Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PN34

Protein Details
Accession A0A1D8PN34    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-96QSSLPKATQKGKQDKKAPSKKTPVNPKLRDISHydrophilic
686-710TYYFMLQHYRRKAKKDRLQQLVNELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-85GKQDKKAPSKK
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG cal:CAALFM_C501140CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MIPLRQIVGRTTRSGFLQIRSASKAGTIALRYQSTTSTTTNTATPTTTPDNDNSKPSSETVKTEQSSLPKATQKGKQDKKAPSKKTPVNPKLRDISGQIKETIIQSTTDLNEAYSILEEGITFLREIQKSENITDRQIFKEFYPLATELFNLAQKPETTIDHSLNEIIDMFVKNKIAHSMHFIQLAANALKQNSEAYDEVLQYWFKSFEYTKSHDFLYVNNFNGIKTKIEYQPYDFTNLAIYAYVQSCIAQKVTYSPVDAAKFSPSGKIPPFYHIKKTLEVLDIYDGKKFREYCNLLETDSQERFNPNGASSIKKIENTPDKKQLDKFYQNVVDICNKRNIKVDEKVIVALMQRYFQFDEYNEVFSLFETIMNSGVKPSIDAWNIVIKAMTNPSRIASFGGKAKQQELVQNFERTLQTIVSSGVQFNGETVGAIVSGYANFGQFDKAQEYIDKYAKGVKDNGAVISLCNDGILRGLVYNGKIEEAESKLKQFMETHTQYKPHTHVMNDFLNYYAKKKNYKAINGITNFMRKHNIAENVSIKTTMINAYFESLHAIGKTPDLSSFLAKMESSENAGKRGFNEQMHSTLLKGLIQGANIEAARQLFDILKSRYPRSAWLNTNMMVGELTLGNVKLGEDIFNYYIKEIRNEPIIWNTFIHNLLARDEKLADFYFEKMKQDSQVQPNFYTYYFMLQHYRRKAKKDRLQQLVNELAEVDWTSYGTSLPDFIKRLTNYLDVPASLLSKLDKQQATVDKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.36
4 0.4
5 0.39
6 0.4
7 0.42
8 0.41
9 0.33
10 0.3
11 0.28
12 0.22
13 0.23
14 0.21
15 0.22
16 0.27
17 0.28
18 0.28
19 0.28
20 0.28
21 0.27
22 0.29
23 0.25
24 0.24
25 0.25
26 0.25
27 0.26
28 0.26
29 0.24
30 0.22
31 0.21
32 0.23
33 0.27
34 0.29
35 0.29
36 0.33
37 0.39
38 0.41
39 0.45
40 0.42
41 0.38
42 0.37
43 0.36
44 0.39
45 0.34
46 0.37
47 0.38
48 0.44
49 0.41
50 0.43
51 0.45
52 0.42
53 0.45
54 0.43
55 0.43
56 0.41
57 0.45
58 0.49
59 0.52
60 0.57
61 0.62
62 0.69
63 0.72
64 0.75
65 0.8
66 0.84
67 0.88
68 0.86
69 0.85
70 0.86
71 0.86
72 0.86
73 0.87
74 0.86
75 0.87
76 0.83
77 0.8
78 0.77
79 0.7
80 0.63
81 0.57
82 0.57
83 0.52
84 0.49
85 0.42
86 0.36
87 0.35
88 0.33
89 0.3
90 0.21
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.09
111 0.15
112 0.16
113 0.18
114 0.21
115 0.26
116 0.28
117 0.31
118 0.37
119 0.33
120 0.36
121 0.39
122 0.38
123 0.36
124 0.36
125 0.35
126 0.27
127 0.34
128 0.31
129 0.27
130 0.28
131 0.25
132 0.23
133 0.22
134 0.22
135 0.14
136 0.16
137 0.16
138 0.12
139 0.12
140 0.14
141 0.14
142 0.16
143 0.17
144 0.17
145 0.2
146 0.24
147 0.26
148 0.24
149 0.25
150 0.23
151 0.2
152 0.18
153 0.14
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.19
163 0.18
164 0.18
165 0.24
166 0.27
167 0.27
168 0.28
169 0.27
170 0.22
171 0.22
172 0.24
173 0.18
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.13
182 0.11
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.13
194 0.13
195 0.18
196 0.25
197 0.29
198 0.31
199 0.32
200 0.33
201 0.33
202 0.32
203 0.28
204 0.3
205 0.29
206 0.27
207 0.28
208 0.28
209 0.24
210 0.27
211 0.26
212 0.19
213 0.17
214 0.2
215 0.23
216 0.27
217 0.29
218 0.3
219 0.35
220 0.34
221 0.36
222 0.31
223 0.26
224 0.23
225 0.21
226 0.17
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.15
244 0.18
245 0.19
246 0.2
247 0.18
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.18
252 0.15
253 0.19
254 0.2
255 0.25
256 0.24
257 0.27
258 0.35
259 0.35
260 0.41
261 0.43
262 0.43
263 0.39
264 0.4
265 0.38
266 0.33
267 0.3
268 0.24
269 0.21
270 0.22
271 0.2
272 0.21
273 0.18
274 0.17
275 0.21
276 0.21
277 0.19
278 0.26
279 0.29
280 0.28
281 0.33
282 0.33
283 0.3
284 0.3
285 0.31
286 0.26
287 0.24
288 0.22
289 0.18
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.18
294 0.13
295 0.17
296 0.17
297 0.2
298 0.19
299 0.24
300 0.23
301 0.23
302 0.23
303 0.25
304 0.34
305 0.37
306 0.42
307 0.47
308 0.47
309 0.49
310 0.53
311 0.52
312 0.51
313 0.51
314 0.47
315 0.43
316 0.44
317 0.41
318 0.37
319 0.33
320 0.32
321 0.28
322 0.27
323 0.3
324 0.27
325 0.27
326 0.34
327 0.35
328 0.33
329 0.36
330 0.38
331 0.33
332 0.33
333 0.32
334 0.25
335 0.23
336 0.17
337 0.15
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.1
346 0.15
347 0.15
348 0.16
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.09
375 0.09
376 0.13
377 0.14
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.12
385 0.12
386 0.14
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.2
393 0.24
394 0.22
395 0.25
396 0.26
397 0.26
398 0.26
399 0.24
400 0.23
401 0.19
402 0.18
403 0.12
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.03
423 0.03
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.12
436 0.14
437 0.17
438 0.19
439 0.18
440 0.17
441 0.21
442 0.22
443 0.23
444 0.22
445 0.2
446 0.21
447 0.22
448 0.22
449 0.18
450 0.17
451 0.15
452 0.14
453 0.12
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.1
471 0.12
472 0.16
473 0.16
474 0.17
475 0.19
476 0.19
477 0.2
478 0.18
479 0.19
480 0.24
481 0.27
482 0.3
483 0.3
484 0.33
485 0.33
486 0.36
487 0.36
488 0.33
489 0.31
490 0.29
491 0.3
492 0.32
493 0.35
494 0.32
495 0.29
496 0.24
497 0.24
498 0.23
499 0.23
500 0.24
501 0.24
502 0.3
503 0.32
504 0.39
505 0.43
506 0.49
507 0.54
508 0.55
509 0.59
510 0.54
511 0.54
512 0.49
513 0.46
514 0.41
515 0.34
516 0.31
517 0.23
518 0.25
519 0.28
520 0.33
521 0.29
522 0.34
523 0.35
524 0.34
525 0.34
526 0.31
527 0.24
528 0.18
529 0.17
530 0.14
531 0.12
532 0.1
533 0.1
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.14
538 0.12
539 0.11
540 0.1
541 0.11
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.1
546 0.1
547 0.12
548 0.13
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.14
555 0.13
556 0.13
557 0.15
558 0.19
559 0.19
560 0.21
561 0.22
562 0.22
563 0.22
564 0.26
565 0.27
566 0.24
567 0.27
568 0.27
569 0.28
570 0.3
571 0.29
572 0.24
573 0.21
574 0.2
575 0.16
576 0.14
577 0.15
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.11
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.1
586 0.09
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.09
591 0.11
592 0.18
593 0.2
594 0.26
595 0.29
596 0.32
597 0.35
598 0.35
599 0.4
600 0.41
601 0.47
602 0.46
603 0.48
604 0.5
605 0.45
606 0.46
607 0.39
608 0.31
609 0.22
610 0.17
611 0.12
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.11
624 0.13
625 0.14
626 0.15
627 0.14
628 0.17
629 0.17
630 0.2
631 0.19
632 0.21
633 0.25
634 0.26
635 0.27
636 0.32
637 0.35
638 0.33
639 0.31
640 0.3
641 0.28
642 0.27
643 0.26
644 0.21
645 0.19
646 0.2
647 0.24
648 0.22
649 0.21
650 0.22
651 0.21
652 0.21
653 0.21
654 0.21
655 0.18
656 0.19
657 0.25
658 0.26
659 0.29
660 0.28
661 0.29
662 0.3
663 0.37
664 0.43
665 0.45
666 0.5
667 0.51
668 0.5
669 0.51
670 0.48
671 0.41
672 0.36
673 0.27
674 0.26
675 0.24
676 0.25
677 0.3
678 0.33
679 0.42
680 0.49
681 0.59
682 0.59
683 0.66
684 0.74
685 0.78
686 0.82
687 0.85
688 0.84
689 0.84
690 0.85
691 0.8
692 0.77
693 0.74
694 0.64
695 0.53
696 0.43
697 0.33
698 0.26
699 0.23
700 0.16
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.11
709 0.13
710 0.18
711 0.19
712 0.21
713 0.29
714 0.29
715 0.33
716 0.34
717 0.36
718 0.33
719 0.36
720 0.36
721 0.27
722 0.28
723 0.25
724 0.22
725 0.18
726 0.17
727 0.15
728 0.18
729 0.22
730 0.3
731 0.29
732 0.3
733 0.38