FuNGI

Q5AFD2

Protein Details

Accession

Q5AFD2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
102-131	TVENPQERLLPRKRKKRWDVTPEEYKKQKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-118	PRKRKKR

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
KEGG	cal:CAALFM_C403150WA -

Amino Acid Sequences

MKRIMAPIEQKRNLAGNYSIPDSLNKELQKEFAEDVSTPMDKLQDDIINQNNYNKKRFQRSIVLDLDEQKSYKQIMNERNLEREELRVEKLIKEKDDGTTKTVENPQERLLPRKRKKRWDVTPEEYKKQKECENNKELVKKSTSSLIIELVEGKVPVVRGIPLTDSILEKILPPGYVKVNPPAHFKQNEETLPPDLSDAVVSSNYYLPPTNESVGISTTEIPTDVPGVKGLEFFKEEDMKYFGKLVHSKPESLNDEEKKELNAMKLVLKIKNGSPVTRKRAMRQLTNNAAKFGPKVLLNQILPILLEPNLTPQERHLLIKMIGRIIYQLDELIRPYTSKVLTVISPFLIDEDPTVRLETREIISGLTKAAGLANIISTLRPDLDHVDEYVRNLTARIFAIVANTLGLKSFLPFLKAVIKSKKNWTARHTGIKVIQQLCIMLGRGNGTAILPYLANIVEILKPPINDESLQVRTITALTLAQLAENVSPYGIDSFEPILEPIWFGIRKHRGKGLASFLKCIGAMIPLMSYDPNYEDYTNYYTTELMHIITREFRSPDEDMRKTILRIIMGLPLSRKLIPDYEKSIIGPFVNAFWNRRTASDSVQITRLVVEATNHLAIKFDFLDMLEHIVYFTKDDNEQLRKLAIEAINKLISNNSQELIGMDSQLDRKLVDGALFAFQKQTIHQKIYLTCFGTLADALNVRLKPHLNSILSTILYRMKNKLAEIRQQASDLIAIIAPVIKQCSEHDDELLMKLILILYESLGEVYPEVLGSILNALYSCLDSIDKSTLYTMSNPSINQILPTLTPILKNRHEKVQEACIKLVGLIARKNSETINAKEWMRICFDLLEMLKAQRKRIRIAANNTFGYIAKTIGPQDVIVMLLNNLRVQERQLRVCTAVAMGIVAETCLPFTVLPAIMNEYRIPEKNVQNGVLKAMSFMFEYLDGKITKDYLFAITPLLEDALTDRDLVHRQTAATVIFHIAMNCIGLTDKDYSDVFIHYLNLIMPNIFETSPHVISRILESIDALRLVIGNGVFTNYIWSGLFHPARKVRAPYWKIFNNAYVQCSDALVPCYPRIESLPDEDEISYKLEELDLFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.38
3	0.33
4	0.33
5	0.35
6	0.33
7	0.28
8	0.3
9	0.3
10	0.31
11	0.32
12	0.3
13	0.31
14	0.31
15	0.34
16	0.34
17	0.34
18	0.31
19	0.26
20	0.27
21	0.23
22	0.24
23	0.25
24	0.23
25	0.2
26	0.19
27	0.19
28	0.17
29	0.18
30	0.21
31	0.2
32	0.21
33	0.27
34	0.33
35	0.36
36	0.37
37	0.43
38	0.46
39	0.47
40	0.52
41	0.54
42	0.55
43	0.61
44	0.66
45	0.66
46	0.68
47	0.71
48	0.74
49	0.71
50	0.67
51	0.59
52	0.58
53	0.53
54	0.44
55	0.37
56	0.29
57	0.27
58	0.25
59	0.26
60	0.27
61	0.32
62	0.4
63	0.48
64	0.57
65	0.57
66	0.6
67	0.58
68	0.56
69	0.48
70	0.43
71	0.38
72	0.33
73	0.33
74	0.32
75	0.33
76	0.34
77	0.41
78	0.43
79	0.4
80	0.4
81	0.4
82	0.41
83	0.48
84	0.45
85	0.4
86	0.39
87	0.37
88	0.4
89	0.45
90	0.45
91	0.41
92	0.42
93	0.42
94	0.46
95	0.48
96	0.5
97	0.54
98	0.58
99	0.64
100	0.72
101	0.78
102	0.81
103	0.89
104	0.91
105	0.92
106	0.92
107	0.92
108	0.89
109	0.91
110	0.87
111	0.85
112	0.81
113	0.75
114	0.69
115	0.65
116	0.64
117	0.63
118	0.66
119	0.68
120	0.68
121	0.7
122	0.71
123	0.73
124	0.69
125	0.65
126	0.59
127	0.5
128	0.45
129	0.44
130	0.4
131	0.34
132	0.32
133	0.28
134	0.24
135	0.23
136	0.23
137	0.16
138	0.15
139	0.12
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.12
148	0.13
149	0.14
150	0.15
151	0.15
152	0.16
153	0.16
154	0.16
155	0.14
156	0.13
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.14
161	0.16
162	0.19
163	0.23
164	0.25
165	0.31
166	0.37
167	0.39
168	0.46
169	0.48
170	0.51
171	0.5
172	0.51
173	0.48
174	0.48
175	0.48
176	0.43
177	0.41
178	0.35
179	0.33
180	0.3
181	0.25
182	0.17
183	0.15
184	0.12
185	0.1
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.16
196	0.19
197	0.19
198	0.18
199	0.18
200	0.18
201	0.17
202	0.18
203	0.15
204	0.13
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.1
214	0.12
215	0.12
216	0.14
217	0.15
218	0.15
219	0.16
220	0.16
221	0.19
222	0.22
223	0.22
224	0.22
225	0.25
226	0.23
227	0.22
228	0.23
229	0.21
230	0.23
231	0.28
232	0.28
233	0.35
234	0.36
235	0.38
236	0.38
237	0.45
238	0.42
239	0.42
240	0.48
241	0.41
242	0.43
243	0.42
244	0.41
245	0.34
246	0.33
247	0.3
248	0.23
249	0.22
250	0.2
251	0.21
252	0.26
253	0.29
254	0.28
255	0.28
256	0.28
257	0.27
258	0.34
259	0.33
260	0.32
261	0.37
262	0.44
263	0.49
264	0.55
265	0.56
266	0.52
267	0.6
268	0.61
269	0.62
270	0.62
271	0.64
272	0.66
273	0.72
274	0.67
275	0.6
276	0.54
277	0.46
278	0.38
279	0.3
280	0.22
281	0.15
282	0.17
283	0.19
284	0.24
285	0.23
286	0.24
287	0.22
288	0.2
289	0.18
290	0.16
291	0.13
292	0.07
293	0.08
294	0.07
295	0.1
296	0.14
297	0.14
298	0.14
299	0.14
300	0.21
301	0.22
302	0.23
303	0.2
304	0.2
305	0.22
306	0.25
307	0.26
308	0.21
309	0.2
310	0.19
311	0.18
312	0.15
313	0.14
314	0.11
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.13
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.13
328	0.14
329	0.15
330	0.16
331	0.12
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.1
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.11
345	0.13
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.09
354	0.08
355	0.06
356	0.07
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.09
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.15
374	0.15
375	0.16
376	0.17
377	0.14
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.09
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.05
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.08
397	0.08
398	0.1
399	0.1
400	0.12
401	0.18
402	0.21
403	0.26
404	0.32
405	0.36
406	0.38
407	0.46
408	0.54
409	0.54
410	0.57
411	0.57
412	0.57
413	0.58
414	0.64
415	0.57
416	0.52
417	0.48
418	0.46
419	0.48
420	0.4
421	0.35
422	0.26
423	0.25
424	0.21
425	0.18
426	0.14
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.11
450	0.12
451	0.12
452	0.11
453	0.13
454	0.16
455	0.17
456	0.17
457	0.16
458	0.15
459	0.14
460	0.13
461	0.11
462	0.07
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.05
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.05
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.16
492	0.25
493	0.28
494	0.3
495	0.33
496	0.34
497	0.35
498	0.39
499	0.4
500	0.39
501	0.36
502	0.36
503	0.32
504	0.29
505	0.27
506	0.23
507	0.14
508	0.07
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.04
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.04
517	0.06
518	0.08
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.12
523	0.14
524	0.15
525	0.14
526	0.12
527	0.11
528	0.11
529	0.12
530	0.1
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.1
536	0.1
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.14
541	0.15
542	0.21
543	0.26
544	0.27
545	0.26
546	0.29
547	0.29
548	0.26
549	0.27
550	0.22
551	0.14
552	0.14
553	0.13
554	0.14
555	0.13
556	0.14
557	0.12
558	0.11
559	0.13
560	0.12
561	0.12
562	0.1
563	0.14
564	0.16
565	0.19
566	0.22
567	0.22
568	0.22
569	0.22
570	0.22
571	0.18
572	0.15
573	0.13
574	0.08
575	0.08
576	0.11
577	0.11
578	0.12
579	0.12
580	0.17
581	0.17
582	0.18
583	0.2
584	0.18
585	0.21
586	0.26
587	0.27
588	0.24
589	0.25
590	0.24
591	0.21
592	0.19
593	0.16
594	0.09
595	0.08
596	0.07
597	0.06
598	0.08
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.1
605	0.09
606	0.07
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.07
611	0.09
612	0.07
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.07
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.1
622	0.15
623	0.19
624	0.19
625	0.19
626	0.19
627	0.18
628	0.18
629	0.2
630	0.18
631	0.16
632	0.17
633	0.19
634	0.2
635	0.2
636	0.19
637	0.15
638	0.14
639	0.14
640	0.13
641	0.11
642	0.1
643	0.1
644	0.1
645	0.11
646	0.1
647	0.07
648	0.06
649	0.07
650	0.08
651	0.09
652	0.09
653	0.07
654	0.07
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.07
659	0.08
660	0.11
661	0.11
662	0.1
663	0.1
664	0.1
665	0.1
666	0.11
667	0.19
668	0.19
669	0.22
670	0.24
671	0.27
672	0.29
673	0.33
674	0.35
675	0.28
676	0.25
677	0.23
678	0.21
679	0.18
680	0.15
681	0.11
682	0.08
683	0.07
684	0.07
685	0.11
686	0.11
687	0.11
688	0.14
689	0.14
690	0.15
691	0.19
692	0.25
693	0.22
694	0.22
695	0.24
696	0.24
697	0.23
698	0.22
699	0.19
700	0.18
701	0.2
702	0.21
703	0.21
704	0.22
705	0.24
706	0.25
707	0.32
708	0.31
709	0.37
710	0.42
711	0.43
712	0.4
713	0.39
714	0.37
715	0.29
716	0.24
717	0.16
718	0.1
719	0.07
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.06
726	0.05
727	0.06
728	0.07
729	0.13
730	0.17
731	0.17
732	0.18
733	0.18
734	0.19
735	0.19
736	0.19
737	0.13
738	0.09
739	0.08
740	0.08
741	0.06
742	0.06
743	0.05
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.04
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.03
756	0.03
757	0.03
758	0.04
759	0.04
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.06
768	0.06
769	0.08
770	0.1
771	0.1
772	0.1
773	0.11
774	0.12
775	0.13
776	0.15
777	0.15
778	0.16
779	0.17
780	0.17
781	0.18
782	0.18
783	0.17
784	0.16
785	0.14
786	0.12
787	0.1
788	0.12
789	0.13
790	0.12
791	0.15
792	0.19
793	0.25
794	0.32
795	0.4
796	0.41
797	0.47
798	0.49
799	0.49
800	0.49
801	0.53
802	0.52
803	0.48
804	0.45
805	0.37
806	0.34
807	0.3
808	0.28
809	0.2
810	0.16
811	0.16
812	0.18
813	0.2
814	0.2
815	0.21
816	0.2
817	0.24
818	0.27
819	0.27
820	0.29
821	0.31
822	0.31
823	0.34
824	0.35
825	0.3
826	0.29
827	0.26
828	0.23
829	0.19
830	0.19
831	0.2
832	0.18
833	0.18
834	0.15
835	0.18
836	0.22
837	0.24
838	0.3
839	0.3
840	0.34
841	0.36
842	0.43
843	0.5
844	0.53
845	0.61
846	0.63
847	0.65
848	0.62
849	0.58
850	0.51
851	0.41
852	0.35
853	0.26
854	0.17
855	0.12
856	0.13
857	0.13
858	0.14
859	0.14
860	0.12
861	0.12
862	0.11
863	0.1
864	0.09
865	0.08
866	0.07
867	0.08
868	0.09
869	0.09
870	0.09
871	0.1
872	0.1
873	0.14
874	0.22
875	0.26
876	0.31
877	0.33
878	0.35
879	0.36
880	0.36
881	0.33
882	0.24
883	0.19
884	0.13
885	0.11
886	0.08
887	0.06
888	0.05
889	0.05
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.05
895	0.05
896	0.06
897	0.09
898	0.09
899	0.1
900	0.11
901	0.15
902	0.15
903	0.17
904	0.17
905	0.17
906	0.21
907	0.23
908	0.26
909	0.29
910	0.34
911	0.4
912	0.43
913	0.43
914	0.44
915	0.42
916	0.41
917	0.35
918	0.29
919	0.23
920	0.19
921	0.17
922	0.12
923	0.12
924	0.1
925	0.1
926	0.11
927	0.11
928	0.15
929	0.14
930	0.15
931	0.15
932	0.16
933	0.15
934	0.15
935	0.15
936	0.14
937	0.14
938	0.14
939	0.14
940	0.13
941	0.13
942	0.12
943	0.11
944	0.08
945	0.07
946	0.09
947	0.1
948	0.1
949	0.1
950	0.1
951	0.13
952	0.16
953	0.18
954	0.2
955	0.18
956	0.18
957	0.19
958	0.21
959	0.19
960	0.17
961	0.16
962	0.15
963	0.14
964	0.15
965	0.14
966	0.12
967	0.11
968	0.1
969	0.09
970	0.08
971	0.07
972	0.07
973	0.09
974	0.12
975	0.12
976	0.14
977	0.14
978	0.16
979	0.17
980	0.17
981	0.16
982	0.14
983	0.14
984	0.12
985	0.13
986	0.11
987	0.13
988	0.12
989	0.11
990	0.1
991	0.11
992	0.13
993	0.12
994	0.11
995	0.14
996	0.19
997	0.22
998	0.22
999	0.22
1000	0.21
1001	0.22
1002	0.26
1003	0.25
1004	0.19
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.18
1008	0.19
1009	0.18
1010	0.14
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.1
1014	0.11
1015	0.09
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.09
1021	0.13
1022	0.11
1023	0.12
1024	0.12
1025	0.13
1026	0.14
1027	0.23
1028	0.28
1029	0.27
1030	0.35
1031	0.39
1032	0.45
1033	0.5
1034	0.53
1035	0.52
1036	0.58
1037	0.62
1038	0.62
1039	0.66
1040	0.66
1041	0.65
1042	0.62
1043	0.59
1044	0.57
1045	0.54
1046	0.49
1047	0.4
1048	0.35
1049	0.31
1050	0.29
1051	0.25
1052	0.19
1053	0.19
1054	0.2
1055	0.21
1056	0.22
1057	0.24
1058	0.23
1059	0.24
1060	0.24
1061	0.26
1062	0.26
1063	0.29
1064	0.31
1065	0.29
1066	0.31
1067	0.3
1068	0.28
1069	0.24
1070	0.23
1071	0.17
1072	0.14
1073	0.13
1074	0.12

Q5AFD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer