Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7TPJ5

Protein Details
Accession M7TPJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-407KEAEHKRRLKAKRKGGRGGKDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
390-416HKRRLKAKRKGGRGGKDGGAGGRGGRG
484-508RGRGRGGRGGNRGRGNRGGPRGGGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.333, cyto 14, nucl 10.5, mito_nucl 6.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG ela:UCREL1_1111  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSGFQIPGLTTLSQPQAASTPTVPESRQDDKVDAKSTDSMVVDEPEVIQNPDSTTAAPAPTSTENGVEDSTQSMVIDKPDITPSATSNGPNDKEMEGVSNTTVTSQPHVSEQSEARPSDAPPSPPSLISGLEALLGGLDPTPEQLANQTAQPEVATQAGDVAEPAAENGEQGNPEWEEDSSPLESSSEDSSSSDSDDDSDDDKDYPVLGPEETARLLMEMEGGSDDDGEGRAKSGAGGAQVRTKNELPEEVIPVPDVKIEDGTELVELGTVEHIVETTIVVKANTTGEYRVLDSGSVLCTEGRTVIAAIADLIGSVRQPRYTARFTSREQMAEDFGLELGTRIFYAPNHATYVFTQALQAVKGTDASNWHDEEAGDDEVEFSDDEKEAEHKRRLKAKRKGGRGGKDGGAGGRGGRGGGDGGVKQELNSQQQQQQHPVGLKYDDDDDDDDGPYKPLARPPGFGQGPPASQSVETGYNTNGYSTNRGRGRGGRGGNRGRGNRGGPRGGGGGGGGYSLPPRPQHQHQPQHQTFTPPAPPPLQQQSAFTPMQQPEFNYPIMSPTAQFPLPPWPPNPNMVPPPPPPQFANQQQGQQQQQQQQAAAAAAAVAGMYFNPAFYNAGGKWPGQPGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.23
6 0.2
7 0.21
8 0.22
9 0.25
10 0.25
11 0.27
12 0.33
13 0.35
14 0.4
15 0.39
16 0.4
17 0.44
18 0.5
19 0.51
20 0.45
21 0.42
22 0.38
23 0.37
24 0.37
25 0.3
26 0.25
27 0.21
28 0.22
29 0.19
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.17
39 0.16
40 0.14
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.14
46 0.16
47 0.17
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.16
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.21
73 0.2
74 0.22
75 0.28
76 0.28
77 0.28
78 0.29
79 0.26
80 0.25
81 0.24
82 0.23
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.15
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.18
95 0.21
96 0.21
97 0.23
98 0.24
99 0.28
100 0.32
101 0.31
102 0.3
103 0.29
104 0.28
105 0.31
106 0.33
107 0.3
108 0.26
109 0.32
110 0.32
111 0.3
112 0.31
113 0.25
114 0.22
115 0.19
116 0.18
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.13
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.23
230 0.22
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.17
235 0.18
236 0.21
237 0.17
238 0.17
239 0.15
240 0.15
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.03
299 0.03
300 0.02
301 0.03
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.08
307 0.14
308 0.17
309 0.21
310 0.26
311 0.3
312 0.32
313 0.38
314 0.38
315 0.33
316 0.31
317 0.28
318 0.23
319 0.19
320 0.17
321 0.11
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.2
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.12
344 0.13
345 0.12
346 0.11
347 0.07
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.09
353 0.12
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.14
361 0.12
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.07
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.1
374 0.14
375 0.2
376 0.27
377 0.32
378 0.38
379 0.48
380 0.57
381 0.65
382 0.7
383 0.75
384 0.77
385 0.8
386 0.83
387 0.83
388 0.81
389 0.75
390 0.69
391 0.6
392 0.53
393 0.44
394 0.34
395 0.26
396 0.18
397 0.14
398 0.1
399 0.08
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.07
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.13
412 0.16
413 0.19
414 0.22
415 0.25
416 0.28
417 0.35
418 0.38
419 0.38
420 0.37
421 0.36
422 0.35
423 0.32
424 0.3
425 0.24
426 0.22
427 0.18
428 0.18
429 0.16
430 0.15
431 0.15
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.12
440 0.12
441 0.15
442 0.23
443 0.24
444 0.26
445 0.28
446 0.38
447 0.37
448 0.36
449 0.37
450 0.32
451 0.31
452 0.31
453 0.28
454 0.19
455 0.18
456 0.19
457 0.16
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.15
462 0.16
463 0.16
464 0.16
465 0.16
466 0.14
467 0.2
468 0.22
469 0.3
470 0.3
471 0.32
472 0.35
473 0.38
474 0.43
475 0.44
476 0.49
477 0.48
478 0.55
479 0.59
480 0.63
481 0.65
482 0.61
483 0.58
484 0.56
485 0.53
486 0.52
487 0.51
488 0.47
489 0.4
490 0.39
491 0.35
492 0.3
493 0.25
494 0.17
495 0.12
496 0.08
497 0.08
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.07
502 0.1
503 0.12
504 0.17
505 0.24
506 0.31
507 0.42
508 0.52
509 0.61
510 0.67
511 0.76
512 0.75
513 0.76
514 0.71
515 0.65
516 0.57
517 0.53
518 0.51
519 0.42
520 0.42
521 0.38
522 0.38
523 0.39
524 0.44
525 0.44
526 0.39
527 0.39
528 0.4
529 0.43
530 0.41
531 0.35
532 0.34
533 0.31
534 0.34
535 0.32
536 0.3
537 0.3
538 0.33
539 0.32
540 0.26
541 0.24
542 0.22
543 0.23
544 0.21
545 0.16
546 0.16
547 0.2
548 0.19
549 0.19
550 0.18
551 0.25
552 0.3
553 0.33
554 0.34
555 0.36
556 0.39
557 0.44
558 0.48
559 0.46
560 0.47
561 0.49
562 0.52
563 0.5
564 0.56
565 0.54
566 0.52
567 0.47
568 0.45
569 0.5
570 0.52
571 0.56
572 0.51
573 0.53
574 0.57
575 0.62
576 0.62
577 0.61
578 0.59
579 0.58
580 0.61
581 0.58
582 0.52
583 0.46
584 0.41
585 0.34
586 0.26
587 0.18
588 0.11
589 0.08
590 0.07
591 0.05
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.08
600 0.1
601 0.1
602 0.16
603 0.14
604 0.2
605 0.22
606 0.23
607 0.26