Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7TRT5

Protein Details
Accession M7TRT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-490VPTLIKKIKKNNKAKLRWTRTKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-370RRAVKEMRKRKIDKAEKAA
474-482KIKKNNKAK
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 10.833, mito_nucl 10.166, cyto 5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR010285  DNA_helicase_pif1-like  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043139  F:5'-3' DNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
Pfam View protein in Pfam  
PF05970  PIF1  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18037  DEXSc_Pif1_like  
cd18809  SF1_C_RecD  
Amino Acid Sequences MPFGITIPPALSSLTRSLFAQRWRAHSLLTFYNTNAPTRGASYSSIAHAMLKRAVKAKATEPLPPNSKNDAKKAAATPNNLTRNGNIQESLKPKPSQAIGGFVQPLRPASANGKLLPKESQSTVISSVDSSRMSSLFSRDDAFQDTQNSSFDLVQLADEFSEDDDIDFDYSYTLPTQPLSTNASMAAPPKPTYPIIPSSPFAERFNAQRAPSSSAQTWSSSPPANKGTPPGALKRREREREREQLAAQSVVVVEDDEAPKSKRRTLPWKLGLSEQDEVSHKQEQAEESSSEGIGSSAVPTCFKCRKTGHYANNCPTNGKGKPSEWAFSPLPHDKKDKHMPWNTTASKVAEERRAVKEMRKRKIDKAEKAAAESHGRTRTAKLAPIQLTDEQTRVKDLVVDQGKSVFFTGSAGTGKSVLMRSIIAALKKKYVREGDRVAVTASTGLAACNIGGVTLHSFGGIGLGKEDVPTLIKKIKKNNKAKLRWTRTKVLVIDEISMVDGDLFDKLEEIARGMRNNGRPFGGIQLVITGDFFQLPPVPDYNQKSRGVKFAFDAATWGTAIHHTIGLTEVFRQKDPVFANMLNEMRLGKVSQDTIKAFVEMKRAINYEDDLTATELFPTRNEVENSNTFRLRNLHGKAYRFEAADSGSITDEGMREKLLSNMMAPKSIELKKGAQVMLIKNMDDGLVNGSLGKVVAFMSEKSFEIYDANPDILNEKELSDAEEENHRQSDLAKFKQTNKELPITGVSNHGRLFPLVRFSIPDGTVRDLLVQPEDWKIELPNGEVQAQRSQLPLILAWALSIHKAQGQTLERVKIDLKRVFENGQAYVALSRATSQAGLEVQNFDPKKVMAHPRVAEFYNSLYSVNKALAHPRVARADPPKIPTKPIKPLQDDDFFDEGEEIARQFMSGGRQWEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.25
5 0.3
6 0.36
7 0.42
8 0.42
9 0.47
10 0.51
11 0.51
12 0.47
13 0.46
14 0.44
15 0.42
16 0.41
17 0.37
18 0.32
19 0.4
20 0.39
21 0.36
22 0.33
23 0.27
24 0.24
25 0.25
26 0.26
27 0.2
28 0.21
29 0.22
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.2
34 0.22
35 0.23
36 0.24
37 0.27
38 0.28
39 0.29
40 0.33
41 0.36
42 0.36
43 0.38
44 0.4
45 0.42
46 0.42
47 0.46
48 0.46
49 0.51
50 0.54
51 0.53
52 0.53
53 0.53
54 0.59
55 0.56
56 0.59
57 0.58
58 0.54
59 0.57
60 0.57
61 0.59
62 0.57
63 0.57
64 0.56
65 0.58
66 0.61
67 0.57
68 0.53
69 0.45
70 0.46
71 0.44
72 0.4
73 0.32
74 0.28
75 0.33
76 0.37
77 0.4
78 0.39
79 0.38
80 0.36
81 0.4
82 0.4
83 0.41
84 0.37
85 0.38
86 0.32
87 0.35
88 0.37
89 0.31
90 0.31
91 0.25
92 0.24
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.2
97 0.28
98 0.3
99 0.32
100 0.38
101 0.36
102 0.38
103 0.39
104 0.37
105 0.33
106 0.31
107 0.34
108 0.28
109 0.29
110 0.3
111 0.27
112 0.24
113 0.21
114 0.21
115 0.18
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.15
121 0.16
122 0.18
123 0.18
124 0.19
125 0.2
126 0.2
127 0.22
128 0.25
129 0.25
130 0.23
131 0.25
132 0.25
133 0.24
134 0.23
135 0.22
136 0.19
137 0.17
138 0.15
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.12
164 0.12
165 0.15
166 0.19
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.19
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.2
178 0.2
179 0.22
180 0.25
181 0.27
182 0.3
183 0.32
184 0.32
185 0.32
186 0.36
187 0.36
188 0.32
189 0.3
190 0.27
191 0.27
192 0.33
193 0.34
194 0.3
195 0.33
196 0.34
197 0.37
198 0.38
199 0.39
200 0.34
201 0.32
202 0.33
203 0.29
204 0.28
205 0.24
206 0.26
207 0.25
208 0.25
209 0.27
210 0.3
211 0.3
212 0.3
213 0.31
214 0.3
215 0.31
216 0.34
217 0.37
218 0.4
219 0.46
220 0.52
221 0.57
222 0.65
223 0.69
224 0.73
225 0.73
226 0.74
227 0.77
228 0.74
229 0.69
230 0.6
231 0.55
232 0.5
233 0.42
234 0.32
235 0.22
236 0.18
237 0.13
238 0.12
239 0.07
240 0.05
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.18
247 0.21
248 0.28
249 0.31
250 0.38
251 0.48
252 0.55
253 0.64
254 0.67
255 0.71
256 0.65
257 0.63
258 0.58
259 0.52
260 0.45
261 0.34
262 0.28
263 0.24
264 0.25
265 0.24
266 0.24
267 0.21
268 0.2
269 0.22
270 0.21
271 0.23
272 0.24
273 0.21
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.14
278 0.13
279 0.09
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.16
288 0.22
289 0.23
290 0.29
291 0.31
292 0.38
293 0.47
294 0.56
295 0.6
296 0.65
297 0.72
298 0.71
299 0.75
300 0.68
301 0.59
302 0.51
303 0.47
304 0.38
305 0.34
306 0.32
307 0.25
308 0.31
309 0.32
310 0.32
311 0.27
312 0.32
313 0.28
314 0.25
315 0.31
316 0.32
317 0.33
318 0.35
319 0.38
320 0.34
321 0.42
322 0.5
323 0.51
324 0.53
325 0.57
326 0.58
327 0.58
328 0.66
329 0.58
330 0.51
331 0.46
332 0.37
333 0.32
334 0.31
335 0.3
336 0.26
337 0.27
338 0.29
339 0.3
340 0.32
341 0.31
342 0.35
343 0.4
344 0.44
345 0.5
346 0.55
347 0.56
348 0.6
349 0.7
350 0.74
351 0.73
352 0.72
353 0.71
354 0.62
355 0.59
356 0.53
357 0.44
358 0.38
359 0.31
360 0.28
361 0.24
362 0.24
363 0.23
364 0.23
365 0.27
366 0.25
367 0.27
368 0.25
369 0.29
370 0.29
371 0.29
372 0.3
373 0.26
374 0.27
375 0.24
376 0.23
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.13
381 0.12
382 0.1
383 0.1
384 0.17
385 0.18
386 0.19
387 0.18
388 0.2
389 0.2
390 0.18
391 0.18
392 0.1
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.16
412 0.16
413 0.22
414 0.24
415 0.24
416 0.26
417 0.31
418 0.33
419 0.35
420 0.38
421 0.36
422 0.35
423 0.35
424 0.3
425 0.23
426 0.18
427 0.13
428 0.08
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.05
445 0.04
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.04
455 0.05
456 0.06
457 0.08
458 0.12
459 0.17
460 0.21
461 0.31
462 0.4
463 0.49
464 0.59
465 0.66
466 0.72
467 0.76
468 0.82
469 0.83
470 0.84
471 0.83
472 0.78
473 0.75
474 0.68
475 0.66
476 0.57
477 0.49
478 0.42
479 0.34
480 0.29
481 0.22
482 0.19
483 0.13
484 0.11
485 0.08
486 0.05
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.08
498 0.1
499 0.1
500 0.12
501 0.17
502 0.22
503 0.24
504 0.25
505 0.23
506 0.22
507 0.22
508 0.23
509 0.19
510 0.13
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.08
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.07
522 0.07
523 0.09
524 0.1
525 0.11
526 0.17
527 0.22
528 0.27
529 0.32
530 0.35
531 0.37
532 0.37
533 0.43
534 0.39
535 0.35
536 0.3
537 0.29
538 0.25
539 0.22
540 0.21
541 0.14
542 0.13
543 0.12
544 0.11
545 0.07
546 0.06
547 0.07
548 0.06
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.09
556 0.13
557 0.14
558 0.14
559 0.17
560 0.16
561 0.21
562 0.22
563 0.22
564 0.22
565 0.21
566 0.22
567 0.23
568 0.24
569 0.18
570 0.17
571 0.15
572 0.11
573 0.11
574 0.1
575 0.07
576 0.08
577 0.1
578 0.12
579 0.16
580 0.16
581 0.18
582 0.18
583 0.18
584 0.18
585 0.18
586 0.22
587 0.2
588 0.21
589 0.21
590 0.22
591 0.22
592 0.22
593 0.21
594 0.16
595 0.15
596 0.13
597 0.11
598 0.12
599 0.11
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.13
606 0.14
607 0.17
608 0.19
609 0.2
610 0.23
611 0.3
612 0.35
613 0.35
614 0.34
615 0.3
616 0.31
617 0.33
618 0.32
619 0.33
620 0.31
621 0.37
622 0.4
623 0.43
624 0.42
625 0.44
626 0.42
627 0.34
628 0.31
629 0.23
630 0.2
631 0.18
632 0.17
633 0.13
634 0.1
635 0.1
636 0.09
637 0.09
638 0.08
639 0.08
640 0.08
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.1
645 0.11
646 0.11
647 0.12
648 0.18
649 0.18
650 0.2
651 0.19
652 0.19
653 0.24
654 0.26
655 0.27
656 0.23
657 0.25
658 0.27
659 0.32
660 0.31
661 0.27
662 0.29
663 0.28
664 0.33
665 0.31
666 0.27
667 0.22
668 0.22
669 0.2
670 0.15
671 0.14
672 0.08
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.06
680 0.04
681 0.04
682 0.05
683 0.07
684 0.08
685 0.1
686 0.12
687 0.12
688 0.14
689 0.14
690 0.13
691 0.13
692 0.13
693 0.15
694 0.15
695 0.15
696 0.14
697 0.14
698 0.15
699 0.14
700 0.15
701 0.11
702 0.1
703 0.11
704 0.11
705 0.13
706 0.13
707 0.13
708 0.13
709 0.2
710 0.21
711 0.22
712 0.23
713 0.21
714 0.19
715 0.2
716 0.28
717 0.29
718 0.32
719 0.38
720 0.41
721 0.49
722 0.59
723 0.62
724 0.6
725 0.56
726 0.57
727 0.5
728 0.48
729 0.44
730 0.36
731 0.32
732 0.32
733 0.29
734 0.26
735 0.25
736 0.25
737 0.22
738 0.21
739 0.23
740 0.17
741 0.21
742 0.19
743 0.2
744 0.2
745 0.22
746 0.27
747 0.25
748 0.27
749 0.24
750 0.26
751 0.27
752 0.25
753 0.25
754 0.21
755 0.21
756 0.19
757 0.18
758 0.15
759 0.17
760 0.18
761 0.16
762 0.16
763 0.15
764 0.17
765 0.18
766 0.19
767 0.2
768 0.21
769 0.24
770 0.24
771 0.26
772 0.27
773 0.27
774 0.25
775 0.22
776 0.21
777 0.19
778 0.19
779 0.16
780 0.13
781 0.13
782 0.12
783 0.1
784 0.11
785 0.1
786 0.1
787 0.1
788 0.09
789 0.11
790 0.12
791 0.13
792 0.19
793 0.23
794 0.29
795 0.34
796 0.38
797 0.35
798 0.36
799 0.4
800 0.37
801 0.42
802 0.4
803 0.38
804 0.38
805 0.42
806 0.42
807 0.43
808 0.4
809 0.33
810 0.3
811 0.26
812 0.22
813 0.19
814 0.17
815 0.13
816 0.1
817 0.1
818 0.09
819 0.1
820 0.09
821 0.09
822 0.11
823 0.13
824 0.15
825 0.15
826 0.18
827 0.18
828 0.26
829 0.26
830 0.24
831 0.25
832 0.23
833 0.25
834 0.29
835 0.39
836 0.37
837 0.46
838 0.48
839 0.51
840 0.55
841 0.53
842 0.47
843 0.38
844 0.35
845 0.3
846 0.27
847 0.22
848 0.2
849 0.2
850 0.19
851 0.2
852 0.19
853 0.17
854 0.24
855 0.28
856 0.34
857 0.36
858 0.4
859 0.44
860 0.43
861 0.49
862 0.49
863 0.53
864 0.52
865 0.54
866 0.58
867 0.54
868 0.6
869 0.62
870 0.63
871 0.65
872 0.68
873 0.72
874 0.7
875 0.73
876 0.73
877 0.71
878 0.66
879 0.62
880 0.56
881 0.46
882 0.39
883 0.33
884 0.26
885 0.19
886 0.17
887 0.1
888 0.09
889 0.09
890 0.08
891 0.08
892 0.11
893 0.15
894 0.18