FuNGI

M9LV85

Protein Details

Accession

M9LV85

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
546-572	SWDSRTTRPRNAPRRKVKTPKTNRYGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
555-563	RNAPRRKVK

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, mito 4, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MSQVQAPLGGGYPQSPDPTLSDPRWLQQLASHPIFTPRQESSGTSTASNDQQIAGSHARLMVVRGTDLIVAVDNEVRIASLVDAKSSAATPAALASRSSSLGATSSTSYKVLVPAQGPAIDFEIQHLSLNPTGKLLACVGASQITLLVMPRSGYTKHVDRTVACRAVPIAPYYHSAHSDAAVAKVDWHPWGESGTSLLVLTDDGLLREYDVAKDTEEPQQTASFLPIQPTSNAQRSRSRSATPNLATHNRSSSPIASRSSSNFGASGGFGLSAEDDDATTAVSFALCVNEASLARPTAFDQDDDGAWAAAASRSQGPTDWSPLTVFGLMKNGDVWAICPFLPKSAVVPAAYIHDLAKLASHHANTVESEQTSSVDTQLRYVNALLKQASQGIAKRSRSTISNGRQMSVTPGPESFARSRSTSTMDLDQLVDPQEAHADDSQVDMDAVQDGPIRLHPPSWSYRQDVRQGGSAKRAPRPQGPFLLRPAPVELCEERETVACDIVWTWLTDECAERTDSTTVSGVGALSIVGHDGRVDVGLLFESVQGSWDSRTTRPRNAPRRKVKTPKTNRYGLSDTEDEADELEALTLDDPEELPSLLIYETIDLGLLDTAVENGCKSHAEASDLLLDTSARNRPTFVRDPLYGDTLYVYHAFGAQCLGFATWTSKLIQALNMASQDELDNDAHADASSATAESREQALTKVLHRGEKTEVVWVVNTAAPGTGKGRNMLEMNPVTAVAILSDVYLSYAFLAVTADLQLVGVELSLRVEHDGADSPPAMAQELGLSESRLPKPYVSLLGEGPAFQPPAVFAAGSGVQGLSSHPRRAAMAGASKGEVQVTPDTLRALGKTVESYRHEIREVVSAGNEVQARLDLQVREMTRQLSKLDQIRARCAALGSGDGPSVLGERVARLASTQVALVGRIDRALQRLMDSHQPSISVYERRWFDELERIAADVGIARTSSGELKPDTHARKGIAAKADRLAHQLALLRPQMDVLAGPPANERALLGADQLRKVENLLAAQATMLAEAKAKVANLSARMAQNPARQPSVAVDADLSIASIYSSPSGVPSGLPHSSTLANLASPSSFRSRTPSSFFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.18
4	0.2
5	0.26
6	0.32
7	0.3
8	0.36
9	0.36
10	0.38
11	0.43
12	0.4
13	0.34
14	0.32
15	0.4
16	0.4
17	0.41
18	0.4
19	0.34
20	0.4
21	0.43
22	0.4
23	0.37
24	0.3
25	0.3
26	0.31
27	0.32
28	0.33
29	0.36
30	0.35
31	0.3
32	0.3
33	0.31
34	0.33
35	0.32
36	0.26
37	0.2
38	0.2
39	0.2
40	0.23
41	0.22
42	0.19
43	0.18
44	0.18
45	0.18
46	0.17
47	0.18
48	0.16
49	0.14
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.13
54	0.13
55	0.12
56	0.09
57	0.09
58	0.09
59	0.1
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.08
64	0.07
65	0.08
66	0.08
67	0.12
68	0.13
69	0.13
70	0.14
71	0.14
72	0.15
73	0.15
74	0.14
75	0.09
76	0.09
77	0.08
78	0.11
79	0.13
80	0.12
81	0.12
82	0.14
83	0.15
84	0.16
85	0.17
86	0.14
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.13
91	0.13
92	0.14
93	0.15
94	0.16
95	0.16
96	0.16
97	0.18
98	0.19
99	0.21
100	0.2
101	0.21
102	0.22
103	0.23
104	0.22
105	0.2
106	0.21
107	0.17
108	0.16
109	0.16
110	0.17
111	0.16
112	0.16
113	0.16
114	0.16
115	0.19
116	0.21
117	0.19
118	0.16
119	0.17
120	0.17
121	0.17
122	0.15
123	0.14
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.11
129	0.1
130	0.09
131	0.07
132	0.07
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.08
138	0.11
139	0.12
140	0.15
141	0.2
142	0.27
143	0.3
144	0.34
145	0.36
146	0.36
147	0.41
148	0.47
149	0.45
150	0.37
151	0.35
152	0.32
153	0.32
154	0.32
155	0.27
156	0.21
157	0.19
158	0.23
159	0.25
160	0.26
161	0.24
162	0.24
163	0.23
164	0.21
165	0.23
166	0.2
167	0.18
168	0.17
169	0.15
170	0.16
171	0.17
172	0.17
173	0.15
174	0.16
175	0.15
176	0.14
177	0.16
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.11
182	0.1
183	0.09
184	0.08
185	0.07
186	0.06
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.14
201	0.16
202	0.22
203	0.24
204	0.23
205	0.23
206	0.23
207	0.23
208	0.21
209	0.21
210	0.17
211	0.15
212	0.18
213	0.18
214	0.19
215	0.19
216	0.23
217	0.26
218	0.31
219	0.35
220	0.36
221	0.43
222	0.47
223	0.54
224	0.54
225	0.53
226	0.51
227	0.52
228	0.58
229	0.52
230	0.51
231	0.49
232	0.51
233	0.49
234	0.44
235	0.44
236	0.36
237	0.35
238	0.33
239	0.31
240	0.3
241	0.32
242	0.32
243	0.3
244	0.31
245	0.31
246	0.34
247	0.31
248	0.27
249	0.22
250	0.2
251	0.19
252	0.16
253	0.13
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.12
283	0.12
284	0.16
285	0.16
286	0.15
287	0.15
288	0.16
289	0.15
290	0.16
291	0.15
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.14
304	0.15
305	0.2
306	0.19
307	0.18
308	0.18
309	0.18
310	0.19
311	0.17
312	0.15
313	0.1
314	0.14
315	0.13
316	0.13
317	0.12
318	0.11
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.15
332	0.17
333	0.14
334	0.15
335	0.14
336	0.15
337	0.15
338	0.14
339	0.11
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.08
345	0.11
346	0.13
347	0.13
348	0.13
349	0.14
350	0.15
351	0.14
352	0.16
353	0.15
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.11
358	0.12
359	0.11
360	0.11
361	0.13
362	0.13
363	0.14
364	0.16
365	0.16
366	0.16
367	0.16
368	0.19
369	0.16
370	0.19
371	0.18
372	0.16
373	0.16
374	0.17
375	0.17
376	0.14
377	0.16
378	0.2
379	0.26
380	0.27
381	0.29
382	0.29
383	0.3
384	0.3
385	0.33
386	0.36
387	0.36
388	0.42
389	0.41
390	0.4
391	0.38
392	0.36
393	0.36
394	0.29
395	0.24
396	0.16
397	0.16
398	0.16
399	0.17
400	0.21
401	0.17
402	0.16
403	0.18
404	0.18
405	0.19
406	0.2
407	0.24
408	0.22
409	0.22
410	0.22
411	0.2
412	0.2
413	0.2
414	0.18
415	0.15
416	0.14
417	0.12
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.09
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.06
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.12
444	0.16
445	0.22
446	0.24
447	0.27
448	0.33
449	0.37
450	0.43
451	0.43
452	0.4
453	0.4
454	0.41
455	0.37
456	0.38
457	0.37
458	0.34
459	0.36
460	0.4
461	0.37
462	0.4
463	0.45
464	0.42
465	0.47
466	0.47
467	0.44
468	0.43
469	0.45
470	0.38
471	0.33
472	0.31
473	0.23
474	0.19
475	0.2
476	0.17
477	0.16
478	0.17
479	0.17
480	0.15
481	0.15
482	0.16
483	0.13
484	0.13
485	0.09
486	0.07
487	0.07
488	0.08
489	0.07
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.1
499	0.09
500	0.1
501	0.11
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.03
530	0.04
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.07
535	0.1
536	0.12
537	0.22
538	0.24
539	0.31
540	0.4
541	0.49
542	0.58
543	0.67
544	0.75
545	0.76
546	0.82
547	0.85
548	0.86
549	0.85
550	0.86
551	0.86
552	0.86
553	0.81
554	0.79
555	0.71
556	0.66
557	0.6
558	0.5
559	0.43
560	0.34
561	0.28
562	0.23
563	0.21
564	0.15
565	0.12
566	0.11
567	0.06
568	0.05
569	0.04
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.04
581	0.04
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.02
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.08
605	0.08
606	0.11
607	0.11
608	0.13
609	0.16
610	0.15
611	0.15
612	0.12
613	0.11
614	0.09
615	0.11
616	0.14
617	0.12
618	0.12
619	0.13
620	0.15
621	0.22
622	0.28
623	0.29
624	0.3
625	0.3
626	0.34
627	0.34
628	0.34
629	0.27
630	0.21
631	0.18
632	0.13
633	0.14
634	0.1
635	0.08
636	0.06
637	0.08
638	0.08
639	0.08
640	0.09
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.05
646	0.05
647	0.07
648	0.07
649	0.08
650	0.09
651	0.1
652	0.11
653	0.12
654	0.13
655	0.13
656	0.12
657	0.13
658	0.12
659	0.11
660	0.1
661	0.1
662	0.09
663	0.07
664	0.09
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.06
671	0.06
672	0.04
673	0.05
674	0.05
675	0.04
676	0.04
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.08
684	0.11
685	0.13
686	0.14
687	0.2
688	0.2
689	0.24
690	0.24
691	0.26
692	0.26
693	0.29
694	0.28
695	0.26
696	0.24
697	0.21
698	0.2
699	0.18
700	0.16
701	0.13
702	0.12
703	0.08
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.1
708	0.12
709	0.12
710	0.14
711	0.15
712	0.17
713	0.18
714	0.18
715	0.22
716	0.18
717	0.18
718	0.16
719	0.16
720	0.13
721	0.12
722	0.11
723	0.05
724	0.05
725	0.04
726	0.04
727	0.04
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.04
732	0.04
733	0.04
734	0.04
735	0.04
736	0.05
737	0.04
738	0.04
739	0.05
740	0.04
741	0.04
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.03
746	0.03
747	0.03
748	0.03
749	0.03
750	0.04
751	0.04
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.07
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.1
760	0.1
761	0.11
762	0.11
763	0.09
764	0.07
765	0.07
766	0.06
767	0.06
768	0.08
769	0.07
770	0.07
771	0.09
772	0.14
773	0.16
774	0.18
775	0.19
776	0.18
777	0.2
778	0.22
779	0.26
780	0.22
781	0.22
782	0.2
783	0.21
784	0.21
785	0.19
786	0.17
787	0.13
788	0.12
789	0.09
790	0.09
791	0.07
792	0.09
793	0.09
794	0.08
795	0.06
796	0.08
797	0.09
798	0.09
799	0.09
800	0.07
801	0.06
802	0.07
803	0.08
804	0.13
805	0.16
806	0.18
807	0.19
808	0.2
809	0.21
810	0.22
811	0.23
812	0.2
813	0.23
814	0.23
815	0.23
816	0.23
817	0.23
818	0.22
819	0.2
820	0.15
821	0.12
822	0.11
823	0.13
824	0.13
825	0.14
826	0.14
827	0.14
828	0.15
829	0.12
830	0.13
831	0.12
832	0.12
833	0.15
834	0.16
835	0.22
836	0.25
837	0.3
838	0.32
839	0.34
840	0.34
841	0.31
842	0.3
843	0.3
844	0.28
845	0.23
846	0.19
847	0.17
848	0.16
849	0.19
850	0.18
851	0.12
852	0.1
853	0.1
854	0.1
855	0.11
856	0.15
857	0.11
858	0.13
859	0.18
860	0.19
861	0.21
862	0.22
863	0.24
864	0.22
865	0.24
866	0.25
867	0.23
868	0.28
869	0.32
870	0.38
871	0.4
872	0.4
873	0.44
874	0.44
875	0.42
876	0.37
877	0.31
878	0.24
879	0.2
880	0.19
881	0.14
882	0.12
883	0.11
884	0.1
885	0.09
886	0.08
887	0.08
888	0.07
889	0.07
890	0.06
891	0.07
892	0.09
893	0.09
894	0.09
895	0.09
896	0.1
897	0.1
898	0.11
899	0.1
900	0.1
901	0.11
902	0.11
903	0.12
904	0.12
905	0.1
906	0.1
907	0.12
908	0.11
909	0.14
910	0.16
911	0.15
912	0.16
913	0.18
914	0.2
915	0.28
916	0.29
917	0.28
918	0.26
919	0.26
920	0.25
921	0.27
922	0.29
923	0.25
924	0.23
925	0.28
926	0.3
927	0.33
928	0.34
929	0.31
930	0.29
931	0.34
932	0.34
933	0.31
934	0.29
935	0.26
936	0.24
937	0.23
938	0.2
939	0.13
940	0.12
941	0.09
942	0.08
943	0.08
944	0.08
945	0.1
946	0.13
947	0.12
948	0.15
949	0.16
950	0.18
951	0.23
952	0.32
953	0.36
954	0.37
955	0.4
956	0.37
957	0.43
958	0.45
959	0.46
960	0.46
961	0.44
962	0.43
963	0.45
964	0.47
965	0.41
966	0.4
967	0.36
968	0.27
969	0.27
970	0.29
971	0.25
972	0.27
973	0.28
974	0.25
975	0.23
976	0.23
977	0.21
978	0.16
979	0.14
980	0.09
981	0.15
982	0.14
983	0.15
984	0.16
985	0.18
986	0.18
987	0.18
988	0.17
989	0.1
990	0.12
991	0.12
992	0.13
993	0.17
994	0.2
995	0.22
996	0.23
997	0.22
998	0.21
999	0.22
1000	0.22
1001	0.19
1002	0.17
1003	0.18
1004	0.17
1005	0.16
1006	0.15
1007	0.15
1008	0.12
1009	0.1
1010	0.09
1011	0.07
1012	0.08
1013	0.09
1014	0.1
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.14
1019	0.18
1020	0.19
1021	0.22
1022	0.25
1023	0.27
1024	0.28
1025	0.31
1026	0.34
1027	0.38
1028	0.43
1029	0.44
1030	0.43
1031	0.4
1032	0.4
1033	0.4
1034	0.41
1035	0.33
1036	0.26
1037	0.22
1038	0.19
1039	0.2
1040	0.18
1041	0.14
1042	0.07
1043	0.06
1044	0.06
1045	0.06
1046	0.06
1047	0.06
1048	0.07
1049	0.07
1050	0.09
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.13
1055	0.18
1056	0.19
1057	0.2
1058	0.2
1059	0.21
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.22
1063	0.17
1064	0.15
1065	0.15
1066	0.15
1067	0.13
1068	0.13
1069	0.17
1070	0.21
1071	0.22
1072	0.23
1073	0.3
1074	0.36
1075	0.41

M9LV85

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer