Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M9LRI4

Protein Details
Accession M9LRI4    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-81VTRARGRRGRQRQYRSAAPKHydrophilic
188-218LNSFVNMRAKWRKKRMRRLRRKRRKMRARSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-98RARGRRGRQRQYRSAAPKIRQVEQARGRGGERERE
195-218RAKWRKKRMRRLRRKRRKMRARSK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007836  Ribosomal_L41  
IPR036161  RPB6/omega-like_sf  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05162  Ribosomal_L41  
Amino Acid Sequences MNAPVLVPTEGETDPLEIAMKELAAKKIPLVVRRYLPDGSYEDWTVSELIVTEPRHGSGGTVTRARGRRGRQRQYRSAAPKIRQVEQARGRGGEREREREEGYKARPGVCATFFSPTNQLSFDQVSDGIAVDIAQASVHAAAAWPSDLGTSSSHNSISSQAVAHRPCPHPVSESSLSSHIAPPCIFYLNSFVNMRAKWRKKRMRRLRRKRRKMRARSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.09
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.1
9 0.13
10 0.16
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.23
15 0.27
16 0.3
17 0.31
18 0.34
19 0.37
20 0.4
21 0.43
22 0.38
23 0.35
24 0.32
25 0.31
26 0.28
27 0.26
28 0.24
29 0.2
30 0.19
31 0.19
32 0.15
33 0.12
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.12
38 0.12
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.13
46 0.18
47 0.19
48 0.2
49 0.21
50 0.26
51 0.3
52 0.33
53 0.36
54 0.39
55 0.46
56 0.55
57 0.65
58 0.69
59 0.75
60 0.8
61 0.79
62 0.81
63 0.77
64 0.76
65 0.72
66 0.65
67 0.63
68 0.58
69 0.54
70 0.53
71 0.49
72 0.49
73 0.48
74 0.51
75 0.44
76 0.42
77 0.39
78 0.36
79 0.35
80 0.34
81 0.31
82 0.32
83 0.33
84 0.35
85 0.37
86 0.34
87 0.36
88 0.33
89 0.32
90 0.3
91 0.29
92 0.27
93 0.26
94 0.24
95 0.23
96 0.18
97 0.18
98 0.14
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.02
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.09
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.19
149 0.2
150 0.23
151 0.28
152 0.29
153 0.32
154 0.34
155 0.33
156 0.31
157 0.31
158 0.36
159 0.33
160 0.32
161 0.31
162 0.3
163 0.3
164 0.27
165 0.3
166 0.23
167 0.22
168 0.2
169 0.2
170 0.2
171 0.21
172 0.2
173 0.16
174 0.2
175 0.2
176 0.24
177 0.23
178 0.23
179 0.26
180 0.27
181 0.34
182 0.39
183 0.47
184 0.53
185 0.63
186 0.72
187 0.78
188 0.89
189 0.92
190 0.93
191 0.95
192 0.96
193 0.96
194 0.97
195 0.98
196 0.97
197 0.97
198 0.97