Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RVX2

Protein Details
Accession F4RVX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-243DTFKEERLTKKKRSRRENPLRKKAFABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-243LTKKKRSRRENPLRKKAFA
Subcellular Location(s) nucl 14cyto_nucl 14, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_109264  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MAESQSSSGALFEASILRLSFDSMEVAQTTSAQASESNVGASSNLGTSHPAPGTLDTDTIMNDPTSGPSDTNVDEKTNGMNPEGLTEADNKEGLTKEEDLGDTIPEDATETVYLNNLNEKVKIPILKQTLKNLLKNFGPVLDVVAHQSVRMRGQAFVAFPEREMAAKAVKEVKGFPLYGKPYRTLLRLLYYATSSYEIAFARTPADAVVKRKTPDEYDTFKEERLTKKKRSRRENPLRKKAFAQKEAARIAAESAIAAGGVAPTTSATAASTNSGRRIVQMPDEYQPPNKILFVQNLPENAGKDALEVLFKQYANLVEVRTIPGRATIAFVEYTDATSSGVAKDALHNYKFDGEHKIKVTFAKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.12
10 0.11
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.12
15 0.11
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.08
20 0.08
21 0.1
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.11
34 0.12
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.17
40 0.19
41 0.17
42 0.17
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.12
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.15
57 0.16
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.18
63 0.2
64 0.21
65 0.21
66 0.18
67 0.19
68 0.17
69 0.18
70 0.18
71 0.16
72 0.12
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.18
109 0.21
110 0.19
111 0.24
112 0.3
113 0.35
114 0.37
115 0.4
116 0.48
117 0.49
118 0.53
119 0.48
120 0.45
121 0.39
122 0.38
123 0.32
124 0.22
125 0.18
126 0.13
127 0.13
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.13
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.17
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.17
163 0.19
164 0.22
165 0.25
166 0.26
167 0.24
168 0.25
169 0.26
170 0.27
171 0.23
172 0.2
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.11
180 0.11
181 0.09
182 0.08
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.06
192 0.1
193 0.12
194 0.15
195 0.19
196 0.22
197 0.23
198 0.25
199 0.26
200 0.25
201 0.27
202 0.3
203 0.31
204 0.31
205 0.37
206 0.36
207 0.34
208 0.35
209 0.34
210 0.37
211 0.43
212 0.46
213 0.5
214 0.59
215 0.67
216 0.73
217 0.8
218 0.81
219 0.82
220 0.86
221 0.88
222 0.89
223 0.92
224 0.88
225 0.8
226 0.76
227 0.75
228 0.72
229 0.66
230 0.62
231 0.57
232 0.58
233 0.57
234 0.51
235 0.41
236 0.32
237 0.27
238 0.2
239 0.15
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.06
257 0.08
258 0.11
259 0.13
260 0.15
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.21
265 0.22
266 0.25
267 0.27
268 0.28
269 0.29
270 0.33
271 0.33
272 0.33
273 0.33
274 0.28
275 0.25
276 0.23
277 0.23
278 0.23
279 0.26
280 0.27
281 0.28
282 0.29
283 0.29
284 0.31
285 0.3
286 0.28
287 0.23
288 0.21
289 0.17
290 0.14
291 0.15
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.14
296 0.17
297 0.17
298 0.16
299 0.17
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.17
304 0.15
305 0.16
306 0.2
307 0.19
308 0.18
309 0.16
310 0.17
311 0.18
312 0.16
313 0.17
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.15
321 0.13
322 0.13
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.15
331 0.23
332 0.3
333 0.3
334 0.3
335 0.31
336 0.36
337 0.37
338 0.35
339 0.37
340 0.34
341 0.4
342 0.43
343 0.43
344 0.39