Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M9ME18

Protein Details
Accession M9ME18    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-84VYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHHydrophilic
445-469NASAAKKPPSKKKKKAQREKEEAEAHydrophilic
487-515AAAAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKEBasic
529-551AAAAKGSKPKSKKKQKEEAAAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
447-570SAAKKPPSKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAAKKKAEEEAAAAAAAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKEKAEREEKERKEKEAAAAKGSKPKSKKKQKEEAAAAAAAAATKSPAKGGKAAAAAA
578-626AAPSSPGKDKKGSPKKAAGKKPAGSAAATTPAPASATKKKTPAKADKKG
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9.5, cyto_mito 8.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MTTHFIISGSQTRLSETRLDGHVRLRSRHNDQSRSASDSSDRRGRWPSASNMATTASVYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHNNHFRFERQNGMFLFDSPVKAFLGFIRDQKVPADLIDVLTESGIKFFEGCLLVDVHDHRSHAAASASPLGPRELMGMSAADLFRSRDTRDPMSSSALGFDAEGGLASSLFYLQEGGRYGARKLLGGTSSSDPRGGGAGGVEIYRIVLHPTSETLWADIKMLDDMAGGMWTDQEALEVEAKILALTAPPLCLTPDPQATRIANLMLSATALPSAYSPSQDSPFRSSKKRGANSIEMEREEMDRQRREKIMRLMQHGHKGALHAGAASGMMPGAGRSGSAAMDPSAMLNAQGASASAAAATAFVPTFGRMGFIERWRMGRNAAMGPIPGGPAPGAAPGAANGAPGAAGKKDTKNDKEDADAGNASAAKKPPSKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAAKKKAEEEAAAAAAAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKEKAEREEKERKEKEAAAAKGSKPKSKKKQKEEAAAAAAAAATKSPAKGGKAAAAAAAANGTDAAAPSSPGKDKKGSPKKAAGKKPAGSAAATTPAPASATKKKTPAKADKKGANANSTPAGSAGGAYGAADAGVNGAAAAAMQGTPILGSATPSVQSTPTPAHRSIPSQPQQGQMQAQTTPQMQQQQLTQQQLQQAALAGMFPNMQAQQMGFNNMGFGLPMMNGQMGGFPATSNAQNTAAALAAMQGMGMNQFGNANNGMLNFGAGGNMANLGQMQQMMGLMGGGFNGMPFAGQQQGQQQGQQPGQQGQQGTGDMPVGVGLAGLANWGTGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.28
4 0.3
5 0.31
6 0.36
7 0.34
8 0.39
9 0.44
10 0.44
11 0.46
12 0.49
13 0.53
14 0.57
15 0.65
16 0.68
17 0.68
18 0.68
19 0.73
20 0.68
21 0.67
22 0.59
23 0.51
24 0.48
25 0.47
26 0.5
27 0.48
28 0.45
29 0.44
30 0.5
31 0.51
32 0.51
33 0.52
34 0.51
35 0.52
36 0.53
37 0.49
38 0.43
39 0.41
40 0.35
41 0.29
42 0.23
43 0.15
44 0.17
45 0.16
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.24
50 0.27
51 0.32
52 0.37
53 0.46
54 0.54
55 0.62
56 0.7
57 0.78
58 0.83
59 0.87
60 0.89
61 0.89
62 0.89
63 0.88
64 0.85
65 0.82
66 0.79
67 0.77
68 0.74
69 0.72
70 0.69
71 0.66
72 0.59
73 0.55
74 0.5
75 0.45
76 0.44
77 0.39
78 0.42
79 0.37
80 0.42
81 0.38
82 0.41
83 0.39
84 0.33
85 0.35
86 0.27
87 0.27
88 0.21
89 0.22
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.13
94 0.18
95 0.18
96 0.21
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.21
103 0.18
104 0.18
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.12
135 0.13
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.13
155 0.15
156 0.17
157 0.21
158 0.27
159 0.32
160 0.35
161 0.37
162 0.37
163 0.4
164 0.38
165 0.31
166 0.27
167 0.22
168 0.18
169 0.14
170 0.12
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.08
185 0.09
186 0.11
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.18
195 0.17
196 0.16
197 0.2
198 0.2
199 0.22
200 0.22
201 0.22
202 0.18
203 0.17
204 0.17
205 0.13
206 0.1
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.1
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.1
263 0.13
264 0.2
265 0.22
266 0.23
267 0.28
268 0.27
269 0.28
270 0.26
271 0.23
272 0.15
273 0.14
274 0.12
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.12
288 0.15
289 0.18
290 0.2
291 0.24
292 0.31
293 0.34
294 0.38
295 0.42
296 0.47
297 0.54
298 0.56
299 0.57
300 0.56
301 0.59
302 0.58
303 0.59
304 0.54
305 0.44
306 0.41
307 0.35
308 0.3
309 0.25
310 0.24
311 0.24
312 0.26
313 0.28
314 0.31
315 0.35
316 0.37
317 0.42
318 0.46
319 0.47
320 0.47
321 0.52
322 0.54
323 0.53
324 0.58
325 0.51
326 0.43
327 0.36
328 0.31
329 0.26
330 0.2
331 0.16
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.04
377 0.06
378 0.05
379 0.09
380 0.12
381 0.13
382 0.17
383 0.18
384 0.2
385 0.21
386 0.22
387 0.19
388 0.18
389 0.18
390 0.15
391 0.15
392 0.13
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.07
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.05
417 0.07
418 0.1
419 0.15
420 0.21
421 0.25
422 0.28
423 0.3
424 0.3
425 0.3
426 0.3
427 0.27
428 0.23
429 0.19
430 0.15
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.18
438 0.24
439 0.33
440 0.44
441 0.55
442 0.62
443 0.72
444 0.8
445 0.86
446 0.91
447 0.92
448 0.92
449 0.91
450 0.84
451 0.79
452 0.7
453 0.59
454 0.48
455 0.37
456 0.26
457 0.15
458 0.12
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.09
467 0.1
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.11
478 0.13
479 0.17
480 0.22
481 0.3
482 0.4
483 0.5
484 0.6
485 0.68
486 0.76
487 0.82
488 0.88
489 0.9
490 0.9
491 0.9
492 0.89
493 0.89
494 0.86
495 0.81
496 0.81
497 0.79
498 0.78
499 0.78
500 0.74
501 0.71
502 0.7
503 0.69
504 0.68
505 0.64
506 0.61
507 0.61
508 0.61
509 0.63
510 0.59
511 0.57
512 0.53
513 0.51
514 0.51
515 0.49
516 0.45
517 0.39
518 0.41
519 0.39
520 0.43
521 0.43
522 0.42
523 0.41
524 0.5
525 0.56
526 0.63
527 0.71
528 0.73
529 0.82
530 0.84
531 0.87
532 0.83
533 0.77
534 0.68
535 0.57
536 0.47
537 0.36
538 0.27
539 0.17
540 0.11
541 0.06
542 0.04
543 0.04
544 0.05
545 0.06
546 0.09
547 0.1
548 0.13
549 0.14
550 0.18
551 0.18
552 0.18
553 0.16
554 0.14
555 0.13
556 0.1
557 0.09
558 0.05
559 0.04
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.06
568 0.08
569 0.13
570 0.15
571 0.19
572 0.22
573 0.28
574 0.38
575 0.49
576 0.54
577 0.57
578 0.64
579 0.71
580 0.76
581 0.8
582 0.78
583 0.76
584 0.71
585 0.68
586 0.63
587 0.54
588 0.45
589 0.37
590 0.29
591 0.24
592 0.21
593 0.17
594 0.13
595 0.12
596 0.12
597 0.12
598 0.16
599 0.21
600 0.28
601 0.31
602 0.4
603 0.45
604 0.51
605 0.6
606 0.66
607 0.68
608 0.72
609 0.77
610 0.74
611 0.76
612 0.76
613 0.69
614 0.64
615 0.54
616 0.47
617 0.41
618 0.35
619 0.28
620 0.2
621 0.18
622 0.12
623 0.11
624 0.08
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.04
630 0.04
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.02
639 0.02
640 0.03
641 0.02
642 0.02
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.04
649 0.04
650 0.05
651 0.06
652 0.07
653 0.08
654 0.09
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.12
659 0.17
660 0.23
661 0.27
662 0.28
663 0.31
664 0.33
665 0.38
666 0.42
667 0.47
668 0.46
669 0.49
670 0.5
671 0.52
672 0.52
673 0.5
674 0.47
675 0.39
676 0.35
677 0.28
678 0.27
679 0.24
680 0.23
681 0.21
682 0.22
683 0.26
684 0.24
685 0.25
686 0.28
687 0.34
688 0.39
689 0.42
690 0.4
691 0.36
692 0.39
693 0.4
694 0.37
695 0.28
696 0.23
697 0.17
698 0.15
699 0.13
700 0.09
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.14
710 0.15
711 0.18
712 0.17
713 0.16
714 0.16
715 0.16
716 0.15
717 0.09
718 0.08
719 0.06
720 0.05
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.07
727 0.07
728 0.08
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.1
733 0.12
734 0.13
735 0.14
736 0.15
737 0.15
738 0.15
739 0.14
740 0.12
741 0.1
742 0.09
743 0.07
744 0.06
745 0.05
746 0.05
747 0.04
748 0.04
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.07
754 0.08
755 0.1
756 0.11
757 0.11
758 0.11
759 0.12
760 0.12
761 0.1
762 0.1
763 0.08
764 0.07
765 0.07
766 0.06
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.06
771 0.05
772 0.06
773 0.06
774 0.07
775 0.07
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.05
782 0.04
783 0.04
784 0.04
785 0.04
786 0.04
787 0.03
788 0.04
789 0.03
790 0.04
791 0.04
792 0.06
793 0.09
794 0.1
795 0.13
796 0.19
797 0.27
798 0.28
799 0.31
800 0.36
801 0.4
802 0.42
803 0.44
804 0.42
805 0.39
806 0.41
807 0.41
808 0.35
809 0.3
810 0.3
811 0.27
812 0.23
813 0.2
814 0.17
815 0.13
816 0.12
817 0.1
818 0.07
819 0.06
820 0.05
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04