 0.38
375 0.36
376 0.37
377 0.33
378 0.31
379 0.31
380 0.25
381 0.24
382 0.21
383 0.22
384 0.21
385 0.21
386 0.19
387 0.18
388 0.17
389 0.13
390 0.12
391 0.1
392 0.1
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.16
399 0.16
400 0.15
401 0.14
402 0.16
403 0.17
404 0.2
405 0.21
406 0.17
407 0.22
408 0.22
409 0.22
410 0.21
411 0.21
412 0.18
413 0.2
414 0.22
415 0.23
416 0.28
417 0.36
418 0.41
419 0.42
420 0.42
421 0.43
422 0.43
423 0.41
424 0.36
425 0.33
426 0.34
427 0.33
428 0.32
429 0.28
430 0.25
431 0.21
432 0.21
433 0.15
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.08
463 0.09
464 0.12
465 0.14
466 0.15
467 0.18
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.18
475 0.16
476 0.18
477 0.17
478 0.18
479 0.17
480 0.17
481 0.22
482 0.27
483 0.28
484 0.31