FuNGI

M9LV41

Protein Details

Accession

M9LV41

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
395-420	PAEPASKKAKKGKRHRTKEKLAAIDA	Basic
429-456	IEAASKEPSKREKKGRQRKGKGRADGVD	Basic
494-513	ARNPKQAGGRPAKKKPDAKA	Basic
525-551	AEGDGSTRKKPPRRKGGAKASTKPPSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
130-142	SKKPARRDAAKPV
365-385	ALAKKAKKAERAAAKAAARSA
396-451	AEPASKKAKKGKRHRTKEKLAAIDAAHVGGGKEIEAASKEPSKREKKGRQRKGKGR
494-513	ARNPKQAGGRPAKKKPDAKA
531-547	TRKKPPRRKGGAKASTK

Subcellular Location(s)

mito 18, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MTWRHFRAPKLFSRRAGVGAQAPPTCLDPEQRAIHLYALRPRPPALRPQLRWPCVSTMSPSETPASLADTQPPRAKQAANEQKAADNRARAQQNRERAANNRTQKPSASDQDGQHPAPKAPPTSASAQPSKKPARRDAAKPVATRQGKASTHFKSKVVIRRLPPNLPEAVFWKAVSPWIRDAADCQPPASDSLTSSSGEASASTSSASALTPTVDFKQFIPGKLKTDASKQNKHARAYVRFLDANALVLFHKHFDGHIFRDSKARETVAIVEFAPYQKVVPARGRRSKPDPKQGTIETDADYLAFVERLSKAGEDDKRAEGDLLASTYDPRERAREREAAAAAGKSTPLLEHLRAVKQAKLESAALAKKAKKAERAAAKAAARSADGAAATATQPAEPASKKAKKGKRHRTKEKLAAIDAAHVGGGKEIEAASKEPSKREKKGRQRKGKGRADGVDANAANTDTAPRATTKPESAKKQGNPAKDAPNTATATPARNPKQAGGRPAKKKPDAKAPAAENNADAGVAEGDGSTRKKPPRRKGGAKASTKPPSASTATASASQPKLQILKREPAP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.59
3	0.53
4	0.47
5	0.43
6	0.4
7	0.41
8	0.35
9	0.33
10	0.3
11	0.31
12	0.29
13	0.24
14	0.24
15	0.23
16	0.3
17	0.32
18	0.33
19	0.33
20	0.32
21	0.35
22	0.34
23	0.34
24	0.35
25	0.4
26	0.42
27	0.42
28	0.44
29	0.45
30	0.45
31	0.5
32	0.53
33	0.55
34	0.56
35	0.64
36	0.72
37	0.7
38	0.7
39	0.63
40	0.57
41	0.51
42	0.49
43	0.43
44	0.38
45	0.41
46	0.39
47	0.38
48	0.34
49	0.3
50	0.29
51	0.25
52	0.24
53	0.19
54	0.18
55	0.24
56	0.26
57	0.31
58	0.36
59	0.37
60	0.36
61	0.38
62	0.39
63	0.36
64	0.44
65	0.5
66	0.48
67	0.5
68	0.47
69	0.49
70	0.5
71	0.5
72	0.43
73	0.37
74	0.36
75	0.4
76	0.47
77	0.45
78	0.51
79	0.54
80	0.6
81	0.61
82	0.62
83	0.57
84	0.56
85	0.59
86	0.59
87	0.61
88	0.6
89	0.59
90	0.57
91	0.56
92	0.55
93	0.56
94	0.53
95	0.51
96	0.48
97	0.44
98	0.5
99	0.53
100	0.48
101	0.45
102	0.41
103	0.34
104	0.34
105	0.35
106	0.29
107	0.26
108	0.27
109	0.26
110	0.3
111	0.34
112	0.35
113	0.39
114	0.41
115	0.43
116	0.49
117	0.56
118	0.55
119	0.57
120	0.6
121	0.62
122	0.65
123	0.68
124	0.7
125	0.71
126	0.72
127	0.67
128	0.63
129	0.63
130	0.57
131	0.51
132	0.45
133	0.43
134	0.38
135	0.41
136	0.45
137	0.41
138	0.48
139	0.5
140	0.46
141	0.43
142	0.48
143	0.52
144	0.52
145	0.53
146	0.48
147	0.55
148	0.6
149	0.59
150	0.54
151	0.48
152	0.43
153	0.37
154	0.34
155	0.27
156	0.26
157	0.22
158	0.2
159	0.18
160	0.15
161	0.19
162	0.21
163	0.2
164	0.19
165	0.22
166	0.23
167	0.22
168	0.25
169	0.26
170	0.3
171	0.27
172	0.25
173	0.21
174	0.21
175	0.23
176	0.21
177	0.16
178	0.1
179	0.12
180	0.14
181	0.14
182	0.13
183	0.12
184	0.1
185	0.1
186	0.09
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.12
203	0.11
204	0.21
205	0.22
206	0.24
207	0.29
208	0.29
209	0.31
210	0.33
211	0.35
212	0.27
213	0.33
214	0.4
215	0.42
216	0.48
217	0.51
218	0.58
219	0.62
220	0.62
221	0.6
222	0.58
223	0.55
224	0.52
225	0.48
226	0.42
227	0.36
228	0.34
229	0.31
230	0.24
231	0.2
232	0.15
233	0.12
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.07
238	0.08
239	0.06
240	0.06
241	0.09
242	0.12
243	0.14
244	0.2
245	0.21
246	0.22
247	0.27
248	0.28
249	0.27
250	0.26
251	0.24
252	0.18
253	0.17
254	0.2
255	0.16
256	0.16
257	0.13
258	0.12
259	0.12
260	0.11
261	0.11
262	0.07
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.11
267	0.18
268	0.25
269	0.33
270	0.42
271	0.45
272	0.48
273	0.56
274	0.63
275	0.64
276	0.67
277	0.64
278	0.58
279	0.61
280	0.57
281	0.52
282	0.45
283	0.38
284	0.28
285	0.23
286	0.2
287	0.15
288	0.13
289	0.09
290	0.06
291	0.05
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.13
300	0.16
301	0.18
302	0.2
303	0.21
304	0.21
305	0.21
306	0.2
307	0.14
308	0.13
309	0.1
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.15
319	0.17
320	0.21
321	0.26
322	0.31
323	0.31
324	0.35
325	0.34
326	0.29
327	0.28
328	0.23
329	0.19
330	0.14
331	0.12
332	0.07
333	0.07
334	0.05
335	0.08
336	0.1
337	0.1
338	0.13
339	0.17
340	0.19
341	0.23
342	0.25
343	0.23
344	0.24
345	0.24
346	0.22
347	0.21
348	0.2
349	0.16
350	0.19
351	0.19
352	0.19
353	0.22
354	0.23
355	0.25
356	0.31
357	0.34
358	0.37
359	0.39
360	0.45
361	0.49
362	0.52
363	0.52
364	0.51
365	0.49
366	0.43
367	0.4
368	0.32
369	0.23
370	0.19
371	0.16
372	0.11
373	0.09
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.1
384	0.1
385	0.15
386	0.23
387	0.29
388	0.36
389	0.46
390	0.53
391	0.6
392	0.71
393	0.78
394	0.8
395	0.85
396	0.9
397	0.9
398	0.92
399	0.92
400	0.89
401	0.82
402	0.73
403	0.65
404	0.54
405	0.46
406	0.36
407	0.26
408	0.18
409	0.13
410	0.11
411	0.07
412	0.07
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.11
420	0.17
421	0.19
422	0.24
423	0.34
424	0.41
425	0.49
426	0.59
427	0.66
428	0.71
429	0.81
430	0.87
431	0.89
432	0.92
433	0.93
434	0.93
435	0.92
436	0.89
437	0.85
438	0.77
439	0.72
440	0.65
441	0.56
442	0.51
443	0.41
444	0.34
445	0.27
446	0.24
447	0.17
448	0.13
449	0.13
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.11
454	0.13
455	0.18
456	0.22
457	0.28
458	0.37
459	0.44
460	0.51
461	0.56
462	0.63
463	0.62
464	0.69
465	0.68
466	0.64
467	0.63
468	0.61
469	0.62
470	0.56
471	0.56
472	0.47
473	0.48
474	0.44
475	0.38
476	0.37
477	0.3
478	0.31
479	0.33
480	0.4
481	0.38
482	0.4
483	0.42
484	0.42
485	0.5
486	0.52
487	0.57
488	0.58
489	0.63
490	0.68
491	0.75
492	0.8
493	0.79
494	0.81
495	0.77
496	0.78
497	0.76
498	0.73
499	0.72
500	0.69
501	0.68
502	0.65
503	0.59
504	0.48
505	0.41
506	0.35
507	0.26
508	0.19
509	0.12
510	0.08
511	0.07
512	0.06
513	0.05
514	0.05
515	0.1
516	0.12
517	0.14
518	0.22
519	0.31
520	0.41
521	0.51
522	0.62
523	0.69
524	0.78
525	0.86
526	0.89
527	0.91
528	0.92
529	0.91
530	0.89
531	0.87
532	0.84
533	0.77
534	0.68
535	0.59
536	0.54
537	0.49
538	0.43
539	0.36
540	0.32
541	0.32
542	0.34
543	0.33
544	0.34
545	0.32
546	0.33
547	0.31
548	0.31
549	0.36
550	0.37
551	0.45
552	0.44

M9LV41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer