FuNGI

M9MJ87

Protein Details

Accession

M9MJ87

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
338-360	KEENNARRLRKRRRTGKFPIPPQ	Basic
466-486	SESERQKRSRRSAATKGKERS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
344-354	RRLRKRRRTGK
472-481	KRSRRSAATK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 8, cyto_nucl 8, extr 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSYSNGGANMQGAGAAAGSGVAAASAASTSRSRRELIDRVKYPNPIPLPPYPPKLVKIPAEPSRYANAHFADRLASQQPVPLIVDVHAGMPIDLANFQNLWEGDLSEVSVPATASLNAQDLDDADAFLLQDFATNLPAAATTNSAPGAIGLITSLNATDDPASQAALAAALQQRHTQSLGPGAKAALAADDVSWLRRTEYLGTHLKAQQQVQKPKVTQRIDISREAQLAKIEQSFKDAQQPLASLKHPHKRGVKAVQVFDFLPDPETWATNYQVVRFIDPPGRIVNGVPQPDPRLDVAILRPVSAADGEQRVSYYLPAGEDIPEDPEEPMTLLDNPDKEENNARRLRKRRRTGKFPIPPQDEDQAESSPKLLKRDYATAYKLARDYVPKDTAETAHDVLVLTLDDGVPDADPDANFDPIKGAVSAPANTADEDDDDLFGDDDDDDDTSPKGDNAANHIDSTLPPQSESERQKRSRRSAATKGKERSEQPAGDGLTSTAPPKARAYYHKVGMRFTLRVWRSRFANNEKLRNRDRRYPGKWDAILLANRELTEREKLRRLHARSNVDDVGHLDPYEPSDDEIEEAVEPADEHAADADATSQEAERDEPRADANGDADADADADGAASDNDAEKSDGADDDDDEDNDDDDDDEDGTVDGDEELAALRAEAEDAGEDLDVDDGARRPRSRRSAPSTDAAAAMEEDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.04
4	0.03
5	0.03
6	0.03
7	0.03
8	0.02
9	0.02
10	0.02
11	0.03
12	0.03
13	0.04
14	0.06
15	0.1
16	0.13
17	0.19
18	0.22
19	0.24
20	0.29
21	0.37
22	0.45
23	0.52
24	0.59
25	0.59
26	0.63
27	0.67
28	0.67
29	0.6
30	0.59
31	0.53
32	0.46
33	0.46
34	0.47
35	0.5
36	0.51
37	0.56
38	0.53
39	0.53
40	0.52
41	0.53
42	0.53
43	0.5
44	0.51
45	0.53
46	0.56
47	0.58
48	0.57
49	0.54
50	0.54
51	0.5
52	0.45
53	0.42
54	0.36
55	0.34
56	0.32
57	0.29
58	0.25
59	0.24
60	0.25
61	0.22
62	0.21
63	0.17
64	0.19
65	0.19
66	0.18
67	0.19
68	0.16
69	0.14
70	0.13
71	0.15
72	0.13
73	0.12
74	0.11
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.08
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.13
86	0.13
87	0.13
88	0.12
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.13
93	0.08
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.11
104	0.1
105	0.11
106	0.1
107	0.09
108	0.12
109	0.11
110	0.1
111	0.08
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.08
116	0.04
117	0.05
118	0.06
119	0.06
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.09
128	0.08
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.09
135	0.06
136	0.06
137	0.04
138	0.04
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.05
144	0.05
145	0.06
146	0.07
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.06
155	0.08
156	0.1
157	0.11
158	0.12
159	0.15
160	0.16
161	0.17
162	0.18
163	0.16
164	0.14
165	0.23
166	0.24
167	0.22
168	0.22
169	0.2
170	0.2
171	0.19
172	0.18
173	0.09
174	0.06
175	0.06
176	0.05
177	0.07
178	0.07
179	0.08
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.13
185	0.15
186	0.17
187	0.23
188	0.28
189	0.28
190	0.32
191	0.34
192	0.36
193	0.36
194	0.37
195	0.39
196	0.41
197	0.5
198	0.5
199	0.53
200	0.52
201	0.56
202	0.62
203	0.57
204	0.53
205	0.51
206	0.56
207	0.54
208	0.55
209	0.49
210	0.43
211	0.42
212	0.38
213	0.31
214	0.23
215	0.2
216	0.18
217	0.19
218	0.18
219	0.16
220	0.2
221	0.21
222	0.21
223	0.28
224	0.28
225	0.25
226	0.24
227	0.25
228	0.23
229	0.24
230	0.25
231	0.21
232	0.28
233	0.35
234	0.36
235	0.42
236	0.47
237	0.49
238	0.55
239	0.58
240	0.59
241	0.56
242	0.56
243	0.5
244	0.45
245	0.4
246	0.33
247	0.26
248	0.18
249	0.15
250	0.11
251	0.12
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.12
256	0.13
257	0.15
258	0.16
259	0.15
260	0.2
261	0.19
262	0.2
263	0.19
264	0.21
265	0.21
266	0.21
267	0.22
268	0.17
269	0.18
270	0.16
271	0.15
272	0.19
273	0.19
274	0.2
275	0.2
276	0.2
277	0.21
278	0.21
279	0.23
280	0.16
281	0.14
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.17
286	0.17
287	0.15
288	0.15
289	0.13
290	0.13
291	0.11
292	0.11
293	0.06
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.1
323	0.11
324	0.12
325	0.12
326	0.2
327	0.22
328	0.29
329	0.34
330	0.37
331	0.43
332	0.53
333	0.63
334	0.65
335	0.73
336	0.75
337	0.78
338	0.83
339	0.84
340	0.85
341	0.82
342	0.8
343	0.79
344	0.74
345	0.67
346	0.6
347	0.55
348	0.44
349	0.37
350	0.31
351	0.22
352	0.18
353	0.16
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.16
358	0.15
359	0.17
360	0.19
361	0.24
362	0.27
363	0.28
364	0.28
365	0.3
366	0.31
367	0.29
368	0.27
369	0.23
370	0.21
371	0.19
372	0.2
373	0.21
374	0.23
375	0.21
376	0.22
377	0.22
378	0.22
379	0.2
380	0.2
381	0.15
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.1
386	0.09
387	0.07
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.07
400	0.08
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.08
408	0.07
409	0.08
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.09
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.09
439	0.09
440	0.14
441	0.2
442	0.2
443	0.2
444	0.2
445	0.19
446	0.17
447	0.21
448	0.19
449	0.13
450	0.13
451	0.14
452	0.17
453	0.25
454	0.32
455	0.37
456	0.43
457	0.51
458	0.59
459	0.67
460	0.72
461	0.74
462	0.75
463	0.74
464	0.76
465	0.79
466	0.8
467	0.8
468	0.77
469	0.72
470	0.69
471	0.62
472	0.58
473	0.54
474	0.45
475	0.38
476	0.38
477	0.34
478	0.28
479	0.26
480	0.2
481	0.15
482	0.14
483	0.13
484	0.11
485	0.11
486	0.13
487	0.15
488	0.18
489	0.21
490	0.27
491	0.35
492	0.39
493	0.46
494	0.48
495	0.47
496	0.45
497	0.46
498	0.43
499	0.35
500	0.3
501	0.32
502	0.3
503	0.36
504	0.39
505	0.39
506	0.38
507	0.44
508	0.51
509	0.49
510	0.57
511	0.57
512	0.64
513	0.64
514	0.68
515	0.71
516	0.73
517	0.71
518	0.71
519	0.73
520	0.73
521	0.75
522	0.76
523	0.75
524	0.73
525	0.68
526	0.59
527	0.53
528	0.48
529	0.45
530	0.37
531	0.32
532	0.24
533	0.23
534	0.22
535	0.21
536	0.18
537	0.23
538	0.25
539	0.29
540	0.35
541	0.38
542	0.45
543	0.54
544	0.57
545	0.59
546	0.63
547	0.66
548	0.62
549	0.67
550	0.6
551	0.5
552	0.45
553	0.37
554	0.31
555	0.23
556	0.2
557	0.14
558	0.12
559	0.14
560	0.15
561	0.13
562	0.12
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.12
567	0.12
568	0.09
569	0.09
570	0.08
571	0.07
572	0.07
573	0.06
574	0.07
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.07
582	0.06
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.11
589	0.11
590	0.14
591	0.14
592	0.15
593	0.16
594	0.19
595	0.19
596	0.17
597	0.17
598	0.16
599	0.15
600	0.14
601	0.13
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.05
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.06
614	0.07
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.1
619	0.11
620	0.11
621	0.12
622	0.12
623	0.11
624	0.14
625	0.15
626	0.14
627	0.15
628	0.15
629	0.14
630	0.13
631	0.13
632	0.1
633	0.09
634	0.1
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.06
641	0.06
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.04
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.05
656	0.06
657	0.07
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.05
664	0.08
665	0.1
666	0.16
667	0.23
668	0.26
669	0.3
670	0.41
671	0.51
672	0.58
673	0.65
674	0.69
675	0.73
676	0.74
677	0.76
678	0.71
679	0.62
680	0.54
681	0.43
682	0.35
683	0.25

M9MJ87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer