FuNGI

F4RNB4

Protein Details

Accession

F4RNB4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
772-802	KVPPKGGKQAFRVKRPPSKLKRQASPLSKAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
137-146	RKKNPGRRKI
154-166	KGKRHITFSKRKA
591-597	PKLKPRK
775-793	PKGGKQAFRVKRPPSKLKR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002100 TF_MADSbox IPR036879 TF_MADSbox_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	mlr:MELLADRAFT_106990 -
Pfam	View protein in Pfam PF00319 SRF-TF
PROSITE	View protein in PROSITE PS00350 MADS_BOX_1 PS50066 MADS_BOX_2
CDD	cd00120 MADS

Amino Acid Sequences

MDKVFISMTLGVRHWNLAFCKSAPSEKNIAFASDGFRVKVSLPRIRYVLLTTGAIDNDPVIGKLHDGEFEMYSKIRDDPDYQVPGSAPSSGSGSTTRSTHPNYDFRQDELSLGTRKRNRDADEAEDDEEEEEEVSGRKKNPGRRKIDIEYIHDKGKRHITFSKRKAGIMKKAYELATLTGTQLLLLVVSDSGVVYTFTTPKLETLVSEQPGKDIILKCLADGSSELQIQRESPSETTPIISKCPLPEQEFSEDASGSQANTRLTDGLNSLEQPYALNPCEANGSASFGPLGSHPYISDHNQSMLPSYDPLILGHHGVDNLYGHLGDQLMNDATNPYSSLPHTISNRPPGSASYLDMNLNQTLLRGDSGNSITNPAEYQSIKRRKTETDLRSRSRTDNTAASQYPPLPNQFAADLHNPWNENHVTMKYNMAQQARILALQHPTITNAVSAFLMSEYLRHENAVSFESEPREDLNRLERTMKLFLDACDQSPMSNMHSVGGKSWKDETPPSYEVLGKCLSFFLQEYLHIQSFVDYINVLYDQPLVPTTSISELTAPSTGTDDPQTASTSTEPFSGAVSTVPSLSPVGKSKTAPKLKPRKGVNVSLRGGRLSTNLEEYTAWCRQNKISWSGNNPQSTLVTWFKIERVRRTFCCCIAEYPSETQLDNVLKIRFPASAIKLIRKHDRLKLEVKKADDGSEWNIFQHLDSDLYPEDESDEDEISFPPGDKPIDPEAIDSVAKGKGIDRDQAKSFLDSRRLMRQQIEAGDYEDDGFESKVPPKGGKQAFRVKRPPSKLKRQASPLSKAEDADIQVGLPNQPSRSIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.25
4	0.25
5	0.28
6	0.26
7	0.32
8	0.32
9	0.39
10	0.37
11	0.41
12	0.45
13	0.42
14	0.47
15	0.41
16	0.4
17	0.33
18	0.31
19	0.29
20	0.28
21	0.28
22	0.23
23	0.23
24	0.22
25	0.23
26	0.27
27	0.31
28	0.32
29	0.35
30	0.38
31	0.4
32	0.41
33	0.41
34	0.37
35	0.34
36	0.29
37	0.25
38	0.23
39	0.22
40	0.21
41	0.2
42	0.17
43	0.12
44	0.11
45	0.11
46	0.1
47	0.09
48	0.09
49	0.1
50	0.12
51	0.13
52	0.12
53	0.14
54	0.15
55	0.15
56	0.16
57	0.18
58	0.16
59	0.16
60	0.16
61	0.17
62	0.17
63	0.19
64	0.21
65	0.26
66	0.33
67	0.37
68	0.36
69	0.35
70	0.33
71	0.32
72	0.3
73	0.25
74	0.17
75	0.13
76	0.15
77	0.13
78	0.15
79	0.14
80	0.15
81	0.16
82	0.18
83	0.2
84	0.24
85	0.28
86	0.34
87	0.39
88	0.45
89	0.48
90	0.54
91	0.53
92	0.49
93	0.49
94	0.42
95	0.37
96	0.31
97	0.32
98	0.29
99	0.3
100	0.36
101	0.37
102	0.42
103	0.48
104	0.52
105	0.52
106	0.56
107	0.58
108	0.56
109	0.57
110	0.55
111	0.49
112	0.42
113	0.37
114	0.28
115	0.24
116	0.17
117	0.1
118	0.07
119	0.06
120	0.07
121	0.09
122	0.13
123	0.15
124	0.23
125	0.29
126	0.39
127	0.49
128	0.58
129	0.65
130	0.69
131	0.75
132	0.73
133	0.77
134	0.72
135	0.69
136	0.65
137	0.6
138	0.58
139	0.53
140	0.48
141	0.44
142	0.49
143	0.43
144	0.41
145	0.47
146	0.5
147	0.58
148	0.65
149	0.7
150	0.62
151	0.63
152	0.66
153	0.67
154	0.67
155	0.64
156	0.6
157	0.53
158	0.55
159	0.52
160	0.45
161	0.37
162	0.28
163	0.22
164	0.19
165	0.16
166	0.13
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.08
171	0.06
172	0.05
173	0.05
174	0.03
175	0.04
176	0.04
177	0.03
178	0.03
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.07
183	0.08
184	0.09
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.13
189	0.12
190	0.12
191	0.16
192	0.22
193	0.22
194	0.25
195	0.25
196	0.23
197	0.24
198	0.23
199	0.23
200	0.19
201	0.19
202	0.22
203	0.22
204	0.22
205	0.23
206	0.22
207	0.17
208	0.16
209	0.16
210	0.13
211	0.15
212	0.15
213	0.13
214	0.14
215	0.14
216	0.15
217	0.15
218	0.14
219	0.14
220	0.15
221	0.17
222	0.17
223	0.17
224	0.19
225	0.18
226	0.18
227	0.18
228	0.18
229	0.18
230	0.23
231	0.27
232	0.27
233	0.29
234	0.3
235	0.33
236	0.33
237	0.32
238	0.27
239	0.22
240	0.18
241	0.17
242	0.13
243	0.09
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.12
267	0.12
268	0.13
269	0.09
270	0.12
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.12
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.12
282	0.14
283	0.16
284	0.2
285	0.17
286	0.18
287	0.19
288	0.18
289	0.18
290	0.16
291	0.14
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.1
326	0.11
327	0.15
328	0.19
329	0.23
330	0.27
331	0.34
332	0.34
333	0.32
334	0.31
335	0.27
336	0.28
337	0.24
338	0.21
339	0.14
340	0.15
341	0.15
342	0.15
343	0.16
344	0.11
345	0.11
346	0.1
347	0.08
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.06
353	0.08
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.13
365	0.21
366	0.31
367	0.33
368	0.36
369	0.39
370	0.39
371	0.46
372	0.52
373	0.51
374	0.53
375	0.59
376	0.6
377	0.61
378	0.61
379	0.56
380	0.49
381	0.43
382	0.35
383	0.31
384	0.28
385	0.28
386	0.26
387	0.25
388	0.23
389	0.22
390	0.21
391	0.18
392	0.17
393	0.14
394	0.14
395	0.13
396	0.12
397	0.11
398	0.12
399	0.13
400	0.13
401	0.14
402	0.16
403	0.16
404	0.15
405	0.18
406	0.15
407	0.14
408	0.14
409	0.14
410	0.14
411	0.14
412	0.16
413	0.14
414	0.17
415	0.2
416	0.19
417	0.18
418	0.16
419	0.18
420	0.16
421	0.15
422	0.13
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.07
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.14
457	0.13
458	0.14
459	0.19
460	0.21
461	0.22
462	0.23
463	0.23
464	0.24
465	0.27
466	0.25
467	0.2
468	0.18
469	0.17
470	0.21
471	0.2
472	0.18
473	0.17
474	0.17
475	0.14
476	0.15
477	0.16
478	0.12
479	0.14
480	0.13
481	0.12
482	0.14
483	0.14
484	0.14
485	0.19
486	0.18
487	0.17
488	0.2
489	0.2
490	0.2
491	0.23
492	0.24
493	0.25
494	0.25
495	0.25
496	0.24
497	0.26
498	0.24
499	0.24
500	0.23
501	0.16
502	0.15
503	0.14
504	0.13
505	0.1
506	0.11
507	0.09
508	0.08
509	0.09
510	0.11
511	0.14
512	0.15
513	0.14
514	0.13
515	0.12
516	0.11
517	0.11
518	0.09
519	0.05
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.07
531	0.07
532	0.08
533	0.09
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.09
538	0.1
539	0.11
540	0.1
541	0.08
542	0.09
543	0.09
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.11
549	0.12
550	0.11
551	0.12
552	0.12
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.12
557	0.11
558	0.11
559	0.1
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.07
567	0.08
568	0.08
569	0.11
570	0.14
571	0.17
572	0.2
573	0.22
574	0.29
575	0.38
576	0.46
577	0.5
578	0.57
579	0.64
580	0.7
581	0.77
582	0.75
583	0.75
584	0.72
585	0.76
586	0.74
587	0.72
588	0.66
589	0.61
590	0.56
591	0.46
592	0.4
593	0.31
594	0.25
595	0.19
596	0.18
597	0.18
598	0.17
599	0.17
600	0.17
601	0.18
602	0.22
603	0.23
604	0.24
605	0.22
606	0.24
607	0.25
608	0.32
609	0.35
610	0.36
611	0.38
612	0.41
613	0.47
614	0.53
615	0.58
616	0.53
617	0.49
618	0.43
619	0.37
620	0.33
621	0.32
622	0.25
623	0.2
624	0.19
625	0.2
626	0.22
627	0.28
628	0.32
629	0.36
630	0.42
631	0.47
632	0.51
633	0.58
634	0.6
635	0.57
636	0.56
637	0.49
638	0.44
639	0.43
640	0.42
641	0.37
642	0.35
643	0.34
644	0.3
645	0.29
646	0.25
647	0.25
648	0.22
649	0.21
650	0.22
651	0.2
652	0.19
653	0.21
654	0.21
655	0.17
656	0.17
657	0.22
658	0.21
659	0.29
660	0.31
661	0.38
662	0.42
663	0.47
664	0.55
665	0.55
666	0.58
667	0.57
668	0.62
669	0.6
670	0.65
671	0.69
672	0.7
673	0.67
674	0.65
675	0.63
676	0.57
677	0.53
678	0.44
679	0.38
680	0.33
681	0.33
682	0.3
683	0.24
684	0.24
685	0.21
686	0.2
687	0.18
688	0.14
689	0.11
690	0.11
691	0.14
692	0.14
693	0.15
694	0.15
695	0.13
696	0.14
697	0.12
698	0.14
699	0.12
700	0.12
701	0.1
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.12
706	0.11
707	0.11
708	0.14
709	0.16
710	0.16
711	0.2
712	0.24
713	0.28
714	0.27
715	0.27
716	0.26
717	0.26
718	0.26
719	0.21
720	0.18
721	0.15
722	0.15
723	0.14
724	0.14
725	0.19
726	0.22
727	0.29
728	0.3
729	0.35
730	0.38
731	0.42
732	0.41
733	0.38
734	0.4
735	0.39
736	0.43
737	0.42
738	0.44
739	0.49
740	0.52
741	0.52
742	0.51
743	0.5
744	0.48
745	0.48
746	0.46
747	0.37
748	0.34
749	0.31
750	0.28
751	0.23
752	0.17
753	0.13
754	0.11
755	0.11
756	0.09
757	0.11
758	0.15
759	0.2
760	0.22
761	0.25
762	0.29
763	0.39
764	0.46
765	0.51
766	0.56
767	0.62
768	0.68
769	0.75
770	0.8
771	0.79
772	0.81
773	0.83
774	0.85
775	0.85
776	0.87
777	0.88
778	0.88
779	0.88
780	0.87
781	0.88
782	0.85
783	0.83
784	0.77
785	0.73
786	0.65
787	0.56
788	0.49
789	0.43
790	0.36
791	0.3
792	0.24
793	0.18
794	0.18
795	0.19
796	0.18
797	0.18
798	0.19
799	0.18

F4RNB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer