Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M7UPU6

Protein Details
Accession M7UPU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27KSTPSYWCKHCKQYVKDTKLEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-280KKRKAKNIRQR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPSYWCKHCKQYVKDTKLEKANHEASPRHQGNLKRFLRDLHRGHEKDEREKDRAKNEIARLNGIVSGSGEAGGSSQSSRPSSSTPKPPATAAQRKQQLAQLAELGVSVPDEFRSDLAMAGEWQVTSERVIDDGSGETKPDALALGVRKREAEDEDEEAKEAKKRRWGTAIRTYPTENNDDDLDALLSHNSKGKGPDVKPETNDGISIKTETKPEEAAEPSLNSGKEEPVVKPEIEENVEIDIKQIPEATEQNSEPAASGVVFKKRKAKNIRQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.79
4 0.78
5 0.8
6 0.83
7 0.8
8 0.8
9 0.76
10 0.75
11 0.73
12 0.69
13 0.62
14 0.6
15 0.58
16 0.55
17 0.55
18 0.5
19 0.46
20 0.53
21 0.5
22 0.43
23 0.43
24 0.45
25 0.48
26 0.56
27 0.55
28 0.49
29 0.49
30 0.51
31 0.54
32 0.57
33 0.53
34 0.5
35 0.57
36 0.53
37 0.56
38 0.59
39 0.56
40 0.56
41 0.61
42 0.59
43 0.54
44 0.6
45 0.63
46 0.62
47 0.63
48 0.58
49 0.56
50 0.55
51 0.55
52 0.5
53 0.46
54 0.4
55 0.34
56 0.3
57 0.22
58 0.17
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.07
70 0.09
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.17
75 0.24
76 0.3
77 0.38
78 0.42
79 0.45
80 0.45
81 0.45
82 0.48
83 0.5
84 0.54
85 0.48
86 0.5
87 0.53
88 0.52
89 0.53
90 0.49
91 0.45
92 0.36
93 0.32
94 0.24
95 0.18
96 0.17
97 0.15
98 0.12
99 0.07
100 0.05
101 0.04
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.03
136 0.06
137 0.09
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.16
145 0.17
146 0.15
147 0.18
148 0.2
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.19
156 0.25
157 0.29
158 0.32
159 0.41
160 0.45
161 0.49
162 0.56
163 0.61
164 0.55
165 0.54
166 0.52
167 0.46
168 0.44
169 0.39
170 0.29
171 0.22
172 0.21
173 0.19
174 0.17
175 0.14
176 0.11
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.19
187 0.27
188 0.27
189 0.36
190 0.4
191 0.43
192 0.43
193 0.46
194 0.44
195 0.36
196 0.37
197 0.28
198 0.23
199 0.19
200 0.2
201 0.17
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.21
209 0.21
210 0.22
211 0.22
212 0.2
213 0.2
214 0.23
215 0.22
216 0.19
217 0.18
218 0.17
219 0.18
220 0.2
221 0.18
222 0.2
223 0.23
224 0.22
225 0.22
226 0.23
227 0.24
228 0.24
229 0.23
230 0.19
231 0.19
232 0.2
233 0.19
234 0.17
235 0.16
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.12
240 0.16
241 0.19
242 0.21
243 0.23
244 0.23
245 0.24
246 0.24
247 0.23
248 0.19
249 0.17
250 0.14
251 0.1
252 0.13
253 0.16
254 0.25
255 0.28
256 0.31
257 0.41
258 0.46
259 0.56
260 0.63