Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PPQ1

Protein Details
Accession A0A1D8PPQ1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-399RSSGNRKDVKKDEQQNQPPKPQKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.833, cyto 6, cyto_mito 5.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0043024  F:ribosomal small subunit binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0033592  F:RNA strand annealing activity  
GO:0034057  F:RNA strand-exchange activity  
GO:0097010  P:eukaryotic translation initiation factor 4F complex assembly  
GO:0001731  P:formation of translation preinitiation complex  
KEGG cal:CAALFM_C601630WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAPPKKNVKMDLGSFLADDTFGGGSWADEEVDLNTIGVSLETPSFAGSTAAPIGNVGGGNNTASAGSGFGSGSGSGFGNDEFKRERKEFPIPDQPPYRARVSNLPWEVEESNVIRHFEDRMQAKDIISDIVLPKDRDTGRLRGFAFVTFNDRALLEESLNLSMTEFQGRKIYVNVAAPPKGEDGDWRAGRSGSNRRGGEDREPAPELDWGAARNSQAELPPRQRSNRLGSGSGPSGESSSSSRPSRRQEVELDWGSARNSRDGLPPQRERSNRTPRKQEPEFDWNTARNTQAELPVRERERPQRENPDGTPRENSTRQTPRKQEPEFDWGAARNTKTSLPPRERLNRTGSNSGKKSTEPDFDWKRGQSLPSRNVSRSSGNRKDVKKDEQQNQPPKPQKSHFSVLNVEGEDEDEEEDEKKEVKESKQQIDNLQQATSKLTVSEGQEDGEGWEVVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.33
3 0.25
4 0.18
5 0.14
6 0.09
7 0.07
8 0.06
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.09
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.13
66 0.13
67 0.16
68 0.19
69 0.23
70 0.3
71 0.32
72 0.36
73 0.37
74 0.48
75 0.5
76 0.54
77 0.61
78 0.57
79 0.62
80 0.62
81 0.6
82 0.54
83 0.52
84 0.49
85 0.4
86 0.4
87 0.41
88 0.41
89 0.46
90 0.45
91 0.42
92 0.38
93 0.39
94 0.37
95 0.28
96 0.26
97 0.17
98 0.19
99 0.2
100 0.2
101 0.17
102 0.17
103 0.19
104 0.18
105 0.24
106 0.23
107 0.24
108 0.27
109 0.28
110 0.28
111 0.27
112 0.25
113 0.19
114 0.16
115 0.14
116 0.11
117 0.14
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.22
122 0.23
123 0.27
124 0.3
125 0.34
126 0.35
127 0.4
128 0.41
129 0.37
130 0.37
131 0.32
132 0.29
133 0.22
134 0.24
135 0.19
136 0.18
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.15
160 0.17
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.21
165 0.21
166 0.2
167 0.17
168 0.15
169 0.13
170 0.14
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.22
177 0.26
178 0.31
179 0.29
180 0.37
181 0.36
182 0.38
183 0.4
184 0.42
185 0.41
186 0.38
187 0.34
188 0.29
189 0.3
190 0.28
191 0.26
192 0.24
193 0.18
194 0.12
195 0.11
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.14
205 0.18
206 0.22
207 0.28
208 0.3
209 0.32
210 0.35
211 0.38
212 0.4
213 0.43
214 0.39
215 0.35
216 0.33
217 0.34
218 0.3
219 0.26
220 0.2
221 0.13
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.14
228 0.17
229 0.2
230 0.25
231 0.3
232 0.38
233 0.38
234 0.39
235 0.39
236 0.41
237 0.45
238 0.4
239 0.37
240 0.29
241 0.26
242 0.23
243 0.23
244 0.19
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.17
249 0.23
250 0.3
251 0.35
252 0.4
253 0.43
254 0.5
255 0.51
256 0.54
257 0.58
258 0.62
259 0.64
260 0.65
261 0.71
262 0.7
263 0.77
264 0.74
265 0.68
266 0.64
267 0.64
268 0.61
269 0.54
270 0.49
271 0.42
272 0.4
273 0.38
274 0.32
275 0.23
276 0.21
277 0.19
278 0.23
279 0.26
280 0.26
281 0.27
282 0.33
283 0.34
284 0.35
285 0.39
286 0.42
287 0.46
288 0.5
289 0.55
290 0.59
291 0.63
292 0.65
293 0.63
294 0.64
295 0.58
296 0.53
297 0.5
298 0.42
299 0.43
300 0.41
301 0.41
302 0.39
303 0.47
304 0.52
305 0.57
306 0.62
307 0.64
308 0.71
309 0.71
310 0.67
311 0.62
312 0.61
313 0.54
314 0.47
315 0.4
316 0.32
317 0.33
318 0.31
319 0.26
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.26
324 0.33
325 0.39
326 0.42
327 0.47
328 0.54
329 0.63
330 0.66
331 0.64
332 0.64
333 0.62
334 0.61
335 0.66
336 0.63
337 0.62
338 0.6
339 0.58
340 0.51
341 0.44
342 0.43
343 0.39
344 0.39
345 0.33
346 0.4
347 0.44
348 0.47
349 0.51
350 0.48
351 0.46
352 0.42
353 0.43
354 0.42
355 0.44
356 0.48
357 0.51
358 0.55
359 0.54
360 0.55
361 0.54
362 0.53
363 0.53
364 0.56
365 0.56
366 0.59
367 0.66
368 0.66
369 0.72
370 0.72
371 0.71
372 0.71
373 0.71
374 0.72
375 0.75
376 0.81
377 0.82
378 0.81
379 0.83
380 0.82
381 0.79
382 0.79
383 0.75
384 0.72
385 0.7
386 0.7
387 0.65
388 0.62
389 0.6
390 0.54
391 0.52
392 0.45
393 0.37
394 0.3
395 0.25
396 0.2
397 0.16
398 0.13
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.13
405 0.13
406 0.18
407 0.24
408 0.28
409 0.37
410 0.45
411 0.53
412 0.58
413 0.62
414 0.63
415 0.66
416 0.67
417 0.59
418 0.53
419 0.46
420 0.39
421 0.38
422 0.32
423 0.23
424 0.17
425 0.17
426 0.19
427 0.21
428 0.25
429 0.22
430 0.22
431 0.21
432 0.22
433 0.2
434 0.19
435 0.16