Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7TMZ2

Protein Details
Accession M7TMZ2    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-89PPSSRISHATQKKRSGHPKRPRHTLQSLHydrophilic
347-371NISMESSKSPKRKRTIGPFSKAKLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-82KKRSGHPKRP
279-284KRVKKG
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12.5, cyto_mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
Amino Acid Sequences MEKIVRRLRQHNGLVKGGAVRTSRGNLRPWEMACIVTGFPTSIAALQFEWAWQNPHITLHIPPSSRISHATQKKRSGHPKRPRHTLQSLLSNLHILLTVPSFSRWPLEIKFFAPDVHRAWLKWSKAATGSLRDTLPIITDFPPAESQVNDEDGEITDRPYGIEALNVAYEDTKSHLEKGERIFHSEMKESCNICNQDLQHNSGLYTICPNINCHSITHMTCLSQHFLRAEKNEQSGEELIPVQGMCPGCRMDIRWNDVVKELSLRMRGQKVVEKLLGAKRVKKGKGIATSQEVVESEGDEEEEEEEEKEQELVDYFDADEFHARNVAQEENGFVDYLDDDDSDAVSNISMESSKSPKRKRTIGPFSKAKLIAVIEDSDVDEEIEGEELER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.54
3 0.49
4 0.4
5 0.36
6 0.29
7 0.25
8 0.24
9 0.29
10 0.35
11 0.35
12 0.4
13 0.4
14 0.45
15 0.49
16 0.46
17 0.47
18 0.41
19 0.37
20 0.31
21 0.28
22 0.23
23 0.17
24 0.17
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.13
37 0.12
38 0.15
39 0.14
40 0.17
41 0.17
42 0.19
43 0.2
44 0.19
45 0.2
46 0.24
47 0.28
48 0.26
49 0.27
50 0.3
51 0.3
52 0.3
53 0.32
54 0.3
55 0.35
56 0.44
57 0.53
58 0.56
59 0.63
60 0.69
61 0.75
62 0.81
63 0.82
64 0.84
65 0.84
66 0.87
67 0.86
68 0.89
69 0.86
70 0.84
71 0.79
72 0.77
73 0.72
74 0.7
75 0.65
76 0.56
77 0.49
78 0.41
79 0.34
80 0.25
81 0.19
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.11
92 0.14
93 0.16
94 0.21
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.23
99 0.24
100 0.22
101 0.24
102 0.21
103 0.24
104 0.23
105 0.21
106 0.27
107 0.32
108 0.31
109 0.31
110 0.3
111 0.27
112 0.28
113 0.33
114 0.29
115 0.28
116 0.29
117 0.27
118 0.26
119 0.24
120 0.23
121 0.18
122 0.17
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.14
163 0.15
164 0.19
165 0.23
166 0.3
167 0.28
168 0.31
169 0.32
170 0.31
171 0.32
172 0.32
173 0.28
174 0.23
175 0.27
176 0.24
177 0.23
178 0.26
179 0.25
180 0.22
181 0.24
182 0.22
183 0.24
184 0.25
185 0.27
186 0.22
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.19
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.15
200 0.13
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.19
205 0.18
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.18
210 0.15
211 0.16
212 0.14
213 0.16
214 0.18
215 0.2
216 0.23
217 0.24
218 0.26
219 0.25
220 0.24
221 0.25
222 0.23
223 0.2
224 0.16
225 0.13
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.13
238 0.19
239 0.24
240 0.29
241 0.33
242 0.33
243 0.33
244 0.35
245 0.33
246 0.26
247 0.22
248 0.18
249 0.16
250 0.18
251 0.19
252 0.22
253 0.24
254 0.25
255 0.26
256 0.31
257 0.31
258 0.32
259 0.32
260 0.28
261 0.3
262 0.32
263 0.38
264 0.34
265 0.37
266 0.39
267 0.47
268 0.48
269 0.48
270 0.5
271 0.49
272 0.55
273 0.54
274 0.52
275 0.48
276 0.48
277 0.42
278 0.38
279 0.3
280 0.23
281 0.18
282 0.14
283 0.1
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.12
311 0.13
312 0.16
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.16
318 0.16
319 0.14
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.11
339 0.18
340 0.26
341 0.36
342 0.45
343 0.53
344 0.61
345 0.7
346 0.76
347 0.81
348 0.84
349 0.85
350 0.85
351 0.85
352 0.81
353 0.8
354 0.7
355 0.59
356 0.52
357 0.43
358 0.36
359 0.29
360 0.27
361 0.19
362 0.19
363 0.19
364 0.15
365 0.14
366 0.12
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08