FuNGI

M9M1Y6

Protein Details

Accession

M9M1Y6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
39-61	ADEHRNPPRPRAKKARGGRELGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
41-57	EHRNPPRPRAKKARGGR

Subcellular Location(s)

nucl 7.5, extr 7, pero 7, cyto_nucl 5.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001529 DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu IPR008551 TANGO2 IPR034014 Zn_ribbon_RPC11_C IPR001222 Znf_TFIIS
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0042779 P:tRNA 3'-trailer cleavage
Pfam	View protein in Pfam PF02150 RNA_POL_M_15KD PF05742 TANGO2 PF01096 TFIIS_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51133 ZF_TFIIS_2
CDD	cd10509 Zn-ribbon_RPC11

Amino Acid Sequences

MSHILTVAVDAGDRARALVLLASLGGLPTKPERLGAKQADEHRNPPRPRAKKARGGRELGLGLDAQLPPGRNALGKQRENEMLFCPTCANCLIIQLDDQGNNKWSCHTCPYEFPIVRQMTTRLHLKRKEVDDVMGGEESWKNVDSTDAPCPKCENPKAFFMQLQIRSADEPRWRMCVIFWTVSDAHYDLVIASNRDEFLARPTLPASWHAFDLDSEARILSARDASGGGTWLGVTRSGAFATLTNFTEATPELPPGMERFESRGQLVRDWLLSSHPFPQTRQEVEKDIQQYLNNVGDKLQSFPGFNLLVGKVSKQGTVLGYITNRDSQGELAKPQPKIFDPPKIERVRMCRGMSNSILDQPWPKVHTGSQAFDAALARASTAPDQEQLIADLFSVLAFSSNPTQRSELRNSILIPPVQLPTPAGDGDWYATRTSTVILIAKDGRATFVERDIHTLNHNIPTEIPPGQAQRSFTWNLLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.08
4	0.08
5	0.09
6	0.08
7	0.07
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.07
13	0.06
14	0.08
15	0.11
16	0.14
17	0.14
18	0.19
19	0.24
20	0.3
21	0.4
22	0.43
23	0.46
24	0.5
25	0.59
26	0.64
27	0.63
28	0.65
29	0.65
30	0.69
31	0.66
32	0.69
33	0.7
34	0.68
35	0.74
36	0.78
37	0.78
38	0.78
39	0.85
40	0.86
41	0.84
42	0.82
43	0.74
44	0.69
45	0.6
46	0.5
47	0.41
48	0.3
49	0.22
50	0.2
51	0.17
52	0.12
53	0.13
54	0.14
55	0.14
56	0.15
57	0.15
58	0.14
59	0.16
60	0.25
61	0.33
62	0.36
63	0.38
64	0.41
65	0.47
66	0.47
67	0.47
68	0.4
69	0.37
70	0.32
71	0.31
72	0.28
73	0.22
74	0.22
75	0.2
76	0.19
77	0.12
78	0.15
79	0.15
80	0.14
81	0.14
82	0.16
83	0.17
84	0.18
85	0.19
86	0.18
87	0.22
88	0.22
89	0.22
90	0.24
91	0.24
92	0.26
93	0.31
94	0.34
95	0.32
96	0.36
97	0.41
98	0.47
99	0.45
100	0.42
101	0.45
102	0.41
103	0.39
104	0.35
105	0.34
106	0.27
107	0.3
108	0.37
109	0.35
110	0.42
111	0.46
112	0.5
113	0.55
114	0.56
115	0.58
116	0.52
117	0.46
118	0.4
119	0.37
120	0.32
121	0.24
122	0.2
123	0.15
124	0.13
125	0.12
126	0.1
127	0.09
128	0.08
129	0.07
130	0.09
131	0.1
132	0.13
133	0.22
134	0.28
135	0.28
136	0.29
137	0.33
138	0.35
139	0.42
140	0.45
141	0.43
142	0.39
143	0.44
144	0.47
145	0.46
146	0.43
147	0.38
148	0.39
149	0.35
150	0.34
151	0.28
152	0.25
153	0.24
154	0.24
155	0.26
156	0.22
157	0.24
158	0.24
159	0.27
160	0.27
161	0.25
162	0.24
163	0.25
164	0.25
165	0.23
166	0.21
167	0.22
168	0.22
169	0.22
170	0.23
171	0.17
172	0.13
173	0.11
174	0.11
175	0.06
176	0.08
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.07
185	0.1
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.15
191	0.15
192	0.18
193	0.19
194	0.15
195	0.15
196	0.15
197	0.14
198	0.13
199	0.16
200	0.14
201	0.1
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.05
208	0.06
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.07
229	0.09
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.12
247	0.15
248	0.16
249	0.17
250	0.21
251	0.2
252	0.2
253	0.21
254	0.17
255	0.15
256	0.15
257	0.14
258	0.11
259	0.12
260	0.12
261	0.16
262	0.19
263	0.2
264	0.2
265	0.27
266	0.29
267	0.32
268	0.34
269	0.31
270	0.32
271	0.32
272	0.36
273	0.31
274	0.28
275	0.26
276	0.23
277	0.22
278	0.2
279	0.24
280	0.19
281	0.17
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.17
286	0.17
287	0.13
288	0.13
289	0.14
290	0.17
291	0.15
292	0.14
293	0.14
294	0.12
295	0.13
296	0.13
297	0.13
298	0.14
299	0.14
300	0.15
301	0.13
302	0.15
303	0.13
304	0.15
305	0.15
306	0.13
307	0.13
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.13
313	0.13
314	0.12
315	0.16
316	0.16
317	0.17
318	0.22
319	0.27
320	0.28
321	0.29
322	0.3
323	0.28
324	0.34
325	0.36
326	0.39
327	0.41
328	0.46
329	0.55
330	0.56
331	0.56
332	0.53
333	0.55
334	0.55
335	0.55
336	0.5
337	0.46
338	0.45
339	0.48
340	0.45
341	0.41
342	0.34
343	0.3
344	0.29
345	0.24
346	0.24
347	0.21
348	0.24
349	0.22
350	0.21
351	0.2
352	0.21
353	0.29
354	0.31
355	0.3
356	0.29
357	0.29
358	0.27
359	0.27
360	0.26
361	0.17
362	0.14
363	0.11
364	0.09
365	0.08
366	0.1
367	0.1
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.13
376	0.11
377	0.1
378	0.08
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.06
386	0.13
387	0.18
388	0.19
389	0.22
390	0.25
391	0.3
392	0.37
393	0.42
394	0.42
395	0.42
396	0.44
397	0.43
398	0.44
399	0.44
400	0.38
401	0.32
402	0.28
403	0.26
404	0.23
405	0.22
406	0.18
407	0.15
408	0.17
409	0.15
410	0.13
411	0.12
412	0.12
413	0.14
414	0.16
415	0.15
416	0.13
417	0.13
418	0.13
419	0.13
420	0.13
421	0.12
422	0.12
423	0.15
424	0.15
425	0.18
426	0.2
427	0.21
428	0.22
429	0.21
430	0.2
431	0.18
432	0.21
433	0.19
434	0.24
435	0.29
436	0.27
437	0.32
438	0.32
439	0.32
440	0.32
441	0.34
442	0.31
443	0.33
444	0.33
445	0.29
446	0.29
447	0.3
448	0.32
449	0.28
450	0.27
451	0.23
452	0.27
453	0.32
454	0.33
455	0.33
456	0.32
457	0.37
458	0.38

M9M1Y6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer