Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M9MCP1

Protein Details
Accession M9MCP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-34KGGKGGNAKVEPKKQRRRPSAIHPPSLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-27RAKGGKGGNAKVEPKKQRRRPSA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR002119  Histone_H2A  
IPR007125  Histone_H2A/H2B/H3  
IPR032454  Histone_H2A_C  
Gene Ontology GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0030527  F:structural constituent of chromatin  
Pfam View protein in Pfam  
PF00125  Histone  
PF16211  Histone_H2A_C  
CDD cd00074  H2A  
Amino Acid Sequences MSDPRAKGGKGGNAKVEPKKQRRRPSAIHPPSLGSYAGRARNRPCANLGHRSAAVLAPEISFRLSGSCVMPSIHPASTRRSGASCLGDASLVQASPLEPVARARGRSDASKSTQERRRPSKSDTSDSVFMHGCCHLVARIDAGRSTWDGICDVRPSAERNGVDGDKAFSTRPDDAELEAARGFGLVRLAAVVFGVLQRLGNADFIHLTNISARLRTPFLDRMQFPVGRIHRHLKNRTQNHIRIGSKAAVYTSAILEYLTAEVLELAGNASKDLRVKRITPRHLQLAIRGDEELDSLVRATIAGGGVLPHIHKTLIKAPSKKKASAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.67
4 0.69
5 0.71
6 0.78
7 0.8
8 0.85
9 0.88
10 0.89
11 0.88
12 0.88
13 0.88
14 0.87
15 0.83
16 0.74
17 0.67
18 0.59
19 0.53
20 0.43
21 0.31
22 0.27
23 0.26
24 0.33
25 0.34
26 0.37
27 0.39
28 0.48
29 0.51
30 0.5
31 0.46
32 0.48
33 0.5
34 0.55
35 0.54
36 0.49
37 0.46
38 0.43
39 0.4
40 0.32
41 0.26
42 0.19
43 0.16
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.15
59 0.17
60 0.17
61 0.19
62 0.2
63 0.25
64 0.3
65 0.32
66 0.3
67 0.28
68 0.29
69 0.3
70 0.31
71 0.26
72 0.21
73 0.19
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.11
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.14
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.22
92 0.24
93 0.27
94 0.31
95 0.3
96 0.32
97 0.39
98 0.42
99 0.46
100 0.52
101 0.56
102 0.6
103 0.63
104 0.67
105 0.64
106 0.66
107 0.68
108 0.67
109 0.65
110 0.6
111 0.56
112 0.52
113 0.47
114 0.43
115 0.34
116 0.28
117 0.23
118 0.19
119 0.14
120 0.09
121 0.1
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.12
143 0.13
144 0.18
145 0.16
146 0.17
147 0.2
148 0.19
149 0.18
150 0.15
151 0.15
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.07
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.18
204 0.21
205 0.24
206 0.3
207 0.3
208 0.33
209 0.36
210 0.36
211 0.32
212 0.35
213 0.34
214 0.32
215 0.36
216 0.38
217 0.41
218 0.5
219 0.56
220 0.57
221 0.65
222 0.68
223 0.74
224 0.76
225 0.74
226 0.71
227 0.73
228 0.64
229 0.56
230 0.52
231 0.46
232 0.37
233 0.32
234 0.25
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.13
259 0.16
260 0.22
261 0.24
262 0.29
263 0.39
264 0.49
265 0.56
266 0.6
267 0.64
268 0.66
269 0.68
270 0.65
271 0.61
272 0.59
273 0.53
274 0.45
275 0.39
276 0.31
277 0.25
278 0.24
279 0.18
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.17
300 0.24
301 0.32
302 0.4
303 0.48
304 0.56
305 0.65
306 0.71
307 0.7