FuNGI

M7U0S5

Protein Details

Accession

M7U0S5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-55	NTMYKNKATKVRPSNQPCNITG	Hydrophilic
965-986	EEAVMRKKRYRLDGKARFDKDN	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 11, nucl 6.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MLERSDEGKHIISSQTFEELFNIHIVNDDVEQVNTMYKNKATKVRPSNQPCNITGEPPGGRDDWFERDQLRNPYQEPSGRWKEFLIPRFNKEPEGYRLTPERTKAIDCGDLLTDLERDMLMACLLNREGALAFDWTHAGRVQEDVAPPQRIRTVPHEAWQTPGFPVPKALVEVVSTMLRDRIKQGVFEPCDGPYRNPWFLVKKKTPGAYRIINAVVELNRHTIRDANLPPDADAFAENFAGCTVASLIDFFSGYDQIPLALESRDLTAFQTPLGLLRYTTLPQGATNSVAQFCRIIMKILGDLTPSVAISFLDDIGIKGPKTVYDNKEIVPGVRKFVLEHIQAIDKTLERLERAGCAVGAKSKWCYDGMEVVGYVVGSEGRKPVEAKIKKILDWPEPKSATEVRMFLGVCVYYRIWVEKFAQKAEPLYRLLKKDVEFSWTIEQEQAMKSLKENLIKPPTLMPLDYGDTMIVGQIVLGVDASIDGWGAHLGQESGGKRTVARFESGLWNDAEKNYDATKRECRGVLKALRKCRFDLYGIHFVLETDAKVLVAQLNRAATDLPGALVTRWIAWIRLFDFEVRHVKGTAHTAADGLSRRPATLSDVSEEDKEEDIDEWIADQLNNVEDVSTIHNFANFSRSYELDKGYNSESRKIAQYLTSLQRPEGMTSQEFSKFKKRALGFSVREGCLYRNGTRDTPHRKVIDEQQQRTSLIGNLHEAYGHKGVESTFDKVHKLYYWNGMYEDVKRFVKSCPNCQKRQPNVQEEPLHPTWVSTCWQKCGLDIMYMPPDNGYKYLVSLRDDLSGWIEAKPLRNATSQAVAAFIWNVVCRHSVFGKVSVDGGPENKAHVEYFLRKYGIKRVQISAYNSKANGQIERGHRPIADGLAKVMDGKSGWLRHLDAMLFADRVTTHRPTNLTPFYVIYGRHPVLPIETQYSTWRVLDWEKVTSREDLLALRLRQLEMHDLDMEEAVMRKKRYRLDGKARFDKDNNVIDKKITAGDIVLQFDPQSKIDMSRERKLGYRWLGPYRVNKVLPNKSTYILEEMDGTPIDGTYSGARLKKFVKREGEYIPVGGEEEDTGDITEDELEDPLEALLNPRRSERIAQRFTTTEDMIDHIQENQDVTPPTNTNTRVVVEIPAISPSTRRAFPTVLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.26
3	0.24
4	0.23
5	0.22
6	0.19
7	0.19
8	0.18
9	0.17
10	0.12
11	0.13
12	0.13
13	0.13
14	0.13
15	0.14
16	0.13
17	0.13
18	0.14
19	0.13
20	0.16
21	0.16
22	0.18
23	0.19
24	0.22
25	0.28
26	0.33
27	0.41
28	0.43
29	0.52
30	0.6
31	0.66
32	0.73
33	0.77
34	0.82
35	0.82
36	0.82
37	0.73
38	0.71
39	0.63
40	0.55
41	0.48
42	0.44
43	0.37
44	0.32
45	0.33
46	0.26
47	0.24
48	0.26
49	0.27
50	0.27
51	0.28
52	0.29
53	0.3
54	0.34
55	0.41
56	0.46
57	0.47
58	0.46
59	0.45
60	0.47
61	0.49
62	0.49
63	0.47
64	0.48
65	0.53
66	0.5
67	0.49
68	0.46
69	0.5
70	0.53
71	0.56
72	0.57
73	0.52
74	0.57
75	0.63
76	0.63
77	0.58
78	0.54
79	0.52
80	0.49
81	0.52
82	0.47
83	0.44
84	0.49
85	0.51
86	0.52
87	0.49
88	0.47
89	0.41
90	0.43
91	0.4
92	0.38
93	0.36
94	0.31
95	0.31
96	0.26
97	0.23
98	0.21
99	0.19
100	0.15
101	0.11
102	0.11
103	0.08
104	0.08
105	0.07
106	0.08
107	0.07
108	0.08
109	0.08
110	0.1
111	0.1
112	0.11
113	0.1
114	0.1
115	0.1
116	0.09
117	0.11
118	0.09
119	0.1
120	0.1
121	0.12
122	0.11
123	0.12
124	0.13
125	0.13
126	0.12
127	0.13
128	0.14
129	0.16
130	0.17
131	0.22
132	0.27
133	0.31
134	0.3
135	0.31
136	0.35
137	0.32
138	0.36
139	0.36
140	0.4
141	0.37
142	0.44
143	0.49
144	0.44
145	0.48
146	0.45
147	0.39
148	0.31
149	0.34
150	0.29
151	0.21
152	0.23
153	0.2
154	0.2
155	0.21
156	0.2
157	0.15
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.14
162	0.13
163	0.11
164	0.15
165	0.15
166	0.15
167	0.18
168	0.23
169	0.24
170	0.25
171	0.29
172	0.34
173	0.36
174	0.38
175	0.36
176	0.3
177	0.35
178	0.35
179	0.34
180	0.33
181	0.37
182	0.36
183	0.37
184	0.4
185	0.43
186	0.49
187	0.57
188	0.56
189	0.56
190	0.61
191	0.66
192	0.65
193	0.61
194	0.61
195	0.56
196	0.51
197	0.47
198	0.42
199	0.35
200	0.3
201	0.29
202	0.23
203	0.18
204	0.18
205	0.18
206	0.17
207	0.18
208	0.18
209	0.18
210	0.2
211	0.27
212	0.28
213	0.28
214	0.3
215	0.3
216	0.3
217	0.27
218	0.25
219	0.17
220	0.15
221	0.11
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.1
259	0.11
260	0.13
261	0.12
262	0.09
263	0.11
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.14
268	0.12
269	0.12
270	0.15
271	0.15
272	0.14
273	0.15
274	0.16
275	0.17
276	0.16
277	0.16
278	0.14
279	0.13
280	0.15
281	0.14
282	0.14
283	0.12
284	0.14
285	0.14
286	0.15
287	0.15
288	0.12
289	0.11
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.08
303	0.1
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.16
309	0.24
310	0.25
311	0.3
312	0.33
313	0.32
314	0.37
315	0.35
316	0.32
317	0.32
318	0.29
319	0.25
320	0.25
321	0.25
322	0.21
323	0.25
324	0.29
325	0.22
326	0.23
327	0.22
328	0.23
329	0.23
330	0.24
331	0.21
332	0.15
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.12
337	0.14
338	0.13
339	0.13
340	0.14
341	0.13
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.13
346	0.13
347	0.13
348	0.15
349	0.15
350	0.17
351	0.17
352	0.17
353	0.15
354	0.19
355	0.19
356	0.17
357	0.16
358	0.14
359	0.13
360	0.11
361	0.1
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.07
367	0.07
368	0.09
369	0.1
370	0.15
371	0.24
372	0.28
373	0.31
374	0.39
375	0.4
376	0.4
377	0.45
378	0.46
379	0.44
380	0.48
381	0.48
382	0.47
383	0.46
384	0.45
385	0.44
386	0.41
387	0.35
388	0.3
389	0.26
390	0.18
391	0.2
392	0.2
393	0.16
394	0.15
395	0.12
396	0.1
397	0.11
398	0.11
399	0.09
400	0.09
401	0.12
402	0.11
403	0.13
404	0.17
405	0.19
406	0.21
407	0.22
408	0.23
409	0.22
410	0.25
411	0.25
412	0.25
413	0.23
414	0.27
415	0.29
416	0.3
417	0.31
418	0.32
419	0.3
420	0.31
421	0.29
422	0.28
423	0.24
424	0.25
425	0.27
426	0.23
427	0.23
428	0.19
429	0.18
430	0.16
431	0.15
432	0.16
433	0.13
434	0.12
435	0.12
436	0.18
437	0.21
438	0.23
439	0.25
440	0.29
441	0.34
442	0.34
443	0.34
444	0.3
445	0.3
446	0.26
447	0.25
448	0.18
449	0.15
450	0.16
451	0.16
452	0.14
453	0.1
454	0.09
455	0.09
456	0.08
457	0.05
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.02
466	0.03
467	0.03
468	0.02
469	0.02
470	0.02
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.04
477	0.04
478	0.08
479	0.08
480	0.1
481	0.11
482	0.11
483	0.12
484	0.14
485	0.18
486	0.16
487	0.16
488	0.15
489	0.16
490	0.23
491	0.23
492	0.23
493	0.19
494	0.18
495	0.17
496	0.17
497	0.17
498	0.1
499	0.11
500	0.11
501	0.15
502	0.16
503	0.19
504	0.26
505	0.27
506	0.28
507	0.29
508	0.29
509	0.29
510	0.34
511	0.38
512	0.4
513	0.44
514	0.51
515	0.55
516	0.55
517	0.53
518	0.48
519	0.43
520	0.36
521	0.36
522	0.33
523	0.36
524	0.34
525	0.32
526	0.29
527	0.27
528	0.26
529	0.2
530	0.13
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.09
543	0.09
544	0.06
545	0.07
546	0.06
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.08
559	0.09
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.13
565	0.18
566	0.17
567	0.17
568	0.16
569	0.16
570	0.16
571	0.19
572	0.17
573	0.13
574	0.12
575	0.11
576	0.11
577	0.13
578	0.13
579	0.1
580	0.11
581	0.11
582	0.11
583	0.11
584	0.11
585	0.13
586	0.15
587	0.16
588	0.14
589	0.16
590	0.17
591	0.17
592	0.17
593	0.14
594	0.11
595	0.1
596	0.09
597	0.08
598	0.07
599	0.07
600	0.06
601	0.05
602	0.05
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.04
612	0.05
613	0.08
614	0.08
615	0.09
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.11
620	0.14
621	0.11
622	0.13
623	0.13
624	0.14
625	0.16
626	0.18
627	0.19
628	0.16
629	0.17
630	0.17
631	0.18
632	0.21
633	0.19
634	0.21
635	0.2
636	0.21
637	0.23
638	0.21
639	0.2
640	0.17
641	0.18
642	0.2
643	0.23
644	0.25
645	0.23
646	0.22
647	0.25
648	0.24
649	0.23
650	0.2
651	0.18
652	0.15
653	0.16
654	0.18
655	0.2
656	0.2
657	0.21
658	0.28
659	0.28
660	0.29
661	0.35
662	0.35
663	0.34
664	0.4
665	0.47
666	0.4
667	0.46
668	0.5
669	0.43
670	0.42
671	0.38
672	0.32
673	0.28
674	0.3
675	0.24
676	0.23
677	0.25
678	0.26
679	0.29
680	0.37
681	0.4
682	0.41
683	0.46
684	0.42
685	0.41
686	0.43
687	0.49
688	0.51
689	0.51
690	0.49
691	0.48
692	0.48
693	0.47
694	0.44
695	0.36
696	0.28
697	0.2
698	0.18
699	0.15
700	0.14
701	0.13
702	0.14
703	0.13
704	0.14
705	0.14
706	0.12
707	0.1
708	0.1
709	0.1
710	0.15
711	0.17
712	0.16
713	0.17
714	0.19
715	0.2
716	0.19
717	0.21
718	0.18
719	0.18
720	0.18
721	0.23
722	0.24
723	0.24
724	0.24
725	0.25
726	0.24
727	0.25
728	0.26
729	0.22
730	0.21
731	0.21
732	0.21
733	0.22
734	0.31
735	0.31
736	0.38
737	0.45
738	0.52
739	0.57
740	0.65
741	0.73
742	0.72
743	0.78
744	0.76
745	0.74
746	0.72
747	0.75
748	0.7
749	0.61
750	0.61
751	0.51
752	0.43
753	0.34
754	0.29
755	0.22
756	0.19
757	0.2
758	0.19
759	0.2
760	0.21
761	0.25
762	0.25
763	0.24
764	0.28
765	0.26
766	0.21
767	0.2
768	0.2
769	0.21
770	0.21
771	0.21
772	0.16
773	0.16
774	0.15
775	0.15
776	0.14
777	0.09
778	0.1
779	0.14
780	0.16
781	0.17
782	0.19
783	0.19
784	0.19
785	0.19
786	0.18
787	0.16
788	0.16
789	0.14
790	0.13
791	0.14
792	0.14
793	0.16
794	0.19
795	0.19
796	0.2
797	0.21
798	0.22
799	0.22
800	0.24
801	0.22
802	0.19
803	0.18
804	0.15
805	0.14
806	0.12
807	0.1
808	0.07
809	0.07
810	0.08
811	0.08
812	0.09
813	0.1
814	0.12
815	0.13
816	0.17
817	0.17
818	0.22
819	0.22
820	0.21
821	0.22
822	0.2
823	0.2
824	0.16
825	0.16
826	0.14
827	0.12
828	0.13
829	0.12
830	0.13
831	0.12
832	0.13
833	0.16
834	0.2
835	0.24
836	0.27
837	0.28
838	0.29
839	0.31
840	0.39
841	0.42
842	0.43
843	0.42
844	0.42
845	0.46
846	0.5
847	0.54
848	0.52
849	0.48
850	0.45
851	0.41
852	0.39
853	0.38
854	0.34
855	0.29
856	0.24
857	0.26
858	0.29
859	0.35
860	0.35
861	0.33
862	0.31
863	0.31
864	0.3
865	0.28
866	0.25
867	0.19
868	0.18
869	0.17
870	0.17
871	0.16
872	0.14
873	0.1
874	0.07
875	0.1
876	0.14
877	0.15
878	0.16
879	0.18
880	0.19
881	0.19
882	0.22
883	0.19
884	0.15
885	0.16
886	0.16
887	0.14
888	0.12
889	0.12
890	0.1
891	0.12
892	0.16
893	0.17
894	0.17
895	0.21
896	0.24
897	0.26
898	0.34
899	0.36
900	0.33
901	0.31
902	0.31
903	0.29
904	0.3
905	0.27
906	0.22
907	0.26
908	0.25
909	0.25
910	0.25
911	0.23
912	0.23
913	0.26
914	0.24
915	0.21
916	0.21
917	0.21
918	0.23
919	0.25
920	0.24
921	0.21
922	0.19
923	0.17
924	0.19
925	0.24
926	0.24
927	0.28
928	0.28
929	0.31
930	0.32
931	0.31
932	0.3
933	0.25
934	0.23
935	0.18
936	0.2
937	0.24
938	0.23
939	0.25
940	0.25
941	0.24
942	0.24
943	0.25
944	0.27
945	0.21
946	0.23
947	0.21
948	0.19
949	0.19
950	0.18
951	0.16
952	0.1
953	0.11
954	0.12
955	0.17
956	0.19
957	0.23
958	0.29
959	0.36
960	0.45
961	0.54
962	0.6
963	0.67
964	0.75
965	0.8
966	0.85
967	0.82
968	0.78
969	0.7
970	0.67
971	0.63
972	0.61
973	0.58
974	0.52
975	0.48
976	0.43
977	0.42
978	0.36
979	0.3
980	0.22
981	0.16
982	0.12
983	0.16
984	0.18
985	0.2
986	0.18
987	0.17
988	0.17
989	0.2
990	0.21
991	0.17
992	0.17
993	0.15
994	0.19
995	0.25
996	0.34
997	0.37
998	0.43
999	0.47
1000	0.46
1001	0.5
1002	0.49
1003	0.52
1004	0.49
1005	0.51
1006	0.5
1007	0.52
1008	0.56
1009	0.57
1010	0.62
1011	0.6
1012	0.61
1013	0.55
1014	0.55
1015	0.58
1016	0.62
1017	0.61
1018	0.58
1019	0.53
1020	0.48
1021	0.48
1022	0.44
1023	0.39
1024	0.3
1025	0.26
1026	0.23
1027	0.21
1028	0.21
1029	0.18
1030	0.16
1031	0.12
1032	0.11
1033	0.11
1034	0.08
1035	0.08
1036	0.08
1037	0.11
1038	0.15
1039	0.19
1040	0.19
1041	0.24
1042	0.3
1043	0.37
1044	0.43
1045	0.49
1046	0.54
1047	0.56
1048	0.61
1049	0.62
1050	0.62
1051	0.55
1052	0.48
1053	0.4
1054	0.31
1055	0.26
1056	0.21
1057	0.16
1058	0.09
1059	0.09
1060	0.09
1061	0.09
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.07
1068	0.08
1069	0.08
1070	0.08
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.11
1077	0.18
1078	0.23
1079	0.24
1080	0.27
1081	0.3
1082	0.33
1083	0.42
1084	0.48
1085	0.52
1086	0.54
1087	0.56
1088	0.58
1089	0.57
1090	0.58
1091	0.55
1092	0.45
1093	0.35
1094	0.28
1095	0.28
1096	0.25
1097	0.25
1098	0.21
1099	0.17
1100	0.18
1101	0.17
1102	0.18
1103	0.15
1104	0.19
1105	0.18
1106	0.2
1107	0.23
1108	0.23
1109	0.25
1110	0.31
1111	0.33
1112	0.31
1113	0.32
1114	0.32
1115	0.29
1116	0.28
1117	0.28
1118	0.23
1119	0.22
1120	0.2
1121	0.19
1122	0.18
1123	0.16
1124	0.17
1125	0.2
1126	0.24
1127	0.25
1128	0.28
1129	0.31

M7U0S5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer